Boj proti virusu COVID-19 s podatki

by Jan 17, 2022BI/Analitika0 komentarji

Zavrnitev odgovornosti

 

Ne preskočite tega odstavka. Oklevam se prebiti v te sporne, pogosto politične vode, a med sprehajanjem svojega psa Demiča se mi je porodila misel. Prislužil sem si doktorat medicine in od takrat sem v neki obliki zdravstvenega varstva ali svetovanja. V zadnjih 20+ letih sem se naučil kritičnega razmišljanja. Za IBM-ovo ekipo, o kateri razpravljam v članku, sem deloval kot podatkovni znanstvenik. Pravim, da govorim jezike medicine in podatkov. Nisem epidemiolog ali strokovnjak za javno zdravje. To ni mišljeno kot obramba ali kritika posameznega posameznika ali politike. To, kar predstavljam tukaj, so zgolj opažanja. Upam, da bom prebudila tudi vaše misli.    

 

Boj proti virusu Zika s podatki

 

Najprej moja izkušnja. Leta 2017 me je IBM med več kot 2000 prijavljenimi izbral za sodelovanje v pro bono javnem zdravstvenem projektu. Ekipa petih nas je bila poslana za mesec dni v državo Panamo, da bi sodelovala s tamkajšnjim oddelkom za javno zdravje. Naše poslanstvo je bilo ustvariti a digital orodje, ki bi omogočilo hitrejše in učinkovitejše odločanje v zvezi z več nalezljivimi boleznimi, ki jih prenašajo komarji; glavni je Zika. 

Rešitev je bil cevovod za izmenjavo informacij med terenskimi raziskovalci in oblikovalci politike za nadzor Zika in drugih nalezljivih bolezni. Z drugimi besedami, razvili smo mobilno aplikacijo, ki je nadomestila njihov starodavni ročni postopek pošiljanja vektorskih inšpektorjev na teren. Pravočasni in natančni podatki so zmanjšali velikost in trajanje izbruha, saj so lahko bolje strateško ciljali na območja – pomislite na mestni blok –, ki potrebujejo sanacijo.  

Od takrat je pandemija zika tekla.  

Človeško delovanje ni končalo pandemije Zika. Javna zdravstvena skupnost si je prizadevala, da bi jo omejila z diagnostiko, izobraževanjem in svetovanjem pri potovanjih. Toda na koncu je virus tekel, okužil velik del populacije in razvila se je čredna imunost, s čimer se je širjenje ustavilo.  Danes je zika endemična v nekaterih delih sveta z izbruhi menstruacije.

Infografika prenosa ZikaV nekaterih od prej in najbolj smrtonosne pandemije so umrli skoraj vsi, ki so zboleli. Z Ziko: "Ko je velik delež prebivalstva okužen, so imuni in dejansko ščitijo druge ljudi pred okužbo [ni cepiva za zaščito proti Ziki]."  To se je zgodilo z Žiko. Izbruha je v Ameriki konec in incidenca zika v letu 2021 je zelo nizka. To je odlična novica! Zika je dosegla vrhunec leta 2016, ko so panamski uradniki prosili IBM, naj pošlje pomoč za boj proti komarjem. Zika prenos | Virus zika | CDC

Korelacija ni vzročna zveza, toda po našem obisku v Panami je pandemija zika še naprej pojenjala. Obstajajo občasni izbruhi, vendar od takrat ni doseglo enake zaskrbljenosti. Nekateri pričakujejo, da se bo nihalo zasukalo nazaj, ko naravna imunost oslabi in neizpostavljeni posamezniki migrirajo na območja z visokim tveganjem za Zika.

 

Vzporednice pandemije Zika in COVID-19

 

Kako je to povezano s COVID-19? Oba patogena, ki je odgovorna tako za COVID-19 kot za Zika, sta virusa. Imajo različne primarne oblike prenosa. Zika se večinoma prenaša s komarjev na ljudi. Obstajajo možnosti za prenos s človeka na človeka, vendar je glavna oblika prenosa neposredno s komarjem.

Za koronavirus se je izkazalo, da nekatere živali, kot je netopirji in jelen, sicer nosijo virus, vendar je glavna oblika prenos je človek človeku.

