A lotta contru u virus COVID-19 cù dati

by Jan 17, 2022BI/Analitichemissaghji 0

Légales

 

Ùn saltate micca stu paràgrafu. Esitatu à vade in queste acque controverse, spessu pulitiche, ma un pensamentu hè vinutu à mè mentre caminava u mo cane, Demic. Aghju guadagnatu un MD è sò statu in qualchì forma di assistenza sanitaria o di cunsultazione dapoi. In l'ultimi 20 anni, aghju amparatu u pensamentu criticu. Per a squadra IBM chì discute in l'articulu, aghju fattu cum'è u Data Scientist. Dicu chì parlu e lingue di a medicina è di i dati. Ùn sò micca un epidemiologu o un espertu di salute publica. Questu ùn hè micca pensatu à esse una difesa o una critica di qualsiasi individuu o pulitica particulare. Ciò chì presentu quì sò solu osservazioni. Hè a mo speranza di suscitarà ancu i vostri penseri.    

 

Luttà Zika cù Dati

 

Prima, a mo sperienza. In 2017, sò statu sceltu da IBM da più di 2000 candidati, per participà à un prughjettu di salute publica pro bono. Una squadra di cinque di noi hè stata mandata in u paese di Panama per un mesi per travaglià cù u dipartimentu di salute publica. A nostra missione era di creà un digital strumentu chì faciliterebbe a decisione più rapida è efficace in relazione à parechje malatie infettive trasmesse da mosquito; u principale hè Zika. 

A suluzione era un pipeline di spartera d'infurmazioni trà investigatori di campu è decisori pulitichi per cuntrullà Zika è altre malatie infettive. In altri palori, avemu sviluppatu una applicazione mobile per rimpiazzà u so prucessu manuale secularu di mandà inspectori vettoriali in u campu. I dati puntuali è precisi anu riduciutu a dimensione è a durata di u focu, pudendu indirizzà megliu strategicamente e zone - pensate à u bloccu di a cità - chì anu bisognu di rimediazione.  

Da quellu tempu, a pandemia di Zika hà fattu u so cursu.  

L'azzione umana ùn hà micca finitu a pandemia di Zika. A cumunità di salute publica hà travagliatu per cuntene, per mezu di diagnostichi, educazione è cunsiglii di viaghju. Ma in fine, u virus hà fattu u so cursu, hà infettatu una grande parte di a pupulazione, è l'immunità di a mandria si sviluppò, fermendu cusì a diffusione.  Oghje, u Zika hè cunsideratu endemicu in alcune parti di u mondu cù eruzioni di u periodu.

Infografica di trasmissione ZikaIn certi di i primurosa è e pandemie più letali quasi tutti quelli chì si sò malati sò morti. Cù Zika, "Una volta chì una grande parte di a pupulazione hè infettata, sò immune è prutegge in realtà l'altri persone da esse infettati [ùn ci hè micca una vacuna per prutegge contr'à Zika]".  Hè ciò chì hè accadutu cù Zika. U focu hè finitu in l'Americhe è l'incidenza di Zika avà in 2021 hè assai bassa. Eccu a grande nutizia ! Zika hà cullatu in u 2016 cum'è l'ufficiali di Panamà anu dumandatu à IBM per mandà aiutu per cumbatte i mosquitoes. Trasmissione Zika | Virus Zika | CDC

A correlazione ùn hè micca causazione, ma dopu a nostra visita in Panama, a pandemia di Zika hà cuntinuatu à calà. Ci sò epidemie occasionali, ma dapoi ùn hà micca righjuntu u listessu livellu di preoccupazione. Qualchidunu aspettanu chì u pendulu torna in modu chì l'immunità naturale diminuisce è l'individui micca esposti migranu in e zone di risicu Zika.

 

Paralleli di Pandemia Zika è COVID-19

 

Cumu hè questu in relazione cù COVID-19? Sia u patogenu chì hè rispunsevuli di COVID-19 è Zika sò virus. Hanu diverse forme primarie di trasmissione. Zika hè principalmente trasmessa da i mosquitoes à l'omu. Ci sò opportunità per a trasmissione da l'omu à l'omu, ma a forma principale di trasmissione hè direttamente da u mosquito.

