Luchando contra el virus COVID-19 con datos

by 17 de enero de 2022BI/Analítica0 comentarios

Observación

 

No te saltes este párrafo. Dudo en sumergirme en estas aguas polémicas, a menudo políticas, pero se me ocurrió una idea mientras paseaba a mi perro, Demic. Obtuve un doctorado y he estado en alguna forma de atención médica o consultoría desde entonces. Durante los últimos 20 años, he aprendido a pensar críticamente. Para el equipo de IBM del que hablo en el artículo, actué como científico de datos. Digo que hablo los lenguajes de la medicina y de los datos. No soy epidemiólogo ni experto en salud pública. Esto no pretende ser una defensa o crítica de ningún individuo o política en particular. Lo que presento aquí son meras observaciones. Es mi esperanza agitar sus pensamientos, también.    

 

Luchando contra el zika con datos

 

Primero, mi experiencia. En 2017, fui seleccionado por IBM entre más de 2000 postulantes para participar en un proyecto de salud pública pro bono. Un equipo de cinco de nosotros fuimos enviados al país de Panamá por un mes para trabajar con el departamento de salud pública allí. Nuestra misión era crear un digital herramienta que facilitaría la toma de decisiones más rápidas y efectivas relacionadas con varias enfermedades infecciosas transmitidas por mosquitos; el principal es Zika. 

La solución fue un canal de intercambio de información entre los investigadores de campo y los encargados de formular políticas para controlar el Zika y otras enfermedades infecciosas. En otras palabras, desarrollamos una aplicación móvil para reemplazar su antiguo proceso manual de enviar inspectores de vectores al campo. Los datos oportunos y precisos redujeron el tamaño y la duración del brote al poder enfocarse mejor estratégicamente en las áreas (piense en el bloque de la ciudad) que necesitan remediación.  

Desde entonces, la pandemia de Zika ha seguido su curso.  

La acción humana no acabó con la pandemia del Zika. La comunidad de salud pública trabajó para contenerlo, a través de diagnósticos, educación y avisos de viaje. Pero finalmente, el virus siguió su curso, infectó a una gran parte de la población y se desarrolló la inmunidad colectiva, deteniendo así la propagación.  Hoy en día, el zika se considera endémico en algunas partes del mundo con brotes menstruales.

Infografía sobre la transmisión del zikaen algunos de los más temprana y las pandemias más mortales, casi todos los que se enfermaron murieron. Con el zika, “una vez que una gran proporción de la población está infectada, son inmunes y, de hecho, protegen a otras personas para que no se infecten [no existe una vacuna para proteger contra el zika]”.  Eso es lo que pasó con el zika. El brote terminó en las Américas y la incidencia de Zika ahora en 2021 es muy baja. ¡Esa es la gran noticia! Zika alcanzó su punto máximo en 2016 justo cuando los funcionarios de Panamá pidieron a IBM que enviara ayuda para combatir los mosquitos. Transmisión Zika | Virus Zika | Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades

La correlación no es causalidad, pero después de nuestra visita a Panamá, la pandemia de Zika siguió disminuyendo. Hay brotes ocasionales, pero desde entonces no ha alcanzado el mismo nivel de preocupación. Algunos esperan que el péndulo retroceda a medida que la inmunidad natural se desvanece y las personas no expuestas migran a las zonas de alto riesgo de Zika.

 

Paralelos entre Zika y la pandemia de COVID-19

 

¿Cómo se relaciona esto con el COVID-19? Tanto el patógeno responsable del COVID-19 como del Zika son virus. Tienen diferentes formas primarias de transmisión. El Zika se transmite principalmente de mosquitos a humanos. Hay oportunidades para la transmisión de persona a persona, pero la principal forma de transmisión es directamente del mosquito.

Para el coronavirus, se ha demostrado que algunos animales, como murciélagos y ciervo, portan el virus, pero la principal forma de transmisión es de humano a humano.

Con las enfermedades transmitidas por mosquitos (Zika, Chikungunya, Dengue), uno de los objetivos del Ministerio de Salud Pública de Panamá fue minimizar la exposición al virus al reducir la exposición al vector. En los EE. UU., además de la vacuna desarrollada rápidamente, la salud pública primaria las medidas para abordar COVID incluyen reducir la exposición y limitar la propagación a otros. Las medidas de mitigación para aquellos que están en alto riesgo han incluido enmascaramiento, distanciamiento físico, aislamiento y cerrando los bares temprano.

La contención de ambas enfermedades depende de... ok, tal vez aquí es donde se vuelve controvertido. Además de la educación y el intercambio de datos, los objetivos de salud pública de prevención de los resultados más graves se pueden centrar en 1. la erradicación del virus, 2. la erradicación del vector, 3. la vacunación/protección de los más vulnerables (personas con mayor riesgo para un mal resultado), 4. inmunidad colectiva, o 5. alguna combinación de las anteriores.  

