Lawan Virus COVID-19 dengan Data

by Jan 17, 2022BI/Analitikkomentar 0

Penolakan tanggung jawab

 

Jangan lewatkan paragraf ini. Saya ragu untuk mengarungi perdebatan, sering kali perairan politik, tetapi sebuah pikiran datang kepada saya ketika saya sedang berjalan-jalan dengan anjing saya, Demic. Saya mendapatkan gelar MD dan telah berada dalam beberapa bentuk perawatan kesehatan atau konsultasi sejak itu. Selama 20+ tahun terakhir, saya telah belajar berpikir kritis. Untuk tim IBM yang saya bahas di artikel, saya bertindak sebagai Data Scientist. Saya mengatakan bahwa saya berbicara bahasa kedokteran dan data. Saya bukan ahli epidemiologi atau ahli kesehatan masyarakat. Ini tidak dimaksudkan untuk menjadi pembelaan atau kritik terhadap individu atau kebijakan tertentu. Apa yang saya sajikan di sini hanyalah pengamatan. Ini adalah harapan saya untuk menggerakkan pikiran Anda, juga.    

 

Memerangi Zika Dengan Data

 

Pertama, pengalaman saya. Pada tahun 2017, saya dipilih oleh IBM dari lebih dari 2000 pelamar, untuk berpartisipasi dalam proyek kesehatan masyarakat pro bono. Sebuah tim yang terdiri dari lima orang dikirim ke negara Panama selama sebulan untuk bekerja dengan departemen kesehatan masyarakat di sana. Misi kami adalah untuk membuat digital alat yang akan memfasilitasi pengambilan keputusan yang lebih cepat dan efektif terkait dengan beberapa penyakit menular yang ditularkan oleh nyamuk; yang utama adalah Zika. 

Solusinya adalah saluran berbagi informasi antara peneliti lapangan dan pembuat kebijakan untuk mengendalikan Zika dan penyakit menular lainnya. Dengan kata lain, kami mengembangkan aplikasi seluler untuk menggantikan proses manual lama mereka dalam mengirimkan inspektur vektor ke lapangan. Data yang tepat waktu dan akurat mengurangi ukuran dan durasi wabah dengan dapat menargetkan area yang lebih strategis – pikirkan blok kota – yang membutuhkan perbaikan.  

Sejak saat itu, pandemi Zika telah berjalan dengan sendirinya.  

Tindakan manusia tidak mengakhiri pandemi Zika. Komunitas kesehatan masyarakat bekerja untuk mengatasinya, melalui diagnosa, pendidikan dan nasihat perjalanan. Tetapi pada akhirnya, virus itu berjalan dengan sendirinya, menginfeksi sebagian besar populasi, dan kekebalan kelompok berkembang, sehingga menghentikan penyebaran.  Saat ini, Zika dianggap endemik di beberapa bagian dunia dengan periode berjerawat.

Infografis Transmisi ZikaDi beberapa paling awal dan pandemi paling mematikan hampir semua orang yang sakit meninggal. Dengan Zika, “Begitu sebagian besar populasi terinfeksi, mereka kebal dan mereka benar-benar melindungi orang lain agar tidak terinfeksi [tidak ada vaksin untuk melindungi terhadap Zika].”  Itulah yang terjadi dengan Zika. Wabah sudah berakhir di Amerika dan kejadian Zika sekarang pada tahun 2021 sangat rendah. Itu adalah berita bagus! Zika memuncak pada tahun 2016 tepat ketika pejabat Panama meminta IBM untuk mengirim bantuan untuk memerangi nyamuk. Transmisi Zika | Virus Zika | CDC

Korelasi bukan hubungan sebab-akibat, tetapi setelah kunjungan kami ke Panama, pandemi Zika terus mereda. Ada wabah sesekali, tetapi sejak itu belum mencapai tingkat kekhawatiran yang sama. Beberapa mengharapkan pendulum untuk berayun kembali sebagai kekebalan alami berkurang dan individu yang tidak terpapar bermigrasi ke zona berisiko tinggi Zika.

