Küzdelem a COVID-19 vírus ellen adatokkal

by 17. január 2022.BI/Analytics0 megjegyzések

A felelősség megtagadása

 

Ne hagyja ki ezt a bekezdést. Habozok belegázolni ezekre a vitás, gyakran politikai vizekre, de eszembe jutott egy gondolat, miközben a kutyámat, Demicet sétáltattam. MD diplomát szereztem, és azóta valamilyen egészségügyi vagy tanácsadói tevékenységet folytatok. Az elmúlt 20 év alatt megtanultam a kritikai gondolkodást. A cikkben tárgyalt IBM-csapatnál Data Scientistként tevékenykedtem. Azt mondom, hogy beszélem az orvostudomány és az adatok nyelvét. Nem vagyok epidemiológus vagy közegészségügyi szakértő. Ennek nem célja egyetlen egyén vagy politika védelme vagy kritikája. Amit itt bemutatok, azok csupán megfigyelések. Remélem, hogy az Ön gondolatait is felkavarja.    

 

Küzdelem a Zika ellen adatokkal

 

Először is az én tapasztalatom. 2017-ben az IBM több mint 2000 jelentkező közül kiválasztott, hogy részt vegyek egy pro bono közegészségügyi projektben. Egy ötfős csapatunkat Panamába küldték egy hónapra, hogy az ottani közegészségügyi osztályon dolgozzanak. Küldetésünk az volt, hogy létrehozzuk a digital olyan eszköz, amely elősegíti a gyorsabb és hatékonyabb döntéshozatalt számos szúnyogok által terjesztett fertőző betegséggel kapcsolatban; a fő a Zika. 

A megoldást a helyszíni nyomozók és a politikai döntéshozók közötti információmegosztási csatorna jelentette a Zika és más fertőző betegségek leküzdésére. Más szóval, kifejlesztettünk egy mobilalkalmazást, amely felváltja az ősrégi kézi vektor-ellenőrzőket a terepre. Az időszerű, pontos adatok csökkentették a járvány terjedelmét és időtartamát, mivel stratégiailag jobban meg tudták célozni azokat a területeket – gondoljunk a várostömbökre –, amelyek helyreállításra szorulnak.  

Azóta a Zika-járvány lefutott.  

Az emberi tevékenység nem vetett véget a Zika-járványnak. A közegészségügyi közösség diagnosztikával, oktatással és utazási tanácsokkal igyekezett megfékezni ezt. De végül a vírus befutott, megfertőzte a lakosság nagy részét, és kialakult a csorda immunitása, megállítva ezzel a terjedést.  Manapság a Zika a világ egyes részein endemikusnak számít, időszakos kitörésekkel.

Zika átvitel infografikaNéhányban a legkorábbi és a leghalálosabb világjárványok során szinte mindenki meghalt, aki megbetegedett. A Zika esetében: „Miután a lakosság nagy része megfertőződött, immúnissá válik, és valójában megvédenek más embereket a fertőzéstől [nincs vakcina a Zika ellen].”  Ez történt a Zikával. A járvány elmúlt Amerikában, és a Zika incidenciája 2021-ben nagyon alacsony. Ez a nagyszerű hír! A Zika 2016-ban érte el a csúcsot, amikor a panamai tisztviselők arra kérték az IBM-et, hogy küldjön segítséget a szúnyogok elleni küzdelemben. Zika sebességváltó | Zika vírus | CDC

A korreláció nem okozati összefüggés, de panamai látogatásunk után a Zika-járvány tovább enyhült. Alkalmanként előfordulnak járványkitörések, de azóta sem érte el az aggodalomra okot adó mértéket. Vannak, akik arra számítanak, hogy az inga vissza fog lendülni, amikor a természetes immunitás gyengül, és a nem exponált egyedek a Zika-járvány magas kockázati zónáiba vándorolnak.