Per u coronavirus, hè statu dimustratu chì certi animali, cum'è pipistrelli e cervu, portanu u virus, ma a forma principale di Trasmissioni hè umanu à umanu.

Cù e malatie trasmissibili da zanzara (Zika, Chikungunya, Dengue), un scopu di u ministeru di a salute publica di Panama era di minimizzà l'esposizione à u virus riducendu l'esposizione à u vettore. In i Stati Uniti, in più di a vaccina sviluppata rapidamente, u salute publica primaria e misure per affruntà u COVID includenu a riduzione di l'esposizione è a limitazione di a diffusione à l'altri. E misure di mitigazione per quelli chì sò in altu risicu includenu mascheramentu, alluntanamentu fisicu, isolamentu è chjusu i bars prima.

U cuntinimentu di e duie malatie dipende da ... ok, forse hè quì chì diventa cuntruversu. In più di l'educazione è di spartera di dati, i scopi di a salute publica di a prevenzione di i risultati più severi ponu esse focu annantu à 1. eradicazione di u virus, 2. eradicazione di u vettore, 3. vaccinazione / prutezzione di i più vulnerabili (individui à u più altu risicu). per un risultatu poveru), 4. immunità di mandria, o 5. qualchi cumminazzioni di u sopra.  

A causa di i vettori in altri animali, hè impussibile di sradicà questi virus (salvo chì avete principiatu à vaccinà i mosquitoes è i pipistrelli, pensu). Pensu chì ancu ùn hà micca sensu di parlà di sradicà i vettori. Mosquitos sò un fastidiu, in più di portà e malatie preghjudizie, ma sò sicuru chì serve una sorta di scopu utile. Ùn possu micca imaginà chì una forma di vita hè estinta perchè sò un fastidio per l'omu.  

Allora, parlemu di a vaccinazione / prutezzione di i gruppi à risicu altu è l'immunità di a mandria. Ovviamente, simu abbastanza luntanu in questa pandemia chì i funzionari di a salute publica è i guverni anu digià pigliatu queste decisioni è anu decisu un cursu d'azzione. Ùn sò micca secondu l'avvicinamentu o ancu scaccià e petre cun retrovisione perfetta.  

Individui di più risicu include l'adulti anziani 65 anni è più vechji è quelli chì anu gravi cundizioni medichi sottostanti; cose cum'è cundizzioni di cori, diabete, obesità, immunocompromised, etc. À quelli chì avemu aghjustatu donne incinte per Zika perchè pò esse trasferitu intrautero. 

Immunità di mandatura hè quandu una pupulazione specifica righjunghji un percentinu di l'individui chì sò prutetti da a malatia sia da a vacuna o da l'immunità naturale. À quellu puntu, per quelli chì ùn sò micca immune, u risicu di malatie hè bassu, perchè ci sò pocu trasportatori. Cusì, quelli in altu risicu sò prutetti da quelli chì sò stati esposti prima. U dibattitu resta nantu à ciò chì un percentinu realisticu di a pupulazione (vaccinata + recuperata cù anticorpi) seria necessariu per custituisce l'immunità di gregge per coronavirus.

 

A guerra in Panama

 

Cù IBM L'iniziativa Zika in Panamà, avemu statu capace di sviluppà una applicazione basata in telefonu in tempu reale cù marcatura di geolocalizazione, chì puderia riduce a gravità è a durata di i focu quandu sò cumpletamente implementati. Per rimpiazzà l'arregistramentu è u rapportu di travagliu intensivu è propensu à l'errore, i dati ghjunghjenu à i decisori in ore invece di settimane. I funzionari di a salute publica à u livellu naziunale anu sappiutu paragunà i rapporti di locu in tempu reale di i mosquitosi chì portanu a malatia cù i rapporti in tempu reale di i casi clinichi hospitalizzati. In a guerra contr'à u virus Zika, questi funzionari anu dirigutu risorse à quelli lochi specifichi per eradicà i moschiti in quella zona. 

Allora, invece di abroad l'approcciu di spazzola per a lotta di una malatia, anu cuncentratu i so sforzi nantu à e zone problematiche è e pussibuli prublemi. Fendu cusì, eranu megliu capaci di fucalizza risorse è anu pussutu più rapidamente snuff out the hot spots.