 

Paralel Pandemi Zika dan COVID-19

 

Bagaimana ini berhubungan dengan COVID-19? Patogen yang bertanggung jawab atas COVID-19 dan Zika adalah virus. Mereka memang memiliki bentuk transmisi utama yang berbeda. Zika terutama ditularkan dari nyamuk ke manusia. Ada peluang penularan dari manusia ke manusia, tetapi bentuk utama penularannya adalah langsung dari nyamuk.

Untuk virus corona, telah ditunjukkan bahwa beberapa hewan, seperti kelelawar dan rusa, memang membawa virus, tapi bentuk utamanya transmisi adalah manusia ke manusia.

Dengan penyakit yang dibawa nyamuk (Zika, Chikungunya, demam berdarah), salah satu tujuan kementerian kesehatan masyarakat Panama adalah meminimalkan paparan virus dengan mengurangi paparan vektor. Di AS, selain vaksin yang berkembang pesat, kesehatan masyarakat primer langkah-langkah untuk mengatasi COVID termasuk mengurangi paparan dan membatasi penyebaran ke orang lain. Langkah-langkah mitigasi bagi mereka yang berisiko tinggi antara lain masker, jarak fisik, isolasi dan menutup bar lebih awal.

Penanggulangan kedua penyakit itu tergantung… ok, mungkin di sinilah kontroversinya. Selain pendidikan dan berbagi data, tujuan kesehatan masyarakat dari pencegahan hasil yang paling parah dapat difokuskan pada 1. pemberantasan virus, 2. pemberantasan vektor, 3. vaksinasi/perlindungan yang paling rentan (individu dengan risiko tertinggi untuk hasil yang buruk), 4. kekebalan kelompok, atau 5. beberapa kombinasi di atas.  

Karena vektor pada hewan lain, tidak mungkin untuk membasmi virus ini (kecuali jika Anda mulai memvaksinasi nyamuk dan kelelawar, saya rasa). Saya pikir juga tidak masuk akal untuk membicarakan pemberantasan vektor juga. Nyamuk adalah pengganggu, selain membawa penyakit berbahaya, tapi saya yakin mereka memiliki tujuan yang berguna. Saya tidak bisa membayangkan membuat bentuk kehidupan punah karena mereka mengganggu manusia.  

Jadi, mari kita bicara tentang vaksinasi/perlindungan kelompok risiko tinggi dan kekebalan kelompok. Jelas, kita cukup jauh ke dalam pandemi ini sehingga pejabat kesehatan masyarakat dan pemerintah telah membuat keputusan ini dan telah memutuskan tindakan. Saya tidak menebak-nebak pendekatan atau bahkan melempar batu dengan melihat ke belakang dengan sempurna.  

Individu dengan risiko lebih tinggi termasuk orang dewasa yang lebih tua 65 tahun dan lebih tua dan mereka yang memiliki kondisi medis serius yang mendasarinya; hal-hal seperti kondisi jantung, diabetes, obesitas, immunocompromised, dll. Untuk itu kami akan menambahkan ibu hamil untuk Zika karena dapat ditransfer intrautero. 

Kekebalan kawanan adalah ketika populasi tertentu mencapai persentase individu yang dilindungi dari penyakit baik dengan vaksin atau melalui kekebalan alami. Pada saat itu, bagi mereka yang tidak kebal, risiko penyakitnya rendah, karena pembawanya sangat sedikit. Dengan demikian, mereka yang berisiko tinggi dilindungi oleh mereka yang telah terpapar sebelumnya. Masih ada perdebatan tentang berapa persen populasi yang realistis (divaksinasi + pulih dengan antibodi) yang diperlukan untuk membentuk kekebalan kelompok untuk virus corona.