 

A Zika és a COVID-19 világjárvány párhuzamai

 

Hogyan kapcsolódik ez a COVID-19-hez? Mind a COVID-19-ért, mind a Zikaért felelős kórokozó vírus. Különféle elsődleges átviteli formáik vannak. A Zika elsősorban a szúnyogoktól terjed az emberre. Vannak lehetőségek az emberről emberre történő átvitelre, de a fertőzés fő formája közvetlenül a szúnyogtól történik.

A koronavírus esetében kimutatták, hogy egyes állatok, mint pl denevérek és a szarvas, hordozzák a vírust, de a fő formája átvitel emberről emberre van.

A szúnyogok által terjesztett betegségek (Zika, Chikungunya, Dengue-láz) kapcsán a panamai közegészségügyi minisztérium egyik célja az volt, hogy a kórokozó-átvivő expozíció csökkentésével minimalizálja a vírusnak való kitettséget. Az USA-ban a gyorsan kifejlesztett vakcina mellett a elsődleges közegészségügy A COVID kezelésére irányuló intézkedések közé tartozik a kitettség csökkentése és a másokra való terjedés korlátozása. A nagy kockázatnak kitett személyek esetében a mérséklő intézkedések közé tartozik a maszkolás, a fizikai távolságtartás, az elkülönítés és korán bezárni a rácsokat.

Mindkét betegség megfékezése attól függ… oké, talán itt válik ellentmondásossá. Az oktatáson és az adatok megosztásán túl a legsúlyosabb következmények megelőzésének népegészségügyi céljai 1. a vírus felszámolására, 2. a vektor felszámolására, 3. a legsebezhetőbbek (legmagasabb kockázatú egyének) vakcinázására/védelmére irányulhatnak. rossz eredmény esetén), 4. állományimmunitás vagy 5. a fentiek valamilyen kombinációja.  

A más állatokban lévő vektorok miatt lehetetlen kiirtani ezeket a vírusokat (hacsak nem kezdi el beoltani a szúnyogokat és a denevéreket, gondolom). Szerintem sincs értelme a vektorok felszámolásáról beszélni. A szúnyogok amellett, hogy káros betegségeket hordoznak, kellemetlenek, de biztos vagyok benne, hogy valamilyen hasznos célt szolgálnak. Nem tudom elképzelni, hogy egy életformát kipusztítsak, mert kellemetlenek az emberek számára.  

Szóval, beszéljünk a védőoltásról/a magas kockázatú csoportok védelméről és az állomány immunitásáról. Nyilvánvalóan már elég messzire járunk ebben a járványban ahhoz, hogy a közegészségügyi tisztviselők és a kormányok már meghozták ezeket a döntéseket, és eldöntötték a cselekvési irányt. Nem másodszor találgatom a megközelítést, vagy akár a kövekkel dobálást tökéletes utólag.  

Magasabb kockázatú személyek ide tartoznak a 65 éves vagy annál idősebb idősebb felnőttek és a súlyos alapbetegségben szenvedők; olyan dolgok, mint a szívbetegségek, a cukorbetegség, az elhízás, az immunhiány stb terhes nők Zika esetében, mert méhen belül átvihető. 

Csorda immunitás az, amikor egy adott populáció eléri azoknak az egyéneknek a százalékát, akik védettek a betegségtől akár vakcinával, akár természetes immunitás révén. Ekkor azok számára, akik nem immunisak, alacsony a betegség kockázata, mivel nagyon kevés a hordozó. Így a nagy kockázatnak kitetteket azok védik, akik korábban ki voltak téve. Továbbra is vita folyik arról, hogy a lakosság reális százalékára (oltott + antitestekkel felépült) hány százalékra lenne szükség a koronavírus elleni állományimmunitás megteremtéséhez.

