Борба против вируса ЦОВИД-19 помоћу података

by 17. јануара 2022БИ/АналитикаКСНУМКС коментари

Одрицање од одговорности

 

Не прескачите овај пасус. Оклевам да уђем у ове спорне, често политичке воде, али ми је пала на памет док сам шетао свог пса Демића. Стекао сам докторат и од тада сам у неком облику здравствене заштите или консалтинга. Током протеклих 20+ година, научио сам критичко размишљање. За ИБМ тим о коме говорим у чланку, деловао сам као Дата Сциентист. Кажем да говорим језике медицине и података. Нисам епидемиолог или стручњак за јавно здравље. Ово нема за циљ да буде одбрана или критика било ког појединца или политике. Оно што овде износим су само запажања. Надам се да ћу покренути и ваше мисли.    

 

Борба против Зика помоћу података

 

Прво, моје искуство. Године 2017. ИБМ ме је одабрао међу преко 2000 кандидата да учествујем у про боно пројекту јавног здравља. Тим од нас пет послат је у земљу Панаму на месец дана да ради са тамошњим одељењем за јавно здравље. Наша мисија је била да створимо а digital алат који би омогућио брже и ефикасније доношење одлука у вези са неколико заразних болести које преносе комарци; главни је Жика. 

Решење је био цевовод за размену информација између теренских истражитеља и креатора политике за контролу Зика и других заразних болести. Другим речима, развили смо мобилну апликацију да заменимо њихов стари ручни процес слања векторских инспектора на терен. Правовремени, тачни подаци смањили су величину и трајање епидемије тако што су били у могућности да боље стратешки циљају подручја – размислите о градским блоковима – којима је потребна санација.  

Од тог времена, пандемија Зика тече својим током.  

Људска акција није окончала пандемију Зика. Заједница јавног здравља је радила на томе да га обузда, кроз дијагностику, едукацију и саветовање за путовања. Али на крају, вирус је прошао својим током, заразио је велики део популације и развио се имунитет стада, чиме је заустављено ширење.  Данас се зика сматра ендемском у неким деловима света са избијањем менструације.

Инфографика преноса ЗикаУ неким од најраније а најсмртоносније пандемије су скоро сви који су се разболели умрли. Са Зиком, „Када се велики део популације зарази, они су имуни и заправо штите друге људе од заразе [не постоји вакцина која би се заштитила од Зика-е].“  Тако се десило са Жиком. Епидемија је завршена у Америци и инциденција зика сада у 2021. је веома ниска. То је сјајна вест! Зика је достигла врхунац 2016. баш када су званичници Панаме затражили од ИБМ-а да пошаље помоћ у борби против комараца. Зика Трансмиссион | Зика Вирус | ЦДЦ

Корелација није узрочна веза, али након наше посете Панами, пандемија Зика је наставила да јењава. Постоје повремене епидемије, али од тада није достигла исти ниво забринутости. Неки очекују да ће се клатно замахнути како природни имунитет слаби и неекспонирани појединци мигрирају у зоне високог ризика од Зика.

 

Паралеле пандемије Зика и ЦОВИД-19

 

Како се ово односи на ЦОВИД-19? И патоген који је одговоран и за ЦОВИД-19 и за Зика су вируси. Они имају различите примарне облике преноса. Зика се углавном преноси са комараца на људе. Постоје могућности за преношење са човека на човека, али главни облик преноса је директно од комараца.

За коронавирус се показало да неке животиње, као слепи мисеви јелен, носе вирус, али главни облик трансмисија је човек-човеку.

Са болестима које преносе комарци (Зика, Цхикунгуниа, Денга грозница), један од циљева министарства јавног здравља Панаме био је да смањи изложеност вирусу смањењем изложености вектору. У САД, поред брзо развијене вакцине, примарно јавно здравље мере за решавање ЦОВИД-а укључују смањење изложености и ограничавање ширења на друге. Мере ублажавања за оне који су у високом ризику укључивали су маскирање, физичко дистанцирање, изолацију и рано затварање локала.