Pri boleznih, ki jih prenašajo komarji (Zika, Chikungunya, mrzlica denga), je bil eden od ciljev panamskega ministrstva za javno zdravje zmanjšati izpostavljenost virusu z zmanjšanjem izpostavljenosti vektorju. V ZDA je poleg hitro razvitega cepiva primarno javno zdravje ukrepi za boj proti COVID-u vključujejo zmanjšanje izpostavljenosti in omejevanje širjenja na druge. Omilitveni ukrepi za tiste, ki so ogroženi, so vključevali maskiranje, fizično distanciranje, izolacijo in predčasno zapiranje lokalov.

Zadrževanje obeh bolezni je odvisno od … ok, morda tukaj postane sporno. Poleg izobraževanja in izmenjave podatkov se lahko javnozdravstveni cilji preprečevanja najhujših izidov osredotočajo na 1. izkoreninjenje virusa, 2. izkoreninjenje vektorja, 3. cepljenje/zaščito najbolj ranljivih (posameznikov z največjim tveganjem). za slab izid), 4. čredna imunost ali 5. neka kombinacija naštetega.  

Zaradi vektorjev pri drugih živalih je teh virusov nemogoče izkoreniniti (menda če ne začnete cepiti komarjev in netopirjev). Mislim, da tudi ni smiselno govoriti o izkoreninjenju vektorjev. Komarji so poleg tega, da prenašajo škodljive bolezni, nadloga, a prepričan sem, da služijo nekemu koristnemu namenu. Ne morem si predstavljati, da bi neka življenjska oblika izumrla, ker so človeku nadloga.  

Torej, pogovarjajmo se o cepljenju/zaščiti rizičnih skupin in čredne imunosti. Očitno smo dovolj daleč v tej pandemiji, da so uradniki za javno zdravje in vlade že sprejeli te odločitve in se odločili, kako ukrepati. Ne dvomim o pristopu ali celo metanju kamnov s popolnim pogledom nazaj.  

Posamezniki z večjim tveganjem vključujejo starejše odrasle, stare 65 let in več, in tiste z resnimi osnovnimi zdravstvenimi težavami; stvari, kot so bolezni srca, sladkorna bolezen, debelost, oslabljen imunski sistem itd. Tem bi dodali nosečnice za Zika, ker se lahko prenese intrautero. 

Imuniteta črede je, ko določena populacija doseže odstotek posameznikov, ki so zaščiteni pred boleznijo bodisi s cepljenjem bodisi z naravno imunostjo. Takrat je pri tistih, ki niso imuni, tveganje za bolezen nizko, saj je nosilcev tako malo. Tako so ogrožene osebe zaščitene s tistimi, ki so bili predhodno izpostavljeni. Še vedno poteka razprava o tem, kolikšen realen odstotek populacije (cepljene + ozdravljene s protitelesi) bi bil potreben za oblikovanje čredne imunosti proti koronavirusu.

 

Vojna v Panami

 

Z IBM-ovimi Zika pobuda v Panami smo lahko razvili telefonsko aplikacijo v realnem času z označevanjem geolokacije, ki bi ob popolni implementaciji lahko zmanjšala tako resnost kot trajanje izbruhov. Z zamenjavo delovno intenzivnega in napačnega beleženja in poročanja so podatki prišli do odločevalcev v urah namesto v tednih. Uradniki za javno zdravje na nacionalni ravni so lahko v realnem času primerjali poročila o lokaciji komarjev, ki prenašajo bolezen, s poročanjem o hospitaliziranih kliničnih primerih v realnem času. V vojni proti virusu Zika so ti uradniki nato usmerili sredstva na te specifične lokacije za izkoreninjenje komarjev na tem območju. 

Torej, namesto abroad s čopičastim pristopom k boju proti bolezni, so svoja prizadevanja osredotočili na problematična področja in potencialna problematična področja. Pri tem so lahko bolje osredotočili vire in so lahko hitreje zadušili vroče točke.