 

A háború Panamában

 

Az IBM-el Zika kezdeményezés Panamában sikerült kifejlesztenünk egy valós idejű telefon alapú alkalmazást földrajzi helymegjelöléssel, amely teljes megvalósítása esetén csökkentheti a járványok súlyosságát és időtartamát. A munkaigényes és hibaveszélyes rögzítés és jelentés felváltásával hetek helyett órák alatt jutottak el az adatok a döntéshozókhoz. A közegészségügyi tisztviselők országos szinten össze tudták hasonlítani a betegséget hordozó szúnyogokról szóló valós idejű jelentéseket a kórházi klinikai esetek valós idejű jelentéseivel. A Zika-vírus elleni háborúban ezek a tisztviselők erőforrásokat irányítottak ezekre a konkrét helyekre, hogy kiirtsák a szúnyogokat ezen a területen. 

Tehát ab helyettroad ecset megközelítést a betegség elleni küzdelemben, erőfeszítéseiket a problémás területekre és a potenciális problémás területekre összpontosították. Ezáltal jobban tudták az erőforrásokat összpontosítani, és gyorsabban el tudták szüntetni a forró pontokat.

Mindezekkel háttérként megpróbálok párhuzamot vonni a Zika-járvány és a jelenlegi COVID-járvány között. Egy tanulmány a Journal of Midwifery & Women's Health felmérést végzett a klinikai irodalomban, és megállapította: „Szignifikáns párhuzamok vannak [a Zika-vírus] betegség és a COVID-19 között a korlátozott diagnosztikai technikák, terápia és prognosztikai bizonytalanságok tekintetében.” Mindkét pandémia esetén a betegek és a klinikusok nem rendelkeztek információval ahhoz, hogy megalapozott döntéseket hozzanak. A közegészségügyi üzenetküldés gyakran ellentmondásos volt ugyanazon intézményen belül. Minden világjárvány idején dezinformációt terjesztettek a közösségi média felületein. A komoly tudományos viták még összeesküvés-elméletekhez is vezettek. Nem nehéz elképzelni, hogy ezek mindegyike negatívan befolyásolta a vírusokra adott válaszokat a sebezhető vagy magas kockázatú egyénekben.

 

A Zika-vírus és a COVID-19 összehasonlítása: Klinikai áttekintés és nyilvánosság Egészségügyi üzenetküldés

 

Zika vírusos betegség COVID-19
vektor Flavivírus: Aedes aegypti és Aedes albopictus szúnyogok vektora 3 Koronavírus: cseppek, fomitok 74
Átvitel A szúnyogok az elsődleges vektorok

Szexuális transzmisszió 10

Vérátömlesztéssel, laboratóriumi expozícióval terjed 9

Légúti cseppek útján terjed 74

Valószínűleg légi átvitel 75

Függőleges átvitel terhesség alatt A terhes személyről a magzatra függőlegesen átterjed, és valószínű a veleszületett fertőzés 9 A függőleges átvitel/veleszületett fertőzés nem valószínű 76
Tünetek Gyakran tünetmentes; enyhe influenzaszerű tünetek, például láz, ízületi fájdalom, bőrkiütés és kötőhártya-gyulladás 3 Tünetmentes; a normál orrfolyást és a terhesség fiziológiás nehézlégzését is utánozza 65
Diagnosztikai tesztelés RT-PCR, NAAT, PRNT, IgM szerológiák 32

A hamis negatívok és pozitívak magas aránya 26

Az immunglobulin szerológiák keresztreakciója más endemikus flavivírusokkal, például dengue-láz vírussal 26

A perinatális diagnózist az ultrahang érzékenysége és specificitása korlátozza a vírussérülés kimutatására 20

RT-PCR, NAAT, IgM szerológiák 42

Az érzékenység az expozíció időpontjától, a mintavételi technikától és a minta forrásától függően változik 76

Gyors antigéntesztek (COVID-19 Ag Respi-Strip) rendelkezésre állnak, de aggályok merülnek fel azok érvényességével, pontosságával és teljesítményével kapcsolatban 76