Debido a los vectores en otros animales, es imposible erradicar estos virus (a menos que empieces a vacunar a los mosquitos y murciélagos, supongo). Creo que tampoco tiene sentido hablar de erradicar los vectores. Los mosquitos son una molestia, además de transmitir enfermedades dañinas, pero estoy seguro de que cumplen algún tipo de propósito útil. No puedo imaginar extinguir una forma de vida porque son una molestia para los humanos.  

Entonces, hablemos de vacunación/protección de grupos de alto riesgo e inmunidad colectiva. Obviamente, estamos lo suficientemente avanzados en esta pandemia como para que los funcionarios de salud pública y los gobiernos ya hayan tomado estas decisiones y hayan decidido un curso de acción. No estoy cuestionando el enfoque o incluso tirando piedras en retrospectiva perfecta.  

Individuos de mayor riesgo incluyen adultos mayores de 65 años o más y aquellos con condiciones médicas subyacentes graves; cosas como enfermedades del corazón, diabetes, obesidad, inmunocomprometidos, etc. A las que añadiríamos las mujeres embarazadas para Zika porque se puede transferir intrauterino. 

La inmunidad de grupo es cuando una población específica alcanza un porcentaje de individuos que están protegidos de la enfermedad ya sea por vacuna o por inmunidad natural. En ese momento, para aquellos que no son inmunes, el riesgo de enfermedad es bajo porque hay muy pocos portadores. Por lo tanto, aquellos en alto riesgo están protegidos por aquellos que han estado expuestos previamente. Sigue habiendo debate sobre qué porcentaje realista de la población (vacunados + recuperados con anticuerpos) sería necesario para constituir inmunidad colectiva para el coronavirus.

 

La guerra en Panamá

 

con los de IBM iniciativa zika en Panamá, pudimos desarrollar una aplicación telefónica en tiempo real con marcado de geolocalización, que podría reducir tanto la gravedad como la duración de los brotes cuando se implemente por completo. Al reemplazar el registro y la generación de informes que requieren mucha mano de obra y son propensos a errores, los datos llegaron a quienes toman las decisiones en horas en lugar de semanas. Los funcionarios de salud pública a nivel nacional pudieron comparar los informes de ubicación en tiempo real de los mosquitos portadores de enfermedades con los informes en tiempo real de casos clínicos hospitalizados. En la guerra contra el virus Zika, estos funcionarios luego dirigieron recursos a esos lugares específicos para erradicar los mosquitos en esa área. 

Entonces, en lugar de abroad enfoque de pincel para combatir una enfermedad, concentraron sus esfuerzos en áreas problemáticas y áreas problemáticas potenciales. Al hacerlo, pudieron concentrar mejor los recursos y eliminar más rápidamente los puntos conflictivos.

Con todo eso como antecedente, intentaré establecer algunos paralelismos entre la pandemia de Zika y nuestra actual pandemia de COVID. Una estudio en el Journal of Midwifery & Women's Health realizó una encuesta de la literatura clínica y determinó: "Existen paralelismos significativos entre la enfermedad [del virus del Zika] y la COVID-19 en términos de técnicas de diagnóstico limitadas, terapias e incertidumbres de pronóstico". En ambas pandemias, los pacientes y los médicos carecían de información para tomar decisiones informadas. Los mensajes de salud pública a menudo eran contradictorios dentro de la misma institución. La desinformación se difundió en las plataformas de redes sociales de la época de cada pandemia. El debate científico serio incluso condujo a teorías de conspiración. No es difícil imaginar que cada una de estas respuestas impactadas negativamente a los virus en las personas vulnerables o de alto riesgo.

 

Una comparación del virus Zika y COVID-19: descripción clínica y público Mensajería de salud

 

Enfermedad por el virus del Zika COVID-19
vector Flavivirus: mosquitos vectores Aedes aegypti y Aedes albopictus 3 Coronavirus: gotitas, fómites 74
Transmisión Los mosquitos son vectores primarios

Transmisión sexual 10

Transmitido por transfusión de sangre, exposición de laboratorio 9

Transmitido por gotitas respiratorias 74

Transmisión aérea probable 75

Transmisión vertical durante el embarazo Se produce transmisión vertical de la mujer embarazada al feto y es probable que se produzca una infección congénita 9 La transmisión vertical/infección congénita es improbable 76
Síntomas A menudo asintomático; síntomas leves similares a los de la gripe, como fiebre, artralgia, erupción cutánea y conjuntivitis 3 asintomático; también imita la rinorrea normal y la disnea fisiológica del embarazo 65
Pruebas de diagnostico RT‐PCR, NAAT, PRNT, serologías IgM 32

