Борьба с вирусом COVID-19 с помощью данных

by 17 января, 2022BI/Аналитикакомментарии 0

Отказ от ответственности

 

Не пропускайте этот абзац. Я не решаюсь ввязываться в эти спорные, часто политические воды, но, когда я выгуливал свою собаку Демика, мне пришла в голову одна мысль. Я получил степень доктора медицины и с тех пор занимаюсь какой-либо формой здравоохранения или консультирования. За последние 20 с лишним лет я научился критическому мышлению. В команде IBM, которую я обсуждаю в статье, я выступал в роли Data Scientist. Я говорю, что говорю на языках медицины и данных. Я не эпидемиолог и не эксперт в области общественного здравоохранения. Это не предназначено для защиты или критики какого-либо конкретного человека или политики. То, что я привожу здесь, — это просто наблюдения. Я также надеюсь расшевелить ваши мысли.    

 

Борьба с вирусом Зика с помощью данных

 

Во-первых, мой опыт. В 2017 году IBM выбрала меня из более чем 2000 претендентов для участия в проекте общественного здравоохранения на безвозмездной основе. Наша команда из пяти человек была отправлена ​​на месяц в Панаму для работы с тамошним отделом здравоохранения. Нашей миссией было создание digital инструмент, который способствовал бы более быстрому и эффективному принятию решений в отношении нескольких инфекционных заболеваний, переносимых комарами; главный из них - Зика. 

Решением стал канал обмена информацией между полевыми исследователями и политиками для борьбы с лихорадкой Зика и другими инфекционными заболеваниями. Другими словами, мы разработали мобильное приложение, чтобы заменить их устаревший ручной процесс отправки векторных инспекторов в поле. Своевременные и точные данные позволили сократить размер и продолжительность вспышки за счет возможности более точного стратегического нацеливания на районы (например, городской квартал), которые нуждаются в восстановлении.  

С тех пор пандемия Зика исчерпала себя.  

Действия человека не положили конец пандемии Зика. Сообщество общественного здравоохранения работало над его сдерживанием с помощью диагностики, образования и рекомендаций по поездкам. Но в конечном итоге вирус исчерпал себя, заразив большую часть населения, и выработался коллективный иммунитет, что остановило распространение.  Сегодня лихорадка Зика считается эндемичной в некоторых частях мира с менструальными вспышками.

Инфографика передачи вируса ЗикаВ некоторых из раннее и самые смертоносные пандемии, почти все, кто заболел, умерли. Что касается вируса Зика, «когда большая часть населения заражается, у них появляется иммунитет, и они фактически защищают других людей от заражения [вакцины для защиты от вируса Зика не существует]».  Так случилось с Зика. Вспышка в Америке закончилась, и заболеваемость Зика сейчас, в 2021 году, очень низкая. Это отличная новость! Пик заболеваемости вирусом Зика пришелся на 2016 год, когда официальные лица Панамы обратились к IBM с просьбой прислать помощь для борьбы с комарами. Трансмиссия Зика | Вирус Зика | CDC

Корреляция не является причинно-следственной, но после нашего визита в Панаму пандемия Зика продолжала ослабевать. Время от времени случаются вспышки, но с тех пор они не достигли такого же уровня беспокойства. Некоторые ожидают, что маятник качнется в обратную сторону по мере ослабления естественного иммунитета и миграции незараженных людей в зоны высокого риска заражения вирусом Зика.

 

Параллели пандемии вируса Зика и COVID-19

 

Как это связано с COVID-19? Оба патогена, ответственные за COVID-19 и Зика, являются вирусами. У них действительно разные первичные формы передачи. Зика в основном передается от комаров человеку. Существуют возможности передачи от человека к человеку, но основной формой передачи является непосредственно комар.

Для коронавируса было показано, что некоторые животные, такие как летучие мыши и олень, переносят вирус, но основная форма в мозге является человеком человеку.

В отношении болезней, переносимых комарами (зика, чикунгунья, лихорадка денге), одной из целей министерства здравоохранения Панамы было свести к минимуму воздействие вируса за счет снижения воздействия переносчика. В США, помимо быстро разрабатываемой вакцины, первичное общественное здравоохранение меры по борьбе с COVID включают снижение воздействия и ограничение распространения среди других. Меры по смягчению последствий для тех, кто подвергается высокому риску, включают ношение масок, физическое дистанцирование, изоляцию и рано закрывать бары.