Cù tuttu ciò cum'è sfondate, pruvaraghju à fà alcuni paralleli trà a pandemia di Zika è a nostra attuale pandemia di COVID. Unu studiu in u Journal of Midwifery & Women's Health hà realizatu un sondaghju di a letteratura clinica è determinatu, "Ci sò paralleli significativi trà a malatia [u virus Zika] è COVID-19 in termini di tecniche diagnostiche limitate, terapie è incertezze prognostiche". In e duie pandemie, i pazienti è i clinichi mancavanu d'infurmazioni per piglià decisioni infurmate. A messageria di salute publica era spessu contradictoria in a listessa istituzione. A disinformazione hè stata diffusa in e piattaforme di e social media di u tempu di ogni pandemia. Un dibattitu scientificu seriu hà ancu purtatu à e teorie di cuspirazione. Ùn hè micca difficiule d'imagine chì ognuna di queste risposte hà impattu negativu à i virus in l'individui vulnerabili o à risicu altu.

 

Un Paragone di Virus Zika è COVID-19: Panoramica Clinica è Publicu Missaghju di Salute

 

A malatia di u virus Zika COVID19
Vector Flavivirus: vettori di zanzare Aedes aegypti è Aedes albopictus 3 Coronavirus: gocce, fomites 74
Terra Corsa I mosquitos sò vettori primari

Trasmissioni sessuale 10

Trasmissu da trasfusione di sangue, esposizione di laboratoriu 9

Trasmissu da gocce respiratorii 74

Probabilmente trasmissione aerea 75

Trasmissione verticale durante a gravidanza A trasmissione verticale da a persona incinta à u fetu si trova, è l'infezione congenitale hè prubabile 9 A trasmissione verticale / infezione congenitale hè improbabile 76
illustree Spessu asimptomaticu; sintomi simili à a gripe, cum'è febbre, artralgia, rash è conjunctivitis 3 Asimptomaticu; imita ancu a rinorrea normale è a dispnea fisiologica di a gravidanza 65
Pruvenzi diagnostichi Sierologie RT-PCR, NAAT, PRNT, IgM 32

Alta rata di falsi negativi è pusitivi 26

Reazione incrociata di serologie di immunoglobuline cù altri flavivirus endemici, cum'è u virus dengue. 26

U diagnosticu perinatale limitatu da a sensibilità è a specificità di l'ultrasound per a deteczione di ferita virali 20

RT-PCR, NAAT, serologie IgM 42

A sensibilità varieghja secondu u tempu da l'esposizione, a tecnica di campionamentu, a fonte di specimen 76

Testi rapidi di l'antigene (COVID-19 Ag Respi-Strip) dispunibuli, ma ci sò preoccupazioni per a so validità, precisione è prestazione 76

Mancanza cuntinuata di capacità di teste è reagenti di laboratoriu 42

Terapéutica Cura di sustegnu

U sindromu di Zika congenitale richiede cure specializate, terapia fisica, farmacoterapia per i disordini convulsivi, correzione / protesi per deficit auditivi è ottici. 23

Cura di sustegnu

Remdesivir pare sicuru in a gravidanza

L'altri terapii (ribavirin, baricitinib) sò teratogeni, embriotossichi 39

 

Abbreviazioni: COVID-19, coronavirus maladie 2019; IgM, immunoglobuline class M; NAAT, prova di amplificazione di l'acidu nucleicu; PRNT, prova di neutralizazione di a riduzione di a placca; RT-PCR, prova di reazione a catena di polimerasi di trascrizione inversa.

Questu articulu hè dispunibule liberamente attraversu PubMed Central cum'è parte di a risposta d'emergenza di salute publica COVID-19. Pò esse usatu per riutilizazione è analisi di ricerca senza restrizioni in ogni forma o per ogni modu cù ricunniscenza di a fonte originale, per a durata di l'emergenza di salute publica. (editatu da l'autore)

In a nostra sperienza Zika in Panamà, l'ispezioni porta à porta anu cercatu i mosquitos. Oghje, usemu e teste COVID per circà u coronavirus. Tramindui cercanu evidenza di u virus, chjamatu ispezione vettoriale. L'ispezione vettoriale cerca evidenza di putenziali portatori di u virus è e cundizioni chì li permettenu di prosperà.  