A vizsgálati kapacitás és a laboratóriumi reagensek folyamatos hiánya 42

gyógykezelés Támogató gondoskodás

A veleszületett Zika-szindróma speciális ellátást, fizikoterápiát, rohamzavarok gyógyszeres kezelését, hallás- és látászavarok korrekcióját/protézisét igényel 23

Támogató gondoskodás

A Remdesivir terhesség alatt biztonságosnak tűnik

Más terápiák (ribavirin, baricitinib) teratogén, embriotoxikus 39

 

Rövidítések: COVID-19, koronavírus-betegség 2019; IgM, M immunglobulin osztály; NAAT, nukleinsav-amplifikációs teszt; PRNT, plakk redukciós semlegesítési teszt; RT-PCR, reverz transzkripciós polimeráz láncreakció teszt.

Ez a cikk ingyenesen elérhető a PubMed Centralon keresztül a COVID-19 közegészségügyi vészhelyzeti reagálás részeként. Korlátlan kutatási újrafelhasználásra és elemzésre felhasználható bármilyen formában és bármilyen módon, az eredeti forrás igazolásával, a közegészségügyi veszélyhelyzet idejére. (szerkesztette a szerző)

Panamában Zika-tapasztalataink szerint a háztól-házig végzett vizsgálatok szúnyogokat kerestek. Ma COVID-tesztekkel keressük a koronavírust. Mindketten a vírus bizonyítékait keresik, ezt vektorvizsgálatnak nevezik. A vektor-ellenőrzés bizonyítékokat keres a vírus potenciális hordozóira és olyan körülményekre, amelyek lehetővé teszik a vírus virágzását.  

 

A COVID-19 és a korábbi világjárványok összehasonlítása

 

Más közelmúltbeli járványokhoz képest a COVID-19 az egyik legelterjedtebb az érintett országok és az azonosított esetek száma tekintetében. Szerencsére az esetek halálozási aránya (CFR) alacsonyabb, mint más nagyobb járványok esetében.  

 

 

 

 

Forrás:    Hogyan viszonyul a koronavírus a SARS-hez, a sertésinfluenzához és más járványokhoz?

 

A koronavírus sokkal halálosabb, mint néhány más betegség, amelyek nem szerepelnek ezen a táblázaton. A 2009-es sertésinfluenza-járvány (H1N1) világszerte 700 millió és 1.4 milliárd embert fertőzött meg, de a CFR 0.02% volt. Ezen a diagramon nem szerepel a Zika-vírus 500,000 2015 gyanús esete 2016-ben és 18-ban, és 19 haláleset. A COVID-2021 naprakészebbé tétele érdekében XNUMX decemberétől a Worldomet jelentése A koronavírus-követő webhely 267,921,597 5,293,306 1.98-re tette a megbetegedések számát, és 19 19 XNUMX-an haltak meg XNUMX%-os CFR-nek számítva. Mivel a Journal of Midwifery & Women's Health tanulmányban leírtak szerint a COVID-XNUMX tünetmentes lehet, előfordulhat, hogy nem is tudják, hogy betegek. Ezeknek az embereknek semmi okuk arra, hogy tesztet keressenek, nehogy végül a nevező részévé váljanak. Más szavakkal, ez a forgatókönyv azt eredményezheti, hogy a COVID-XNUMX megbetegedések száma magasabb, mint a statisztikák mutatják.

A világjárvány korai szakaszában az epidemiológiai modellezésből, a klinikai diagnózisból és a kezelés hatékonyságából származó adatok gyakran szűkösek. A kezdeti szakaszban a stratégiák közé tartozik a tesztelés és a jelentéstétel, a kommunikáció felgyorsítása, valamint a vakcina, a tesztelés és a kezelés várható kapacitásának előkészítése. Ezt követően mindenki, akár tudatos, akár nem, egyéni kockázatértékelést végez a kockázat súlyosságának megértése, a fenyegetéssel szembeni észlelt képessége és a fenyegetés következményei alapján. A mai társadalomban ezeket a hiedelmeket a közösségi média és az információforrások étrendje erősíti vagy gyengíti.