Alta tasa de falsos negativos y positivos 26

Reacción cruzada de serologías de inmunoglobulina con otros flavivirus endémicos, como el virus de la fiebre del dengue 26

Diagnóstico perinatal limitado por la sensibilidad y especificidad de la ecografía para la detección de lesiones virales 20

RT‐PCR, NAAT, serologías IgM 42

La sensibilidad varía según el tiempo de exposición, la técnica de muestreo, la fuente de la muestra 76

Pruebas rápidas de antígenos (COVID-19 Ag Respi-Strip) disponibles, pero existen dudas sobre su validez, precisión y rendimiento 76

Falta continua de capacidad de prueba y reactivos de laboratorio. 42

Terapéutica Cuidados de apoyo

El síndrome de Zika congénito requiere atención especializada, fisioterapia, farmacoterapéuticos para los trastornos convulsivos, corrección/prótesis para los déficits auditivos y ópticos 23

Cuidados de apoyo

Remdesivir parece seguro en el embarazo

Otras terapias (ribavirina, baricitinib) son teratogénicas, embriotóxicas 39

 

Abreviaturas: COVID-19, enfermedad por coronavirus 2019; IgM, inmunoglobulina clase M; NAAT, prueba de amplificación de ácidos nucleicos; PRNT, prueba de neutralización por reducción de placa; RT‐PCR, prueba de reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa.

Este artículo está disponible gratuitamente a través de PubMed Central como parte de la respuesta de emergencia de salud pública de COVID-19. Se puede utilizar para la reutilización y el análisis de investigación sin restricciones en cualquier forma o por cualquier medio con el reconocimiento de la fuente original, durante la duración de la emergencia de salud pública. (editado por el autor)

En nuestra experiencia con el zika en Panamá, las inspecciones puerta a puerta buscaban mosquitos. Hoy, usamos las pruebas de COVID para buscar el coronavirus. Ambos buscan evidencia del virus, lo que se conoce como inspección de vectores. La inspección de vectores busca evidencia de posibles portadores del virus y las condiciones que le permiten prosperar.  

 

Comparación de COVID-19 con pandemias anteriores

 

En comparación con otras epidemias recientes, la COVID-19 se clasifica como una de las más generalizadas en términos de países afectados y número de casos identificados. Afortunadamente, la tasa de letalidad (CFR) es más baja que otras epidemias importantes.  

 

 

 

 

Fuente:    Cómo se compara el coronavirus con el SARS, la gripe porcina y otras epidemias

 

El coronavirus es más letal que un par de otras enfermedades no incluidas en esta tabla. El brote de gripe porcina (H2009N1) de 1 infectó a entre 700 millones y 1.4 millones de personas en todo el mundo, pero tuvo una CFR de 0.02 %. Tampoco en este cuadro están los 500,000 casos sospechosos del virus Zika en 2015 y 2016 y sus 18 muertes. Para actualizar el COVID-19, a partir de diciembre de 2021, el Worldomet es El sitio web de seguimiento de coronavirus puso el número de casos en 267,921,597 con 5,293,306 muertes para un CFR calculado de 1.98%. Debido a que la COVID-19 puede ser asintomática, como se describe en el estudio Journal of Midwifery & Women's Health, es posible que ni siquiera sepan que están enfermas. No hay razón para que estas personas busquen una prueba para que no terminen siendo parte del denominador. En otras palabras, este escenario puede llevar a que las tasas de casos de COVID-19 sean más altas de lo que muestran las estadísticas.

En las primeras fases de una pandemia, los datos del modelo epidemiológico, el diagnóstico clínico y la eficacia del tratamiento suelen ser escasos. Las estrategias en la fase inicial incluyen aumentar las pruebas y los informes, la comunicación y tratar de preparar la capacidad prevista para la vacuna, las pruebas y el tratamiento. Entonces, todos, conscientes o no, hacen una evaluación de riesgo individual basada en su comprensión de la gravedad del riesgo, su capacidad percibida para hacer frente a la amenaza y las consecuencias de la amenaza. En la sociedad actual, estas creencias se ven fortalecidas o debilitadas por la dieta de las redes sociales y las fuentes de información.

Línea de tiempo de prueba de Covid-19

Pruebas COVID evaluar la presencia del coronavirus. Dependiendo del tipo de test administrado, un resultado positivo indicará que el paciente tiene una infección activa (prueba rápida de PCR molecular o pruebas de antígenos de laboratorio) o que ha tenido una infección en algún momento (prueba de anticuerpos).  