Обуздавање обе болести зависи од... ок, можда овде постаје контроверзно. Поред едукације и размене података, јавноздравствени циљеви превенције најтежих исхода могу бити фокусирани на 1. искорењивање вируса, 2. искорењивање вектора, 3. вакцинацију/заштиту најугроженијих (појединаца у највећем ризику). за лош исход), 4. имунитет стада, или 5. нека комбинација горе наведеног.  

Због вектора код других животиња, немогуће је искоренити ове вирусе (осим ако не почнете да вакцинишете комарце и слепе мишеве, претпостављам). Мислим да такође нема смисла говорити о искорењивању вектора. Комарци су сметња, поред тога што преносе штетне болести, али сам сигуран да служе некој врсти корисне сврхе. Не могу да замислим да изумре неки облик живота зато што они сметају људима.  

Дакле, хајде да причамо о вакцинацији/заштити група високог ризика и имунитету стада. Очигледно, довољно смо далеко у овој пандемији да су званичници јавног здравља и владе већ донели ове одлуке и одлучили да поступе. Не претпостављам приступ или чак бацање камења са савршеним погледом уназад.  

Појединци са већим ризиком укључују старије одрасле особе од 65 година и више и оне са озбиљним здравственим стањима; ствари као што су срчана обољења, дијабетес, гојазност, ослабљен имунитет, итд. Томе бисмо додали труднице за Жику јер се може пренети интраутеро. 

Имунитет крда је када одређена популација достигне проценат појединаца који су заштићени од болести било вакцином или природним имунитетом. У том тренутку, за оне који нису имуни, ризик од болести је низак, јер има тако мало носилаца. Тако су они који су под високим ризиком заштићени од оних који су претходно били изложени. Остаје дебата о томе колики би реалан проценат становништва (вакцинисаних + опорављених антителима) био потребан да би се створио имунитет стада на коронавирус.

 

Рат у Панами

 

Код ИБМ-а Жика иницијатива у Панами, успели смо да развијемо апликацију засновану на телефону у реалном времену са геолокацијским означавањем, која би могла да смањи и озбиљност и трајање избијања када се у потпуности примени. Заменом радно-интензивног снимања и извештавања подложног грешкама, подаци су до доносилаца одлука стигли за неколико сати уместо недеља. Званичници јавног здравља на националном нивоу били су у могућности да упореде извештаје о локацији комараца који преносе болест у реалном времену са извештајима о хоспитализованим клиничким случајевима у реалном времену. У рату против вируса Зика, ови званичници су затим усмјерили ресурсе на те специфичне локације како би искоријенили комарце у тој области. 

Дакле, уместо абroad приступ борби против болести, концентрисали су своје напоре на проблематична подручја и потенцијална проблематична подручја. Чинећи то, били су у могућности да боље фокусирају ресурсе и могли су брже да угуше вруће тачке.

Уз све то као позадину, покушаћу да повучем неке паралеле између пандемије Зика и наше тренутне пандемије ЦОВИД-а. Једна студирати у часопису Јоурнал оф Мидвифери & Вомен'с Хеалтх спровео је истраживање клиничке литературе и утврдио: „Постоје значајне паралеле између болести [зика вируса] и ЦОВИД-19 у смислу ограничених дијагностичких техника, терапије и прогностичких неизвесности.“ У обе пандемије, пацијентима и клиничарима су недостајале информације за доношење одлука на основу информација. Јавноздравствене поруке су често биле контрадикторне унутар исте институције. Дезинформације су се шириле на платформама друштвених медија у време сваке пандемије. Озбиљна научна дебата је чак довела до теорија завере. Није тешко замислити да је сваки од ових негативно утицао на одговоре на вирусе код рањивих или високоризичних особа.

 

Поређење вируса Зика и ЦОВИД-19: клинички преглед и јавност Здравствене поруке

 

Зика вирусна болест ЦОВИД-19
вектор Флавивирус: вектор Аедес аегипти и Аедес албопицтус комарци 3 Коронавирус: капљице, фомити 74
преношење Комарци су примарни вектор