Сдерживание обеих болезней зависит от… ладно, может быть, именно здесь возникает спор. В дополнение к просвещению и обмену данными цели общественного здравоохранения по предотвращению наиболее тяжелых исходов могут быть сосредоточены на 1. ликвидации вируса, 2. ликвидации переносчика, 3. вакцинации/защите наиболее уязвимых (лиц, подвергающихся наибольшему риску). для плохого исхода), 4. коллективный иммунитет или 5. какая-либо комбинация вышеперечисленного.  

Из-за того, что переносчиками являются другие животные, уничтожить эти вирусы невозможно (полагаю, если вы не начнете вакцинировать комаров и летучих мышей). Об искоренении переносчиков, я думаю, тоже говорить не имеет смысла. Комары неприятны, кроме того, что они переносят вредные болезни, но я уверен, что они служат какой-то полезной цели. Я не могу представить, чтобы формы жизни вымерли, потому что они мешают людям.  

Итак, поговорим о вакцинации/защите групп высокого риска и коллективном иммунитете. Очевидно, что мы достаточно далеко зашли в этой пандемии, чтобы чиновники общественного здравоохранения и правительства уже приняли эти решения и определили курс действий. Я не сомневаюсь в подходе и даже не бросаю камни задним числом.  

Лица с повышенным риском включают пожилых людей в возрасте 65 лет и старше и лиц с серьезными сопутствующими заболеваниями; такие вещи, как сердечные заболевания, диабет, ожирение, ослабленный иммунитет и т. д. К ним мы бы добавили беременные женщины для Зика, потому что он может передаваться внутриутробно. 

Коллективный иммунитет когда конкретная популяция достигает определенного процента людей, которые защищены от болезни либо вакциной, либо естественным иммунитетом. В этот момент для тех, у кого нет иммунитета, риск заболевания низок, потому что носителей очень мало. Таким образом, те, кто подвергается высокому риску, защищены теми, кто ранее подвергался воздействию. Продолжаются споры о том, какой реальный процент населения (вакцинированных + выздоровевших с антителами) потребуется для формирования коллективного иммунитета к коронавирусу.

 

Война в Панаме

 

С IBM Инициатива Зика в Панаме нам удалось разработать телефонное приложение, работающее в режиме реального времени, с маркировкой геолокации, которое при полном внедрении может уменьшить как серьезность, так и продолжительность вспышек. Заменив трудоемкую и подверженную ошибкам регистрацию и отчетность, данные доходили до лиц, принимающих решения, за часы, а не за недели. Должностные лица общественного здравоохранения на национальном уровне смогли сравнить в режиме реального времени отчеты о местонахождении комаров-переносчиков болезней с отчетами о госпитализированных клинических случаях в режиме реального времени. В ходе войны с вирусом Зика эти чиновники затем направили ресурсы в эти конкретные места для уничтожения комаров в этом районе. 

Итак, вместо абroad щеточный подход к борьбе с болезнью, они концентрировали свои усилия на проблемных зонах и потенциальных проблемных зонах. При этом они смогли лучше сосредоточить ресурсы и смогли быстрее погасить горячие точки.

Учитывая все это в качестве фона, я попытаюсь провести некоторые параллели между пандемией Зика и нашей нынешней пандемией COVID. Один Исследование в Journal of Midwifery & Women's Health провели обзор клинической литературы и определили: «Существуют значительные параллели между болезнью [вирусом Зика] и COVID-19 с точки зрения ограниченных методов диагностики, терапии и прогностической неопределенности». В обеих пандемиях пациентам и врачам не хватало информации для принятия обоснованных решений. Сообщения общественного здравоохранения часто были противоречивыми в рамках одного и того же учреждения. Дезинформация распространялась в социальных сетях во время каждой пандемии. Серьезные научные дебаты даже привели к появлению теорий заговора. Нетрудно представить, что каждый из этих факторов негативно влиял на реакцию на вирусы у уязвимых или подверженных высокому риску людей.