Si una persona tiene síntomas consistentes con COVID y una prueba de antígeno viral positiva, se justifica la acción. Esa acción será matar el virus y detener la propagación. Pero, debido a que el coronavirus es tan contagioso, las personas con síntomas leves y sin otras afecciones subyacentes, expertos recomendar la suposición de una prueba positiva y ponerse en cuarentena durante 10 días a dos semanas. [ACTUALIZAR: A fines de diciembre de 2021, los CDC acortaron el período de aislamiento recomendado para las personas que tienen COVID a 5 días seguidos de 5 días de enmascaramiento alrededor de los demás. Para aquellos que están expuestos a casos conocidos del virus, los CDC recomiendan una cuarentena de 5 días más 5 días de enmascaramiento para los no vacunados. O, 10 días de enmascaramiento si está vacunado y reforzado.] Todavía otros expertos recomendar el tratamiento de personas asintomáticas si tienen una prueba de antígeno COVID positiva. (Investigación, sin embargo, muestra que la infectividad de los individuos asintomáticos es débil. El desafío, sin embargo, es distinguir lo asintomático de lo presintomático que es contagioso). El virus se elimina al tratar al paciente, lo que permite que el sistema de defensa del cuerpo genere una respuesta y aísle al paciente mientras es contagioso. La prevención y la intervención temprana son las claves para gestionar la pandemia. Este es el ahora familiar, “aplanamiento de la curva."

aplanando la curvaAl tratar con el Zika, recomendaciones de salud pública incluya tomar precauciones en el hogar que prevendrían la incubación y el crecimiento de mosquitos: elimine el agua estancada en su jardín, elimine depósitos potenciales como llantas viejas. Similar, recomendaciones para reducir la propagación del coronavirus incluyen el distanciamiento físico, las máscaras y una mayor higiene, como el lavado de manos y la eliminación segura de los pañuelos usados.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ (“Los factores externos, como las redes sociales y las fuentes de información, pueden amplificar o socavar la percepción del riesgo”).

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Lo que no veo en la actual pandemia de COVID es un enfoque enfocado, basado en datos y dirigido. Incluso en Panamá, el enfoque de salud pública para la pandemia de Zika no fue igual para todos. No era práctico, porque los recursos son limitados, luchar contra los mosquitos en todos los frentes y era imposible eliminar todos los posibles vectores. Por lo tanto, los recursos se dedicaron a las personas con mayor riesgo en función de la geografía y las condiciones subyacentes.  

 

COVID-19 Salud Pública y Medidas Sociales

 

Con la pandemia de COVID-19, tampoco es práctico evitar que todos se enfermen. Lo que hemos aprendido es que tiene más sentido priorizar la intervención de salud pública para los más vulnerables y para las poblaciones en riesgo de los peores resultados médicos. Si seguimos la economía, tenemos los datos para justificar dedicar más recursos y medidas de control a: Póster de seguridad de las pautas de CDC Covid

  • Áreas de alta densidad de población, tanto geográfica como situacional: ciudades, transporte público y viajes aéreos.
  • Instituciones que tienen personas con afecciones subyacentes que contribuirían a resultados adversos si contrajeran coronavirus: hospitales, clínicas
  • Individuos con un mayor riesgo de mortalidad si contraen COVID-19, a saber, el anciano en hogares de ancianos, comunidades de jubilados.
  • Estados con climas más propicios para la replicación del coronavirus. La OMS advierte que el virus se propaga en todos los climas, pero hay variaciones estacionales que muestran picos en los meses de invierno
  • Las personas con síntomas tienen un mayor riesgo de transmitir la enfermedad a otros. Las pruebas deben centrarse en esta población y tomar medidas rápidamente para aislar y tratar.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Parece que el Recomendaciones provisionales de junio de 2021 de la OMS se inclinan en esta dirección. Las nuevas recomendaciones incluyen medidas sociales y de salud pública "adaptadas a los contextos locales". La guía de la OMS dicta que "las medidas [sociales y de salud pública] deben ser implementadas por el nivel administrativo más bajo para el cual sea posible una evaluación situacional y adaptadas a los entornos y condiciones locales". En otras palabras, evaluar los datos al nivel más granular disponible y tomar medidas. Esta publicación también reduce aún más el enfoque en una "nueva sección sobre consideraciones para medidas de salud pública individualizadas basadas en el estado de inmunidad al SARS-CoV-2 de una persona después de la vacunación contra el COVID-19 o una infección pasada".

¿Podría COVID seguir la tendencia de Zika?

 

Recuento de casos de zika en EE. UU. y territorios

 

Panamá y en todo el mundo los datos muestran tendencias similares para los casos de Zika. El progresión típica es que las pandemias decrecen a epidemias, luego las endémicas con brotes periódicos. Hoy, podemos mirar hacia atrás a la pandemia de Zika. Ofrezco una palabra de esperanza. Con datos, experiencia y tiempo, el coronavirus, como el virus Zika y todos los virus anteriores, seguirá su curso.

Lectura adicional: Interesante, pero simplemente no encajaba

 

Cómo terminaron 5 de las peores pandemias del mundo del Canal Historia

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