Сексуални пренос 10

Преноси се трансфузијом крви, лабораторијским излагањем 9

Преноси се респираторним капљицама 74

Вероватно ваздушни пренос 75

Вертикални пренос током трудноће Долази до вертикалног преноса са труднице на фетус и вероватна је урођена инфекција 9 Вертикални пренос/урођена инфекција је мало вероватан 76
simptomi Често асимптоматски; благи симптоми слични грипу као што су грозница, артралгија, осип и коњуктивитис 3 Асимптоматски; такође опонаша нормалну ринореју и физиолошку диспнеју током трудноће 65
Дијагностичко испитивање РТ-ПЦР, НААТ, ПРНТ, ИгМ серологије 32

Висока стопа лажно негативних и позитивних 26

Унакрсна реакција серологије имуноглобулина са другим ендемским флавивирусима, као што је вирус денга грознице 26

Перинатална дијагноза ограничена осетљивошћу и специфичношћу ултразвука за откривање вирусне повреде 20

РТ-ПЦР, НААТ, ИгМ серологије 42

Осетљивост варира у зависности од времена излагања, технике узорковања, извора узорка 76

Доступни су брзи тестови на антиген (ЦОВИД-19 Аг Респи-Стрип), али постоји забринутост око њихове валидности, тачности и перформанси 76

Континуирани недостатак капацитета за тестирање и лабораторијских реагенса 42

Терапије Неге

Конгенитални Зика синдром захтева специјализовану његу, физикалну терапију, фармакотерапију за поремећаје нападаја, корекцију/протетику за слушне и оптичке дефиците 23

Неге

Ремдесивир изгледа безбедно у трудноћи

Друге терапије (рибавирин, барицитиниб) су тератогене, ембриотоксичне 39

 

Скраћенице: ЦОВИД-19, корона вирус 2019; ИгМ, имуноглобулин класе М; НААТ, тест амплификације нуклеинске киселине; ПРНТ, тест неутрализације редукције плака; РТ-ПЦР, тест ланчане реакције полимеразе реверзне транскрипције.

Овај чланак је бесплатно доступан преко ПубМед Централ-а као део одговора на хитне случајеве јавног здравља ЦОВИД-19. Може се користити за неограничену поновну употребу и анализу у истраживању у било ком облику или на било који начин уз навођење оригиналног извора, током трајања ванредне ситуације јавног здравља. (приредио аутор)

У нашем Зика искуству у Панами, инспекције од врата до врата тражиле су комарце. Данас користимо ЦОВИД тестове за тражење коронавируса. Обојица траже доказе о вирусу, што се назива инспекција вектора. Инспекција вектора тражи доказе о потенцијалним носиоцима вируса и условима који му омогућавају да напредује.  

 

Поређење ЦОВИД-19 са претходним пандемијама

 

У поређењу са другим недавним епидемијама, ЦОВИД-19 се оцењује као један од распрострањенијих у погледу земаља погођених и броја идентификованих случајева. На срећу, стопа смртности (ЦФР) је нижа од осталих великих епидемија.  

 

 

 

 

Извор:    Како се коронавирус упоређује са САРС-ом, свињским грипом и другим епидемијама

 

Коронавирус је смртоноснији од неколико других болести које нису укључене у овај графикон. Избијање свињског грипа (Х2009Н1) 1. заразило је између 700 милиона и 1.4 милијарде људи широм света, али је ЦФР износио 0.02%. Такође на овом графикону нема 500,000 сумњивих случајева вируса Зика у 2015. и 2016. години и 18 смртних случајева. Да би ЦОВИД-19 био ажурнији, од децембра 2021 Ворлдомет је Веб локација за праћење коронавируса је ставила број случајева на 267,921,597 са 5,293,306 смртних случајева за израчунати ЦФР од 1.98%. Пошто ЦОВИД-19 може бити асимптоматски, као што је описано у студији Јоурнал оф Мидвифери & Вомен'с Хеалтх, можда чак и не знају да су болесни. Нема разлога да ови људи траже тест како не би били део имениоца. Другим речима, овај сценарио може довести до тога да стопа случајева ЦОВИД-19 буде већа него што показује статистика.

У раним фазама пандемије, подаци из епидемиолошког моделирања, клиничке дијагнозе и ефикасности лечења често су оскудни. Стратегије у почетној фази укључују повећање тестирања и извештавања, комуникацију и покушај да се припреме предвиђени капацитети за вакцину, тестирање и лечење. Тада свако, било да је свестан или не, прави индивидуалну процену ризика на основу свог разумевања озбиљности ризика, своје перципиране способности да се носи са претњом и последицама претње. У данашњем друштву, ова уверења се онда јачају или слабе исхраном друштвених медија и извора информација.