 

Perang di Panama

 

Dengan IBM Inisiatif Zika di Panama, kami dapat mengembangkan aplikasi berbasis telepon waktu nyata dengan penandaan geolokasi, yang dapat mengurangi tingkat keparahan dan durasi wabah jika diterapkan sepenuhnya. Dengan mengganti pencatatan dan pelaporan yang padat karya dan rawan kesalahan, data mencapai pengambil keputusan dalam hitungan jam, bukan minggu. Pejabat kesehatan masyarakat di tingkat nasional dapat membandingkan laporan lokasi real-time dari nyamuk pembawa penyakit dengan pelaporan real-time kasus klinis yang dirawat di rumah sakit. Dalam perang melawan virus Zika, para pejabat ini kemudian mengarahkan sumber daya ke lokasi-lokasi tertentu untuk membasmi nyamuk di daerah itu. 

Jadi, alih-alih abroad pendekatan sikat untuk memerangi penyakit, mereka memusatkan upaya mereka pada area masalah dan area masalah potensial. Dengan melakukan itu, mereka lebih mampu memfokuskan sumber daya dan mampu lebih cepat memadamkan titik-titik panas.

Dengan semua itu sebagai latar belakang, saya akan mencoba menarik beberapa persamaan antara pandemi Zika dan pandemi COVID kita saat ini. Satu belajar dalam Journal of Midwifery & Women's Health melakukan survei literatur klinis dan menentukan, “Ada kesamaan yang signifikan antara penyakit [virus Zika] dan COVID-19 dalam hal teknik diagnostik, terapi, dan ketidakpastian prognostik yang terbatas.” Dalam kedua pandemi, pasien dan dokter kekurangan informasi untuk membuat keputusan yang tepat. Pesan kesehatan masyarakat seringkali bertentangan di dalam institusi yang sama. Disinformasi disebarluaskan di platform media sosial setiap masa pandemi. Debat ilmiah yang serius bahkan berujung pada teori konspirasi. Tidak sulit untuk membayangkan bahwa masing-masing tanggapan berdampak negatif terhadap virus pada individu yang rentan atau berisiko tinggi.

 

Perbandingan Virus Zika dan COVID-19: Gambaran Klinis dan Publik Pesan Kesehatan

 

Penyakit Virus Zika COVID-19
vektor Flavivirus: vektor nyamuk Aedes aegypti dan Aedes albopictus 3 Coronavirus: tetesan, fomites 74
Transmisi Nyamuk adalah vektor utama

Transmisi seksual 10

Ditularkan melalui transfusi darah, paparan laboratorium 9

Ditularkan melalui tetesan pernapasan 74

Kemungkinan penularan melalui udara 75

Penularan vertikal selama kehamilan Penularan vertikal dari orang hamil ke janin terjadi, dan kemungkinan besar terjadi infeksi kongenital 9 Penularan vertikal/infeksi kongenital tidak mungkin terjadi 76
Gejala Seringkali tanpa gejala; gejala seperti flu ringan seperti demam, artralgia, ruam, dan konjungtivitis 3 Tanpa gejala; juga meniru rhinorrhea normal dan dispnea fisiologis kehamilan 65
Pengujian diagnostik Serologi RT-PCR, NAAT, PRNT, IgM 32

Tingginya tingkat negatif palsu dan positif 26

Reaksi silang serologi imunoglobulin dengan flavivirus endemik lainnya, seperti virus demam berdarah 26

Diagnosis perinatal dibatasi oleh sensitivitas dan spesifisitas USG untuk mendeteksi cedera virus 20

Serologi RT-PCR, NAAT, IgM 42

Sensitivitas bervariasi menurut waktu dari paparan, teknik pengambilan sampel, sumber spesimen 76

Tes antigen cepat (COVID-19 Ag Respi-Strip) tersedia, tetapi ada kekhawatiran tentang validitas, akurasi, dan kinerjanya 76