Covid-19 tesztelési idővonal

COVID tesztek értékelje a koronavírus jelenlétét. Típusától függően teszt beadva, a pozitív eredmény vagy azt jelzi, hogy a betegnek aktív fertőzése van (gyors molekuláris PCR-teszt vagy laboratóriumi antigénteszt), vagy valamikor fertőzése volt (antitest-teszt).  

Ha egy személynél a COVID-nak megfelelő tünetek jelentkeznek, és pozitív vírusantigén-tesztje van, akkor intézkedés indokolt. Ez a lépés a vírus megölése és terjedésének megállítása lesz. Mivel azonban a koronavírus nagyon fertőző, az enyhe tünetekkel rendelkező egyének, akiknek nincs más alapbetegségük, szakértők javasolják a pozitív teszt feltételezését, és 10 naptól két hétig tartó karanténba helyezik magukat. [UPDATE: 2021 decemberének végén a CDC 5 napra lerövidítette a COVID-fertőzöttek ajánlott elkülönítési időszakát, amelyet 5 napos maszkolás követett mások körül. Azok számára, akik ki vannak téve a vírus ismert eseteinek, a CDC 5 napos karantént és 5 napos maszkolást javasol a nem oltottaknak. Vagy 10 napos maszkolás, ha beoltják és beoltják.] Még más szakértők tünetmentes egyének kezelését javasoljuk, ha pozitív COVID antigéntesztjük van. (Kutatásazonban azt mutatja, hogy a tünetmentes egyének fertőzőképessége gyenge. A kihívás azonban az, hogy meg kell különböztetni a tünetmentes és a tünetmentes, fertőző betegséget.) A vírust a beteg kezelése során elpusztítják, lehetővé téve a szervezet védekező rendszerének, hogy reagáljon, és elkülönítse a beteget, amíg fertőző. A megelőzés és a korai beavatkozás a kulcsa a járvány kezelésének. Ez a mára ismerős, "a görbe ellaposodása. "

A görbe lapításaA Zika elleni küzdelemben közegészségügyi ajánlások magában foglalja az otthoni óvintézkedések megtételét, amelyek megakadályozzák a szúnyogok inkubációját és növekedését – távolítsa el az állóvizet az udvaron, távolítsa el a potenciális víztározókat, például a régi gumikat. Hasonlóképpen, ajánlások a terjedés csökkentésére A koronavírus elleni küzdelem a fizikai távolságtartást, a maszkokat és a fokozott higiéniát, mint például a kézmosást és a használt törlőkendő biztonságos ártalmatlanítását foglalja magában.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ ("A külső tényezők, például a közösségi hálózatok és az információs források felerősíthetik vagy alááshatják a kockázatok észlelését.")

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Amit nem látok a jelenlegi COVID-járványban, az egy fókuszált, adatvezérelt, célzott megközelítés. A Zika-járvány közegészségügyi megközelítése még Panamában sem volt mindenkire érvényes. Nem volt praktikus – mert az erőforrások korlátozottak – minden fronton harcolni a szúnyogok ellen, és lehetetlen volt minden lehetséges vektort kiküszöbölni. Tehát a forrásokat a földrajzi elhelyezkedés és az alapfeltételek alapján a legmagasabb kockázatnak kitett személyeknek szentelték.  