Временски оквир тестирања на Цовид-19

ЦОВИД тестови процени присуство коронавируса. У зависности од врсте тест примењен, позитиван резултат ће или указивати да пацијент има активну инфекцију (брзи молекуларни ПЦР тест или лабораторијски антиген тестови) или да је имао инфекцију у неком тренутку (тест на антитела).  

Ако особа има симптоме у складу са ЦОВИД-ом и позитиван тест на вирусни антиген, потребно је предузети акцију. Та акција ће бити убијање вируса и заустављање ширења. Али, пошто је коронавирус толико заразан, појединци са благим симптомима и без других основних стања, Експерти препоручују претпоставку позитивног теста и карантин се од 10 дана до две недеље. [УПДАТЕ: Крајем децембра 2021, ЦДЦ је скратио препоручени период изолације за особе које имају ЦОВИД на 5 дана након чега следи 5 дана маскирања око других. За оне који су изложени познатим случајевима вируса, ЦДЦ препоручује 5-дневни карантин плус 5 дана маскирања за невакцинисане. Или, 10 дана маскирања ако сте вакцинисани и појачани.] Још друго Експерти препоручују лечење асимптоматских особа ако имају позитиван тест на ЦОВИД антиген. (истраживање, међутим, показује да је инфективност асимптоматских особа слаба. Изазов је, међутим, разликовати асимптоматски од пресимптоматских који је заразан.) Вирус се убија лечењем пацијента, омогућавајући одбрамбеном систему тела да подигне одговор и изолује пацијента док је заразан. Превенција и рана интервенција су кључ за управљање пандемијом. Ово је сада познато, “изравнавање кривине".

Флаттенинг Тхе ЦурвеУ суочавању са Жиком, препоруке за јавно здравље укључују предузимање мера предострожности код куће које би спречиле инкубацију и раст комараца – елиминишите стајаћу воду у вашем дворишту, уклоните потенцијалне резервоаре попут старих гума. Слично, препоруке за смањење ширења Корона вируса укључују физичко дистанцирање, маске и повећану хигијену, попут прања руку и безбедног одлагања коришћених марамица.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ („Спољни фактори као што су друштвене мреже и извори информација могу или појачати или поткопати перцепцију ризика.“)

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Оно што не видим у тренутној пандемији ЦОВИД-а је фокусиран, циљани приступ заснован на подацима. Чак и у Панами, јавноздравствени приступ пандемији Зика није био јединствен за све. Било је непрактично – јер су ресурси ограничени – борити се против комараца на свим фронтовима и немогуће је било елиминисати све могуће векторе. Дакле, ресурси су били посвећени онима који су под највећим ризиком на основу географије и основних услова.  

 

ЦОВИД-19 Јавно здравље и социјалне мере

 

Са пандемијом ЦОВИД-19, такође је непрактично спречити да се сви икада разболе. Оно што смо научили је да има смисла дати приоритет јавноздравственим интервенцијама најугроженијим и популацијама у ризику од најлошијих медицинских исхода. Ако пратимо економију, имамо податке који оправдавају издвајање више ресурса и контролних мера за: Безбедносни постер ЦДЦ Цовид смерница

  • Подручја велике густине насељености – географска и ситуациона – градови, јавни превоз и ваздушни саобраћај.
  • Институције у којима се налазе људи са основним стањима која би допринела неповољним исходима ако се заразе коронавирусом – болнице, клинике
  • Појединци са већим ризиком од смртности ако се заразе ЦОВИД-19, односно старима у старачким домовима, пензионерским заједницама.
  • Државе са климом која је погоднија за размножавање коронавируса. СЗО упозорава да се вирус шири у свим климатским условима, али постоје сезонске варијације које показују пораст у зимским месецима
  • Појединци са симптомима имају већи ризик од преношења болести на друге. Тестирање треба да буде фокусирано на ову популацију и да се брзо предузму мере за изолацију и лечење.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Изгледа да је Привремене препоруке СЗО из јуна 2021 нагињу у овом правцу. Нове препоруке укључују јавноздравствене и социјалне мере „прилагођене локалном контексту“. Смернице СЗО налажу да „[Јавноздравствене и социјалне] мере треба да спроводи најнижи административни ниво за који је могућа процена ситуације и прилагођена локалним условима и условима.“ Другим речима, процена података на најпрецизнијем доступном нивоу и предузимање радњи. Ова публикација такође додатно сужава фокус у „новом одељку о разматрањима индивидуализованих мера јавног здравља на основу статуса имунитета особе на САРС-ЦоВ-2 након вакцинације против ЦОВИД-19 или претходне инфекције“.