Kurangnya kapasitas pengujian dan reagen laboratorium yang berkelanjutan 42

Terapi Perawatan suportif

Sindrom Zika kongenital memerlukan perawatan khusus, terapi fisik, farmakoterapi untuk gangguan kejang, koreksi/prostetik untuk defisit pendengaran dan optik 23

Perawatan suportif

Remdesivir tampaknya aman pada kehamilan

Terapi lain (ribavirin, baricitinib) bersifat teratogenik, embriotoksik 39

 

Singkatan: COVID-19, penyakit coronavirus 2019; IgM, imunoglobulin kelas M; NAAT, uji amplifikasi asam nukleat; PRNT, uji netralisasi pengurangan plak; RT-PCR, uji reaksi berantai transkripsi balik polimerase.

Artikel ini tersedia secara gratis melalui PubMed Central sebagai bagian dari tanggap darurat kesehatan masyarakat COVID-19. Hal ini dapat digunakan untuk penelitian yang tidak terbatas penggunaan kembali dan analisis dalam bentuk apapun atau dengan cara apapun dengan pengakuan sumber aslinya, selama darurat kesehatan masyarakat. (diedit oleh penulis)

Dalam pengalaman Zika kami di Panama, inspeksi dari pintu ke pintu mencari nyamuk. Hari ini, kami menggunakan tes COVID untuk mencari virus corona. Keduanya mencari bukti virus, yang disebut sebagai pemeriksaan vektor. Inspeksi vektor mencari bukti pembawa potensial virus dan kondisi yang memungkinkannya berkembang.  

 

Membandingkan COVID-19 dengan Pandemi Sebelumnya

 

Dibandingkan dengan epidemi baru-baru ini lainnya, tingkat COVID-19 sebagai salah satu yang lebih menyebar dalam hal negara yang terkena dampak dan jumlah kasus yang diidentifikasi. Untungnya, Case Fatality Rate (CFR) lebih rendah dari epidemi besar lainnya.  

 

 

 

 

Sumber:    Bagaimana Coronavirus Dibandingkan dengan SARS, Flu Babi, dan Epidemi Lainnya

 

Coronavirus menempati peringkat lebih mematikan daripada beberapa penyakit lain yang tidak termasuk dalam grafik ini. Wabah flu babi (H2009N1) 1 menginfeksi antara 700 juta dan 1.4 miliar orang di seluruh dunia, tetapi memiliki CFR 0.02%. Juga tidak ada dalam bagan ini adalah 500,000 kasus dugaan virus Zika pada tahun 2015 dan 2016 dan 18 kematiannya. Untuk membuat COVID-19 lebih terkini, per Desember 2021, Worldomet adalah situs web pelacakan coronavirus menempatkan jumlah kasus pada 267,921,597 dengan 5,293,306 kematian untuk CFR yang dihitung sebesar 1.98%. Karena COVID-19 bisa tanpa gejala seperti yang dijelaskan dalam studi Journal of Midwifery & Women's Health, mereka bahkan mungkin tidak tahu bahwa mereka sakit. Tidak ada alasan bagi orang-orang ini untuk mencari tes sehingga mereka tidak menjadi bagian dari penyebut. Dengan kata lain, skenario ini dapat menyebabkan tingkat kasus COVID-19 lebih tinggi dari yang ditunjukkan statistik.

Pada fase awal pandemi, data dari pemodelan epidemiologi, diagnosis klinis, dan kemanjuran pengobatan seringkali langka. Strategi pada fase awal termasuk meningkatkan pengujian dan pelaporan, komunikasi, dan mencoba mempersiapkan kapasitas yang diantisipasi untuk vaksin, pengujian dan pengobatan. Setiap orang kemudian, sadar atau tidak, membuat penilaian risiko individu berdasarkan pemahaman mereka tentang tingkat keparahan risiko, kemampuan yang mereka rasakan untuk menghadapi ancaman dan konsekuensi dari ancaman tersebut. Dalam masyarakat saat ini, kepercayaan tersebut kemudian diperkuat atau dilemahkan oleh pola makan media sosial dan sumber informasi.