 

Сравнение вируса Зика и COVID-19: клинический обзор и Сообщения о здоровье

 

Вирусная болезнь Зика COVID-19
вектор Флавивирус: комары-переносчики Aedes aegypti и Aedes albopictus. 3 Коронавирус: капли, фомиты 74
коробка передач Комары являются основным переносчиком

Сексуальная передача 10

Передается при переливании крови, лабораторном контакте 9

Передается воздушно-капельным путем 74

Возможна передача воздушно-капельным путем 75

Вертикальная передача во время беременности Происходит вертикальная передача от беременной к плоду, и вероятна врожденная инфекция. 9 Вертикальная передача/врожденная инфекция маловероятна 76
симптомы Часто бессимптомно; легкие гриппоподобные симптомы, такие как лихорадка, артралгия, сыпь и конъюнктивит 3 бессимптомный; также имитирует нормальную ринорею и физиологическую одышку беременных. 65
Диагностическое тестирование ОТ-ПЦР, МАНК, PRNT, серология IgM 32

Высокий процент ложноотрицательных и положительных результатов 26

Перекрестная реакция иммуноглобулиновых серологий с другими эндемичными флавивирусами, такими как вирус лихорадки денге. 26

Перинатальная диагностика ограничена чувствительностью и специфичностью УЗИ для выявления вирусного поражения. 20

ОТ-ПЦР, МАНК, серология IgM 42

Чувствительность варьируется в зависимости от времени с момента воздействия, метода отбора проб, источника образца. 76

Экспресс-тесты на антигены (COVID-19 Ag Respi-Strip) доступны, но есть опасения по поводу их достоверности, точности и эффективности. 76

Постоянная нехватка испытательных мощностей и лабораторных реагентов 42

терапевтика Поддерживающая терапия

Врожденный синдром Зика требует специализированного ухода, физиотерапии, фармакотерапии при судорожных расстройствах, коррекции/протезирования нарушений слуха и зрения. 23

Поддерживающая терапия

Ремдесивир безопасен при беременности

Другие препараты (рибавирин, барицитиниб) тератогенны, эмбриотоксичны. 39

 

Сокращения: COVID‐19, коронавирусная болезнь 2019 г.; IgM, иммуноглобулин класса М; МАНК, тест амплификации нуклеиновых кислот; PRNT, тест нейтрализации уменьшения зубного налета; ОТ-ПЦР, полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией.

Эта статья находится в свободном доступе через PubMed Central в рамках мер реагирования на чрезвычайную ситуацию в области общественного здравоохранения COVID-19. Его можно использовать для неограниченного повторного использования и анализа в исследованиях в любой форме и любыми средствами с указанием первоисточника на время чрезвычайной ситуации в области общественного здравоохранения. (отредактировано автором)

В нашем опыте с вирусом Зика в Панаме при поквартирном досмотре искали комаров. Сегодня мы используем тесты COVID для поиска коронавируса. Оба ищут доказательства наличия вируса, что называется проверкой переносчиков. Инспекция вектора ищет доказательства потенциальных носителей вируса и условий, которые позволяют ему процветать.  

 

Сравнение COVID-19 с предыдущими пандемиями

 

По сравнению с другими недавними эпидемиями COVID-19 считается одной из наиболее широко распространенных с точки зрения пораженных стран и количества выявленных случаев. К счастью, коэффициент летальности (CFR) ниже, чем при других крупных эпидемиях.  

 

 

 

 

Источник:    Как коронавирус сравнивается с атипичной пневмонией, свиным гриппом и другими эпидемиями

 

Коронавирус считается более смертоносным, чем пара других заболеваний, не включенных в эту таблицу. Вспышка свиного гриппа (H2009N1) в 1 году заразила от 700 миллионов до 1.4 миллиарда человек во всем мире, но имела CFR 0.02%. Также на этой диаграмме нет 500,000 2015 случаев подозрения на вирус Зика в 2016 и 18 годах и 19 смертей от него. Чтобы сделать COVID-2021 более актуальным, по состоянию на декабрь XNUMX г. Worldomet является Веб-сайт отслеживания коронавируса оценил число случаев заболевания в 267,921,597 5,293,306 1.98 с 19 19 XNUMX смертельными исходами при расчетном CFR XNUMX%. Поскольку COVID-XNUMX может протекать бессимптомно, как описано в исследовании Journal of Midwifery & Women's Health, они могут даже не знать, что больны. У этих людей нет причин искать тест, чтобы они не оказались частью знаменателя. Другими словами, этот сценарий может привести к тому, что показатели заболеваемости COVID-XNUMX будут выше, чем показывает статистика.