Да ли би ЦОВИД могао да прати Зикин тренд?

 

Број случајева Зика у САД и територијама

 

Панама и светски подаци показују сличне трендове за случајеве Зика. Тхе типична прогресија да ли се пандемије смањују до епидемија, затим ендемија са периодичним избијањима. Данас смо у могућности да се осврнемо на пандемију Зика. Нудим реч наде. Са подацима, искуством и временом, корона вирус ће, као и вирус Зика и сви вируси пре тога, кренути својим током.

Додатна литература: Занимљиво, али се једноставно није уклапало

 

Како се завршило 5 најгорих пандемија на свету са Хистори Цханнел-а

Кратка историја пандемија (Пандемије кроз историју)

Како се завршавају пандемије? Историја сугерише да болести бледе, али готово никада не нестају

Коначно, још једно оружје против Цовида 

Како Пооп нуди наговештаје о ширењу корона вируса

Истина иза панике због корона вируса

 

БИ/АналитикаНекатегоризовано
НИ Стиле против пице у стилу Чикага: укусна дебата

НИ Стиле против пице у стилу Чикага: укусна дебата

Када задовољимо наше жудње, мало ствари може парирати радости вруће парче пице. Дебата између пице у њујоршком и чикашком стилу деценијама је изазвала страствене дискусије. Сваки стил има своје јединствене карактеристике и одане обожаватеље....

Опширније

БИ/АналитикаЦогнос Аналитицс
Цогнос Куери Студио
Ваши корисници желе свој Куери Студио

Ваши корисници желе свој Куери Студио

Са издавањем ИБМ Цогнос Аналитицс 12, дуго најављивано застаревање Куери Студио-а и Аналисис Студио-а коначно је испоручено са верзијом Цогнос Аналитицс-а без тих студија. Иако ово не би требало да буде изненађење за већину људи који се баве...

Опширније

БИ/АналитикаНекатегоризовано
Да ли је ефекат Тејлор Свифт стваран?

Да ли је ефекат Тејлор Свифт стваран?

Неки критичари сугеришу да она повећава цене улазница за Супер Боул, очекује се да ће Супербоул овог викенда бити један од 3 најгледанија догађаја у историји телевизије. Вероватно више од прошлогодишњих рекордних бројева, а можда чак и више од месеца из 1969...

Опширније

БИ/Аналитика
Каталози аналитике – звезда у успону у екосистему аналитике

Каталози аналитике – звезда у успону у екосистему аналитике

Увод Као главни технолошки директор (ЦТО), увек сам у потрази за новим технологијама које трансформишу начин на који приступамо аналитици. Једна таква технологија која је привукла моју пажњу у последњих неколико година и која има огромно обећање је Аналитика...

Опширније

БИ/Аналитика
Да ли сте се изложили у последње време?

Да ли сте се изложили у последње време?

  Говоримо о безбедности у облаку. Прекомерна изложеност Хајде да то кажемо овако, шта бринете о откривању? Која је ваша највреднија имовина? Ваш број социјалног осигурања? Подаци о вашем банковном рачуну? Приватни документи или фотографије? Ваш крипто...

Опширније

БИ/Аналитика
Важност КПИ-ја и како их ефикасно користити

Важност КПИ-ја и како их ефикасно користити

Важност КПИ-ја А када је осредње боље од савршеног Један од начина за неуспех је инсистирање на савршенству. Савршенство је немогуће и непријатељ је добра. Изумитељ радара за рано упозоравање о ваздушним нападима предложио је „култ несавршеног”. Његова филозофија је била...

Опширније