 

Paragunendu COVID-19 à Pandemie Precedenti

 

Paragunatu à altre epidemie recenti, i tassi di COVID-19 cum'è unu di i più pervasivi in ​​termini di paesi affettati è numeru di casi identificati. Fortunatamente, u Case Fatality Rate (CFR) hè più bassu di l'altri epidemie maiò.  

 

 

 

 

Source:    Cume u Coronavirus si compara à u SARS, l'influenza suina è altre epidemie

 

U Coronavirus hè più mortale cà un paru di altre malatie chì ùn sò micca incluse in stu graficu. U focu di a gripe suina (H2009N1) in u 1 hà infettatu trà 700 milioni è 1.4 miliardi di persone in u mondu, ma avia un CFR di 0.02%. Ancu micca in questu graficu sò i 500,000 2015 casi suspettati di u virus Zika in 2016 è 18 è i so 19 morti. Per purtà COVID-2021 più aghjurnatu, da dicembre XNUMX, u Worldomet hè U situ web di seguimentu di coronavirus mette u numeru di casi à 267,921,597 cù 5,293,306 morti per un CFR calculatu di 1.98%. Perchè u COVID-19 pò esse asintomaticu cum'è descrittu in u studiu Journal of Midwifery & Women's Health, forse ùn anu mancu sapè chì sò malati. Ùn ci hè nisuna ragione per queste persone per circà una prova per ùn finiscinu micca una parte di u denominatore. In altre parolle, stu scenariu pò purtà à i tassi di casi per COVID-19 più altu ch'è e statistiche mostranu.

In e fasi iniziali di una pandemia, i dati da a modellazione epidemiologica, u diagnosticu clinicu è l'efficacità di u trattamentu sò spessu scarsi. Strategie in a fase iniziale includenu ramping testing and reporting, a cumunicazione, è pruvà à preparà a capacità prevista per a vacuna, a prova è u trattamentu. Ognunu dunque, cuscente o micca, face una valutazione di risicu individuale basatu annantu à a so cunniscenza di a gravità di u risicu, a so capacità percepita per trattà a minaccia è e cunsequenze di a minaccia. In a sucetà d'oghje, sti credenze sò tandu rinfurzati o debilitati da a dieta di e social media è e fonti d'infurmazione.

Cronologia di a prova di Covid-19

Testi COVID valutà a prisenza di u coronavirus. Sicondu u tipu di francese test amministratu, un risultatu pusitivu indicà chì u paziente hà una infizzione attiva (test rapidu di PCR moleculare o teste di l'antigenu di laboratoriu) o chì hà avutu una infizzione in un certu puntu (test d'anticorpi).  

Se una persona hà sintomi cunsistenti cù COVID è un test antigenu virali pusitivu, l'azzione hè garantita. Questa azzione serà di tumbà u virus è piantà a diffusione. Ma, perchè u coronavirus hè cusì contagiosu, individui cù sintomi ligeri è senza altre cundizioni sottostanti, sperti ricumandemu l'assunzione di una prova positiva è si mette in quarantena per 10 ghjorni à duie settimane. [UPDATE: À a fini di dicembre 2021, u CDC hà accurtatu u periodu di isolamentu cunsigliatu per e persone chì anu COVID à 5 ghjorni seguiti da 5 ghjorni di mascheratura intornu à l'altri. Per quelli chì sò esposti à casi cunnisciuti di u virus, u CDC ricumanda una quarantena di 5 ghjorni più 5 ghjorni di mascheratura per i non vaccinati. Or, 10 ghjorni di mascheramentu si vaccinati è stimulati.] Ancora altru sperti ricumandemu di trattà l'individui asintomatici s'ellu anu un test antigenu COVID pusitivu. (ResearchTuttavia, mostra chì l'infettività di l'individui asintomatici hè debule. A sfida, però, hè di distingue l'asintomaticu da u presintomaticu chì hè contagiosu.) U virus hè uccisu da u trattamentu di u paci, chì permette à u sistema di difesa di u corpu di muntà una risposta, è isolà u paziente mentre sò contagiosi. A prevenzione è l'intervenzione precoce sò e chjave per a gestione di a pandemia. Questu hè avà familiar "appiattimentu di a curva. "

Flattening The CurveIn u trattu cù Zika, raccomandazioni di salute publica includenu piglià precautions in casa chì impediscenu l'incubazione è a crescita di mosquitoes - eliminà l'acqua stagnante in u vostru giardinu, sguassate i reservoirs potenziali cum'è i vechji pneumatici. In listessu modu, raccomandazioni per riduce a diffusione di u coronavirus includenu alluntanamentu fisicu, maschere è igiene aumentata, cum'è lavà e mani è eliminazione sicura di tessuti usati.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ ("Fatturi esterni cum'è e rete soziale è e fonti d'infurmazioni ponu sia amplificà o minà a percepzione di risicu."