Z vsem tem kot ozadjem bom poskušal potegniti nekaj vzporednic med pandemijo Zika in našo trenutno pandemijo COVID. ena študija v reviji Journal of Midwifery & Women's Health opravila raziskavo klinične literature in ugotovila: »Obstajajo pomembne vzporednice med boleznijo [virusa Zika] in COVID-19 v smislu omejenih diagnostičnih tehnik, zdravljenja in prognostičnih negotovosti.« V obeh pandemijah bolniki in zdravniki niso imeli informacij, da bi sprejemali premišljene odločitve. Javnozdravstvena sporočila so bila v isti instituciji pogosto protislovna. Dezinformacije so se širile na platformah družbenih medijev v času vsake pandemije. Resna znanstvena razprava je pripeljala celo do teorij zarote. Ni si težko predstavljati, da je vsak od teh negativno vplival na odzive na viruse pri ranljivih ali visoko tveganih posameznikih.

 

Primerjava virusa Zika in COVID-19: klinični pregled in javnost Zdravstvena sporočila

 

Virusna bolezen zika COVID-19
vektor Flavivirus: vektorji komarji Aedes aegypti in Aedes albopictus 3 Koronavirus: kapljice, fomiti 74
Menjalnik Komarji so primarni prenašalci

Spolni prenos 10

Prenaša se s transfuzijo krvi, laboratorijsko izpostavljenostjo 9

Prenaša se z dihalnimi kapljicami 74

Verjetno je prenos po zraku 75

Vertikalni prenos med nosečnostjo Pojavi se vertikalni prenos z nosečnice na plod in je verjetna prirojena okužba 9 Vertikalni prenos/prirojena okužba je malo verjeten 76
Simptomi Pogosto asimptomatsko; blagi gripi podobni simptomi, kot so vročina, artralgija, izpuščaj in konjunktivitis 3 Asimptomatski; posnema tudi normalno rinorejo in fiziološko dispnejo nosečnosti 65
Diagnostično testiranje RT-PCR, NAAT, PRNT, IgM serologije 32

Visoka stopnja lažno negativnih in pozitivnih 26

Navzkrižna reakcija serologij imunoglobulina z drugimi endemičnimi flavivirusi, kot je virus mrzlice denga 26

Perinatalna diagnoza je omejena z občutljivostjo in specifičnostjo ultrazvoka za odkrivanje virusne poškodbe 20

RT-PCR, NAAT, IgM serologije 42

Občutljivost se razlikuje glede na čas od izpostavljenosti, tehnike vzorčenja, vira vzorca 76

Na voljo so hitri testi na antigen (COVID-19 Ag Respi-Strip), vendar obstajajo pomisleki glede njihove veljavnosti, natančnosti in učinkovitosti 76

Stalno pomanjkanje zmogljivosti za testiranje in laboratorijskih reagentov 42

Terapevtika Podporna oskrba

Prirojeni Zika sindrom zahteva specializirano oskrbo, fizikalno terapijo, farmakoterapevtiko za epileptične napade, korekcijo/protetiko za slušne in optične pomanjkljivosti 23

Podporna oskrba

Remdesivir se zdi varen v nosečnosti

Druge terapije (ribavirin, baricitinib) so teratogene, embriotoksične 39

 

Okrajšave: COVID-19, koronavirusna bolezen 2019; IgM, imunoglobulin razreda M; NAAT, test amplifikacije nukleinske kisline; PRNT, nevtralizacijski test za zmanjšanje plaka; RT-PCR, test verižne reakcije s polimerazo z reverzno transkripcijo.

Ta članek je brezplačno dostopen prek PubMed Central kot del odziva na nujne primere na področju javnega zdravja COVID-19. Uporablja se lahko za neomejeno raziskovalno ponovno uporabo in analizo v kakršni koli obliki ali na kakršen koli način z navedbo izvirnega vira, v času izrednega stanja javnega zdravja. (uredil avtor)

Po naših izkušnjah z Ziko v Panami so inšpekcije od vrat do vrat iskale komarje. Danes uporabljamo teste COVID za iskanje koronavirusa. Oba iščeta dokaze o virusu, ki se imenuje pregled vektorjev. Inšpekcija vektorjev išče dokaze o potencialnih nosilcih virusa in pogojih, ki mu omogočajo, da uspe.  

 

Primerjava COVID-19 s prejšnjimi pandemijami

 

V primerjavi z drugimi nedavnimi epidemijami je COVID-19 ena izmed bolj razširjenih glede na prizadete države in število ugotovljenih primerov. Na srečo je stopnja smrtnosti (CFR) nižja od drugih večjih epidemij.  