 

COVID-19 közegészségügyi és szociális intézkedések

 

A COVID-19 világjárvány miatt szintén nem praktikus megóvni mindenkit attól, hogy valaha is megbetegedjen. Megtudtuk, hogy ésszerűbb, ha a közegészségügyi beavatkozást a legkiszolgáltatottabbak és a legrosszabb egészségügyi következmények által veszélyeztetett populációk számára részesítjük előnyben. Ha követjük a közgazdaságtant, akkor rendelkezünk olyan adatokkal, amelyek indokolják, hogy több erőforrást és ellenőrzési intézkedéseket szánjunk a következőkre: CDC Covid Guidelines Biztonsági plakát

  • Nagy népsűrűségű területek – földrajzi és helyzeti – városok, tömegközlekedés és légi közlekedés.
  • Intézmények, amelyekben olyan betegek vannak, akiknek olyan alapbetegségei vannak, amelyek hozzájárulnának a koronavírus-fertőzés káros következményeihez – kórházak, klinikák
  • Azok a személyek, akiknél magasabb a halálozási kockázat, ha megfertőződnek a COVID-19-cel, nevezetesen a idős idősotthonokban, nyugdíjas közösségekben.
  • Olyan államok, ahol az éghajlat kedvez a koronavírus replikációjának. a WHO figyelmeztet hogy a vírus minden éghajlaton elterjed, de vannak szezonális eltérések, amelyek a téli hónapokban kiugróan mutatnak
  • A tünetekkel küzdő egyéneknél nagyobb a kockázata annak, hogy a betegséget másoknak is átadják. A tesztelést erre a populációra kell összpontosítani, és gyorsan kell intézkedéseket tenni az izolálás és a kezelés érdekében.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Úgy tűnik, hogy a A WHO 2021. júniusi időközi ajánlásai ebbe az irányba hajlanak. Az új ajánlások közegészségügyi és szociális intézkedéseket tartalmaznak, amelyek „a helyi viszonyokhoz igazodnak”. A WHO útmutatása szerint „[a közegészségügyi és szociális] intézkedéseket azon a legalacsonyabb adminisztratív szinten kell végrehajtani, amelynél helyzetértékelés lehetséges, és a helyi körülményekhez és feltételekhez kell szabni.” Más szavakkal, az adatok kiértékelése az elérhető legrészletesebb szinten, és cselekvés. Ez a kiadvány tovább szűkíti a fókuszt egy „új szakaszban, amely az egyénre szabott közegészségügyi intézkedések megfontolásairól szól, amelyek a COVID-2 oltást vagy múltbeli fertőzést követően egy személy SARS-CoV-19 immunitási állapotán alapulnak”.

Követheti a COVID a Zika trendjét?

 

Zika esetek száma az Egyesült Államokban és területeken

 

Panama és világszerte az adatok hasonló tendenciákat mutatnak a Zika-esetek esetében. A tipikus progresszió az, hogy a járványok járványokká csökkennek, majd az endémiák időszakosan kitörnek. Ma visszatekinthetünk a Zika-járványra. A remény szavait ajánlom. Az adatokkal, a tapasztalattal és az idővel a koronavírus, akárcsak a Zika vírus és az azt megelőző vírusok, befut a maga útján.

További olvasmányok: Érdekes, de egyszerűen nem illett

 

Hogyan ért véget a világ 5 legrosszabb járványa? a History Channelről

A pandémiák rövid története (Pandémiák a történelem során)

Hogyan végződnek a járványok? A történelem azt sugallja, hogy a betegségek elmúlnak, de szinte soha nem múltak el igazán

Végül egy újabb fegyver a Covid ellen 

Hogyan ad a Poop tippeket a koronavírus terjedésére?

Az igazság a koronavírus-kakipánik mögött

 

BI/Analytics
Analytics katalógusok – Feltörekvő csillag az Analytics ökoszisztémában

Analytics katalógusok – Feltörekvő csillag az Analytics ökoszisztémában

Bevezetés Technológiai vezérigazgatóként (CTO) mindig azon új technológiákat keresem, amelyek megváltoztatják az analitika megközelítését. Az egyik ilyen technológia, amely felkeltette a figyelmemet az elmúlt néhány évben, és óriási ígéretekkel bír, az az Analytics...

KATT ide