На ранних стадиях пандемии данных эпидемиологического моделирования, клинической диагностики и эффективности лечения часто недостаточно. Стратегии на начальном этапе включают расширение тестирования и отчетности, коммуникации и попытки подготовить ожидаемые мощности для вакцин, тестирования и лечения. Затем каждый, независимо от того, сознателен он или нет, проводит индивидуальную оценку риска, основываясь на своем понимании серьезности риска, своей предполагаемой способности справиться с угрозой и последствиями угрозы. В современном обществе эти убеждения затем укрепляются или ослабевают из-за диеты социальных сетей и источников информации.

График тестирования на Covid-19

COVID тесты оценить наличие коронавируса. В зависимости от типа тестXNUMX положительный результат будет указывать либо на то, что у пациента имеется активная инфекция (быстрый молекулярный ПЦР-тест или лабораторные тесты на антигены), либо на то, что в какой-то момент у него была инфекция (тест на антитела).  

Если у человека есть симптомы, характерные для COVID, и положительный тест на вирусный антиген, необходимы действия. Это действие будет заключаться в том, чтобы убить вирус и остановить его распространение. Но, поскольку коронавирус настолько заразен, люди с легкими симптомами и без других основных заболеваний, эксперты рекомендуют предположить положительный тест и изолировать себя на срок от 10 дней до двух недель. [ОБНОВЛЕНИЕ ПО: В конце декабря 2021 года CDC сократил рекомендуемый период изоляции для лиц, инфицированных COVID, до 5 дней с последующим 5-дневным маскированием других людей. Для тех, кто подвергся воздействию известных случаев заражения вирусом, CDC рекомендует 5-дневный карантин плюс 5 дней маскировки для непривитых. Или 10 дней маскировки при вакцинации и ревакцинации.] Еще одно эксперты рекомендуют лечить бессимптомных людей, если у них есть положительный тест на антиген COVID. (В исследовании, однако, показывает, что заразность бессимптомных лиц слаба. Проблема, однако, состоит в том, чтобы отличить бессимптомное заболевание от предсимптомного, которое является заразным.) Вирус уничтожается путем лечения пациента, позволяя защитной системе организма среагировать и изолировать пациента, пока он заразен. Профилактика и раннее вмешательство являются ключом к борьбе с пандемией. Это уже знакомое,сглаживание кривой".

Сглаживание кривойИмея дело с Зика, рекомендации общественного здравоохранения включают принятие мер предосторожности дома, которые предотвратят инкубацию и рост комаров — устраните стоячую воду во дворе, удалите потенциальные резервуары, такие как старые шины. Так же, рекомендации по уменьшению распространения коронавируса включают физическое дистанцирование, маски и повышенную гигиену, например мытье рук и безопасную утилизацию использованных салфеток.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ («Внешние факторы, такие как социальные сети и источники информации, могут либо усилить, либо подорвать восприятие риска».)

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Чего я не вижу в нынешней пандемии COVID, так это целенаправленного, ориентированного на данные, целевого подхода. Даже в Панаме подход общественного здравоохранения к пандемии Зика не был универсальным. Было нецелесообразно — поскольку ресурсы ограничены — бороться с комарами на всех фронтах, и невозможно было устранить все возможные переносчики. Таким образом, ресурсы были выделены тем, кто подвергался наибольшему риску, в зависимости от географии и основных условий.  

 

COVID-19 Общественное здравоохранение и социальные меры

 

В условиях пандемии COVID-19 также нецелесообразно уберечь всех от заболевания. Мы узнали, что более целесообразно уделять приоритетное внимание вмешательству общественного здравоохранения наиболее уязвимым группам населения и группам населения, подверженным риску наихудших медицинских результатов. Если мы будем следовать экономическим соображениям, у нас есть данные, оправдывающие выделение дополнительных ресурсов и мер контроля для: Плакат по безопасности CDC Covid

  • Районы с высокой плотностью населения – как географические, так и ситуативные – города, общественный транспорт и авиасообщение.
  • Учреждения, в которых находятся люди с сопутствующими заболеваниями, которые могут привести к неблагоприятным исходам, если они заразятся коронавирусом, — больницы, поликлиники.
  • Лица с повышенным риском смертности в случае заражения COVID-19, а именно пожилой в домах престарелых, пенсионных домах.
  • Штаты с климатом, более благоприятным для размножения коронавируса. ВОЗ предупреждает что вирус распространяется во всех климатических условиях, но есть сезонные вариации, которые показывают всплески в зимние месяцы.
  • Люди с симптомами имеют более высокий риск передачи болезни другим. Тестирование должно быть сосредоточено на этой популяции, и должны быть быстро приняты меры по изоляции и лечению.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Похоже, что Промежуточные рекомендации ВОЗ, июнь 2021 г. склоняются в этом направлении. Новые рекомендации включают в себя меры общественного здравоохранения и социальные меры, «адаптированные к местным условиям». В руководстве ВОЗ указано, что «[общественные и социальные] меры должны осуществляться на самом низком административном уровне, для которого возможна ситуационная оценка, и с учетом местных условий и условий». Другими словами, оценка данных на самом детальном доступном уровне и принятие мер. Эта публикация также еще больше сужает фокус в «новом разделе, посвященном соображениям относительно индивидуальных мер общественного здравоохранения, основанных на статусе иммунитета человека к SARS-CoV-2 после вакцинации против COVID-19 или перенесенной инфекции».