 

 

 

 

vir:    Kako se koronavirus primerja s SARS, prašičjo gripo in drugimi epidemijami

 

Koronavirus je uvrščen bolj smrtonosno kot nekaj drugih bolezni, ki niso vključene v to lestvico. Izbruh prašičje gripe (H2009N1) leta 1 je okužil med 700 milijonov in 1.4 milijarde ljudi po vsem svetu, vendar je imel CFR 0.02 %. Na tem grafikonu tudi ni 500,000 domnevnih primerov virusa Zika v letih 2015 in 2016 ter njegovih 18 smrti. Da bo COVID-19 bolj posodobljen, od decembra 2021 Worldomet je Na spletnem mestu za sledenje koronavirusa je število primerov na 267,921,597 s 5,293,306 smrtnimi primeri za izračunani CFR 1.98%. Ker je COVID-19 lahko asimptomatski, kot je opisano v študiji Journal of Midwifery & Women's Health, morda sploh ne vedo, da so bolni. Ni razloga, da bi ti ljudje iskali test, da na koncu ne bi bili del imenovalca. Z drugimi besedami, ta scenarij lahko privede do višje stopnje obolelih za COVID-19, kot kaže statistika.

V zgodnjih fazah pandemije so podatki iz epidemiološkega modeliranja, klinične diagnoze in učinkovitosti zdravljenja pogosto redki. Strategije v začetni fazi vključujejo pospeševanje testiranja in poročanja, komunikacijo in poskus priprave pričakovane zmogljivosti za cepivo, testiranje in zdravljenje. Vsakdo nato, ne glede na to, ali je zavesten ali ne, naredi individualno oceno tveganja na podlagi svojega razumevanja resnosti tveganja, zaznane zmožnosti soočanja z grožnjo in posledic grožnje. V današnji družbi ta prepričanja nato okrepijo ali oslabijo prehrana družbenih medijev in informacijskih virov.

Časovnica testiranja Covid-19

Preskusi COVID oceniti prisotnost koronavirusa. Odvisno od vrste Test pozitiven rezultat bo nakazoval, da ima bolnik aktivno okužbo (hitri molekularni PCR test ali laboratorijski testi na antigen) ali pa je imel okužbo na neki točki (test protiteles).  

Če ima oseba simptome, ki so v skladu s COVID in pozitiven test na virusni antigen, je treba ukrepati. To dejanje bo uničenje virusa in zaustavitev širjenja. Ker pa je koronavirus tako nalezljiv, posamezniki z blagimi simptomi in brez drugih osnovnih stanj, Strokovnjaki priporočajo predpostavko o pozitivnem testu in se v karanteni za 10 dni do dva tedna. [POSODOBI: Konec decembra 2021 je CDC skrajšal priporočeno obdobje izolacije za posameznike, ki imajo COVID, na 5 dni, čemur sledi 5 dni maskiranja okoli drugih. Za tiste, ki so izpostavljeni znanim primerom virusa, CDC priporoča 5-dnevno karanteno in 5-dnevno maskiranje za necepljene. Ali pa 10 dni maskiranja, če ste cepljeni in okrepljeni.] Še drugo Strokovnjaki priporočajo zdravljenje asimptomatskih posameznikov, če imajo pozitiven test na antigen COVID. (raziskave, pa kaže, da je infektivnost asimptomatskih posameznikov šibka. Izziv pa je ločiti asimptomatsko od presimptomatskega, ki je nalezljiv.) Virus se ubije z zdravljenjem bolnika, kar omogoči telesnemu obrambnemu sistemu, da se odzove in izolira bolnika, ko je nalezljiv. Preprečevanje in zgodnje posredovanje sta ključa za obvladovanje pandemije. To je zdaj znano, "izravnavanje krivulje«.