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Ciò chì ùn vecu micca in l'attuale pandemia di COVID hè un approcciu focalizatu, guidatu da dati, miratu. Ancu in Panamà, l'approcciu di salute publica à a pandemia di Zika ùn era micca una taglia unica. Era impracticable - perchè i risorse sò limitati - per cumbatte i mosquitoes in ogni fronte è era impussibile di eliminà tutti i vettori pussibuli. Dunque, i risorse sò stati dedicati à quelli chì anu più risicu basatu nantu à a geugrafia è e cundizioni sottostanti.  

 

COVID-19 Salute publica è misure suciale

 

Cù a pandemia di COVID-19, hè ancu impraticabile per guardà tutti da sempre malati. Ciò chì avemu amparatu hè chì hè più sensu di dà priorità à l'intervenzione di salute publica à i più vulnerabili è à e pupulazioni à risicu per i risultati medichi più poveri. Se seguitemu l'ecunumia, avemu i dati per ghjustificà dedicà più risorse è misure di cuntrollu per: Poster di sicurezza CDC Covid Guidelines

  • Zone d'alta densità di pupulazione - giugrafica è situazione - cità, trasportu publicu è viaghji aerei.
  • Istituzioni chì anu persone cun cundizioni sottostanti chì cuntribuiscenu à risultati avversi se cuntravanu coronavirus - ospedali, cliniche
  • Individui cù un risicu più altu di mortalità se cuntranu COVID-19, vale à dì u vechji in case di anziani, cumunità di pensione.
  • Stati cun climi più propizi à a replicazione di coronavirus. who Avvirtenu chì u virus si sparghje in tutti i climi, ma ci sò variazioni staghjunali chì mostranu picchi in i mesi d'invernu
  • L'individui cù sintomi anu un risicu più altu di trasmette a malatia à l'altri. A prova deve esse focu annantu à sta populazione è l'azzione pigliata rapidamente per isolà è trattà.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Sembra chì u Raccomandazioni interim di l'OMS di ghjugnu 2021 sò inclinati in questa direzzione. I novi cunsiglii includenu misure di salute publica è suciale "adatta à i cuntesti lucali". A guida di l'OMS dice chì "E misure [di salute publica è suciale] deve esse implementate da u livellu amministrativu più bassu per quale a valutazione di a situazione hè pussibule è adattate à l'ambienti è e cundizioni lucali". In altri palori, valutà i dati à u livellu più granulare dispunibule è piglià l'azzione. Questa publicazione riduce ancu più l'enfasi in una "nova sezione nantu à e considerazioni per e misure individualizzate di salute publica basate nantu à u statu di immunità SARS-CoV-2 di una persona dopu a vaccinazione COVID-19 o infezzione passata ".

Puderia COVID seguità a tendenza di Zika?

 

Case Counts di Zika in i Stati Uniti è Territorii

 

Panama è In u mondu I dati mostranu tendenzi simili per i casi di Zika. U progressione tipica hè chì e pandemie diminuiscenu à l'epidemie, poi l'endemichi cù epidemie periodiche. Oghje, pudemu guardà in daretu à a pandemia di Zika. Offru una parolla di speranza. Cù dati, sperienza è tempu, u coronavirus, cum'è u virus Zika è tutti i virus prima di questu, currerà u so cursu.

Lettura addiziale: Interessante, ma solu ùn si adattava

 

Cume 5 di a peghju pandemia di u mondu hè finita da u Canale Storia

Breve storia di e pandemie (pandemie in tuttu a storia)

Cumu finiscinu e pandemie? A storia suggerisce chì e malatie svaniscenu ma ùn sò quasi mai veramente andate

Infine, un'altra arma contr'à Covid 

Cumu Poop offre suggerimenti nantu à a diffusione di Coronavirus

A verità daretu à u panicu di cacca di coronavirus