Может ли COVID последовать тренду вируса Зика?

 

Число случаев заражения вирусом Зика в США и территориях

 

Панама и по всему миру данные показывают аналогичные тенденции для случаев Зика. То типичная прогрессия заключается в том, что пандемии переходят в эпидемии, а затем эндемии с периодическими вспышками. Сегодня мы можем оглянуться на пандемию Зика. Предлагаю слово надежды. Имея данные, опыт и время, коронавирус, как и вирус Зика, и все вирусы до него, пройдет своим чередом.

Дополнительное чтение: интересно, но не подходит

 

Как закончились 5 самых страшных пандемий в мире с Исторического канала

Краткая история пандемий (Пандемии на протяжении всей истории)

Как заканчиваются пандемии? История предполагает, что болезни исчезают, но почти никогда не исчезают

Наконец, еще одно оружие против Covid 

Как корма подсказывают о распространении коронавируса

Правда о панике из-за коронавируса

 

BI/АналитикаРазное
Почему Microsoft Excel является инструментом аналитики №1
Почему Excel является инструментом аналитики №1?

Почему Excel является инструментом аналитики №1?

  Это дешево и легко. Программное обеспечение для работы с электронными таблицами Microsoft Excel, вероятно, уже установлено на компьютере бизнес-пользователя. И многие пользователи сегодня знакомы с программным обеспечением Microsoft Office еще со школы или даже раньше. Этот рефлекторный ответ на...

Узнать больше

BI/АналитикаРазное
Наведите порядок в своих знаниях: руководство по аналитике. Весенняя уборка

Наведите порядок в своих знаниях: руководство по аналитике. Весенняя уборка

Наведите порядок в своих идеях. Руководство по аналитике. Весенняя уборка. Новый год начинается с трепета; Отчеты на конец года создаются и тщательно изучаются, а затем все приспосабливаются к последовательному графику работы. Дни становятся длиннее, а деревья и цветы цветут...

Узнать больше

BI/АналитикаРазное
Нью-йоркская пицца против чикагской: вкусные дебаты

Нью-йоркская пицца против чикагской: вкусные дебаты

В удовлетворении нашей тяги мало что может соперничать с радостью от горячего куска пиццы. Споры о пицце в нью-йоркском и чикагском стиле вызывали страстные дискуссии на протяжении десятилетий. Каждый стиль имеет свои уникальные особенности и преданных поклонников....

Узнать больше

BI/АналитикаКогнос Аналитика
Студия запросов Cognos
Вашим пользователям нужна их студия запросов

Вашим пользователям нужна их студия запросов

С выпуском IBM Cognos Analytics 12 давно объявленное прекращение поддержки Query Studio и Analysis Studio наконец было реализовано с версией Cognos Analytics без этих студий. Хотя это не должно стать неожиданностью для большинства людей, занимающихся...

Узнать больше

BI/АналитикаРазное
Реален ли эффект Тейлор Свифт?

Реален ли эффект Тейлор Свифт?

Некоторые критики предполагают, что она поднимает цены на билеты на Суперкубок. Ожидается, что Суперкубок в эти выходные войдет в тройку самых популярных событий в истории телевидения. Вероятно, больше, чем прошлогодние рекордные цифры, и, возможно, даже больше, чем на Луне 3 года...

Узнать больше

BI/Аналитика
Каталоги аналитики – восходящая звезда в экосистеме аналитики

Каталоги аналитики – восходящая звезда в экосистеме аналитики

Введение Как технический директор (CTO) я всегда ищу новые технологии, которые меняют наш подход к аналитике. Одной из таких технологий, которая привлекла мое внимание в последние несколько лет и которая имеет огромные перспективы, является Analytics...

Узнать больше