Izravnavanje krivuljeV zvezi z Ziko, priporočila za javno zdravje vključevati previdnostne ukrepe doma, ki bi preprečili inkubacijo in rast komarjev – odpravite stoječo vodo na vašem dvorišču, odstranite morebitne rezervoarje, kot so stare gume. Podobno, priporočila za zmanjšanje širjenja koronavirusa vključujejo fizično distanco, maske in večjo higieno, kot je umivanje rok in varno odstranjevanje uporabljenih robčkov.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ (»Zunanji dejavniki, kot so družbena omrežja in viri informacij, lahko okrepijo ali oslabijo zaznavanje tveganja.«)

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Kar ne vidim v trenutni pandemiji COVID, je osredotočen pristop, ki temelji na podatkih in ciljno usmerjen. Tudi v Panami javnozdravstveni pristop k pandemiji Zika ni bil univerzalen. Bilo je nepraktično – ker so sredstva omejena – za boj proti komarjem na vseh frontah in ni bilo mogoče odpraviti vseh možnih prenašalcev. Zato so bila sredstva namenjena tistim, ki so najbolj ogroženi glede na geografsko lokacijo in osnovne pogoje.  

 

Javnozdravstveni in socialni ukrepi COVID-19

 

Zaradi pandemije COVID-19 je prav tako nepraktično preprečiti, da bi vsi kdaj zboleli. Naučili smo se, da je bolj smiselno javnozdravstveno posredovanje dati prednost najbolj ranljivim in populacijam, ki so v nevarnosti zaradi najslabših zdravstvenih izidov. Če sledimo ekonomiji, imamo podatke, ki upravičujejo namenitev več sredstev in nadzornih ukrepov za: Varnostni plakat s smernicami CDC Covid

  • Območja z visoko gostoto prebivalstva – geografska in situacijska – mesta, javni prevoz in letalski promet.
  • Institucije, v katerih so ljudje z osnovnimi boleznimi, ki bi prispevale k neugodnim izidom, če bi zbolele za koronavirusom – bolnišnice, klinike
  • Posamezniki z večjim tveganjem umrljivosti, če zbolijo za COVID-19, in sicer starejše v domovih za starejše, skupnostih upokojencev.
  • Države s podnebjem, ki je bolj naklonjeno razmnoževanju koronavirusa. WHO opozarja da se virus širi v vseh podnebjih, vendar obstajajo sezonske razlike, ki kažejo porast v zimskih mesecih
  • Posamezniki s simptomi imajo večje tveganje za prenos bolezni na druge. Testiranje je treba osredotočiti na to populacijo in hitro ukrepati za izolacijo in zdravljenje.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Kaže, da je Vmesna priporočila SZO junija 2021 se nagibajo v to smer. Nova priporočila vključujejo javnozdravstvene in socialne ukrepe, "prikrojene lokalnim kontekstom". Smernice Svetovne zdravstvene organizacije narekujejo, da bi morala »[javnozdravstvene in socialne] ukrepe izvajati najnižja upravna raven, za katero je možna ocena situacije in prilagojena lokalnim okoljem in razmeram«. Z drugimi besedami, vrednotenje podatkov na najbolj podrobni razpoložljivi ravni in ukrepanje. Ta publikacija tudi dodatno zoži poudarek v "novem razdelku o premislekih glede individualiziranih ukrepov javnega zdravja na podlagi statusa imunitete osebe proti SARS-CoV-2 po cepljenju proti COVID-19 ali pretekli okužbi".

Ali bi lahko COVID sledil Zikinemu trendu?

 

Število primerov zika v ZDA in na ozemljih

 

Panama in po vsem svetu podatki kažejo podobne trende za primere zika. The tipično napredovanje je, da se pandemije zmanjšajo v epidemije, nato v endemije s periodičnimi izbruhi. Danes se lahko ozremo nazaj na pandemijo zika. Ponujam besedo upanja. S podatki, izkušnjami in časom bo koronavirus, tako kot virus Zika in vsi virusi pred tem, potekal po svoje.

Dodatno branje: zanimivo, vendar se preprosto ni ujemalo

 

Kako se je končalo 5 najhujših pandemij na svetu iz History Channel

Kratka zgodovina pandemij (pandemije skozi zgodovino)

Kako se končajo pandemije? Zgodovina kaže, da bolezni zbledijo, a skoraj nikoli zares ne izginejo

Končno še eno orožje proti Covidu 

Kako Poop ponuja namige o širjenju koronavirusa

Resnica v ozadju panike iztrebkov s koronavirusom