Jadwal Tes Covid-19

Tes COVID mengevaluasi keberadaan coronavirus. Tergantung jenis uji diberikan, hasil positif akan menunjukkan bahwa pasien memiliki infeksi aktif (tes PCR molekuler cepat atau tes antigen laboratorium) atau pernah mengalami infeksi di beberapa titik (tes antibodi).  

Jika seseorang memiliki gejala yang konsisten dengan COVID dan tes antigen virus positif, tindakan diperlukan. Tindakan itu akan membunuh virus dan menghentikan penyebarannya. Tetapi, karena virus corona sangat menular, individu dengan gejala ringan dan tidak ada kondisi lain yang mendasarinya, ahli merekomendasikan asumsi tes positif dan karantina sendiri selama 10 hari hingga dua minggu. [UPDATE: Pada akhir Desember 2021, CDC mempersingkat periode isolasi yang direkomendasikan untuk individu yang memiliki COVID menjadi 5 hari diikuti dengan 5 hari menutupi orang lain. Bagi mereka yang terpapar kasus virus yang diketahui, CDC merekomendasikan karantina 5 hari ditambah 5 hari penutupan untuk yang tidak divaksinasi. Atau, 10 hari masking jika divaksinasi dan dikuatkan.] Masih lainnya ahli merekomendasikan untuk mengobati individu tanpa gejala jika mereka memiliki tes antigen COVID yang positif. (Penelitian, bagaimanapun, menunjukkan bahwa infektivitas individu tanpa gejala lemah. Tantangannya, bagaimanapun, adalah membedakan asimtomatik dari presimptomatik yang menular.) Virus dibunuh dengan merawat pasien, memungkinkan sistem pertahanan tubuh untuk meningkatkan respons, dan mengisolasi pasien saat mereka menular. Pencegahan dan intervensi dini adalah kunci untuk mengelola pandemi. Ini yang sekarang akrab, “perataan kurva. "

Meratakan KurvaDalam menangani Zika, rekomendasi kesehatan masyarakat termasuk mengambil tindakan pencegahan di rumah yang akan mencegah inkubasi dan pertumbuhan nyamuk – hilangkan genangan air di halaman Anda, singkirkan reservoir potensial seperti ban bekas. Demikian pula, rekomendasi untuk mengurangi penyebaran dari coronavirus termasuk jarak fisik, masker dan peningkatan kebersihan, seperti mencuci tangan dan membuang tisu bekas secara aman.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ (“Faktor eksternal seperti jejaring sosial dan sumber informasi dapat memperkuat atau melemahkan persepsi risiko.”)

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Apa yang tidak saya lihat dalam pandemi COVID saat ini adalah pendekatan yang terfokus, didorong oleh data, dan ditargetkan. Bahkan di Panama, pendekatan kesehatan masyarakat terhadap pandemi Zika bukanlah satu ukuran untuk semua. Itu tidak praktis – karena sumber daya terbatas – untuk memerangi nyamuk di semua lini dan tidak mungkin untuk menghilangkan semua vektor yang mungkin. Jadi, sumber daya didedikasikan untuk mereka yang berisiko tinggi berdasarkan geografi dan kondisi yang mendasarinya.  

 

Kesehatan Masyarakat dan Tindakan Sosial COVID-19

 

Dengan pandemi COVID-19, juga tidak praktis untuk menjaga semua orang agar tidak jatuh sakit. Apa yang telah kami pelajari adalah bahwa lebih masuk akal untuk memprioritaskan intervensi kesehatan masyarakat kepada yang paling rentan dan populasi yang berisiko terhadap hasil medis yang paling miskin. Jika kita mengikuti ekonomi, kita memiliki data untuk membenarkan mendedikasikan lebih banyak sumber daya dan tindakan pengendalian untuk: Poster Keselamatan Pedoman Covid CDC

  • Daerah dengan kepadatan penduduk yang tinggi – geografis maupun situasional – kota, transportasi umum dan perjalanan udara.
  • Institusi yang memiliki orang-orang dengan kondisi mendasar yang akan berkontribusi pada hasil yang merugikan jika mereka tertular virus corona – rumah sakit, klinik
  • Individu dengan risiko kematian yang lebih tinggi jika tertular COVID-19, yaitu: tua di panti jompo, komunitas pensiunan.
  • Negara-negara dengan iklim yang lebih kondusif untuk replikasi virus corona. WHO memperingatkan bahwa virus menyebar di semua iklim, tetapi ada variasi musiman yang menunjukkan lonjakan pada bulan-bulan musim dingin
  • Individu dengan gejala memiliki risiko lebih tinggi menularkan penyakit kepada orang lain. Pengujian harus difokuskan pada populasi ini dan tindakan diambil dengan cepat untuk mengisolasi dan mengobati.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Tampaknya file Rekomendasi sementara WHO Juni 2021 sedang condong ke arah ini. Rekomendasi baru termasuk kesehatan masyarakat dan tindakan sosial yang “disesuaikan dengan konteks lokal”. Pedoman WHO menyatakan bahwa “langkah-langkah [kesehatan masyarakat dan sosial] harus dilaksanakan oleh tingkat administrasi terendah yang memungkinkan penilaian situasional dan disesuaikan dengan pengaturan dan kondisi lokal.” Dengan kata lain, mengevaluasi data pada tingkat paling terperinci yang tersedia dan mengambil tindakan. Publikasi ini juga semakin mempersempit fokus dalam “bagian baru tentang pertimbangan untuk tindakan kesehatan masyarakat individual berdasarkan status kekebalan SARS-CoV-2 seseorang setelah vaksinasi COVID-19 atau infeksi masa lalu”.

Bisakah COVID Mengikuti Tren Zika?

 

Jumlah Kasus Zika di AS dan Wilayah

 

Panama dan industri udang di seluruh dunia. data menunjukkan tren serupa untuk kasus Zika. Itu perkembangan khas adalah bahwa pandemi berkurang menjadi epidemi, kemudian endemik dengan wabah berkala. Hari ini, kita dapat melihat kembali pandemi Zika. Saya menawarkan kata harapan. Dengan data, pengalaman dan waktu, virus corona, seperti virus Zika dan semua virus sebelumnya, akan berjalan dengan sendirinya.

Bacaan Tambahan: Menarik, tapi Tidak Pas

 

Bagaimana 5 Pandemi Terburuk di Dunia Berakhir dari Saluran Sejarah

Sejarah Singkat Pandemi (Pandemi Sepanjang Sejarah)

Bagaimana pandemi berakhir? Sejarah menunjukkan penyakit memudar tetapi hampir tidak pernah benar-benar hilang

Akhirnya, Senjata Lain Melawan Covid 

Bagaimana Poop Menawarkan Petunjuk Tentang Penyebaran Coronavirus

Kebenaran Dibalik Kepanikan Kotoran Coronavirus

 

BI/AnalitikTak ada kategori
Rapikan Wawasan Anda: Panduan untuk Pembersihan Musim Semi Analytics

Rapikan Wawasan Anda: Panduan untuk Pembersihan Musim Semi Analytics

Rapikan Wawasan Anda Panduan Analisis Pembersihan Musim Semi Tahun baru dimulai dengan penuh kejutan; laporan akhir tahun dibuat dan diteliti, dan kemudian semua orang menyesuaikan diri dengan jadwal kerja yang konsisten. Saat hari semakin panjang dan pepohonan serta bunga bermekaran,...

Baca Selengkapnya