Combatendo o vírus COVID-19 com dados

by 17 de janeiro de 2022BI/Análisecomentários 0

Aviso Legal

 

Não pule este parágrafo. Hesito em entrar nessas águas contenciosas, muitas vezes políticas, mas um pensamento me ocorreu enquanto eu passeava com meu cachorro, Demic. Eu ganhei um MD e tenho estado em alguma forma de saúde ou consultoria desde então. Nos últimos 20 anos, aprendi o pensamento crítico. Para a equipe da IBM que discuto no artigo, atuei como Cientista de Dados. Digo que falo as linguagens da medicina e dos dados. Não sou epidemiologista ou especialista em saúde pública. Isso não pretende ser uma defesa ou crítica de qualquer indivíduo ou política em particular. O que apresento aqui são meras observações. É minha esperança agitar seus pensamentos, também.    

 

Combatendo o zika com dados

 

Primeiro, minha experiência. Em 2017, fui selecionado pela IBM entre mais de 2000 candidatos, para participar de um projeto de saúde pública pro bono. Uma equipe de cinco de nós foi enviada ao país do Panamá por um mês para trabalhar com o departamento de saúde pública de lá. Nossa missão era criar um digital ferramenta que facilitaria a tomada de decisões mais rápida e eficaz em relação a várias doenças infecciosas transmitidas por mosquitos; sendo o principal o Zika. 

A solução foi um canal de compartilhamento de informações entre pesquisadores de campo e formuladores de políticas para controlar o Zika e outras doenças infecciosas. Em outras palavras, desenvolvemos um aplicativo móvel para substituir o antigo processo manual de envio de inspetores vetoriais para o campo. Dados oportunos e precisos reduziram o tamanho e a duração do surto, sendo capazes de direcionar melhor estrategicamente as áreas – pense no quarteirão – que precisam de remediação.  

Desde então, a pandemia de Zika seguiu seu curso.  

A ação humana não acabou com a pandemia de Zika. A comunidade de saúde pública trabalhou para contê-lo, por meio de diagnósticos, educação e avisos de viagem. Mas, em última análise, o vírus seguiu seu curso, infectou uma grande parte da população e a imunidade do rebanho se desenvolveu, interrompendo a propagação.  Hoje, o Zika é considerado endêmico em algumas partes do mundo com surtos de menstruação.

Infográfico de transmissão de zikaEm alguns dos mais cedo e as pandemias mais mortais quase todo mundo que ficou doente morreu. Com o Zika, “Uma vez que uma grande proporção da população está infectada, eles ficam imunes e, na verdade, protegem outras pessoas de serem infectadas [não há vacina para proteger contra o Zika].”  Foi o que aconteceu com o Zika. O surto acabou nas Américas e a incidência de Zika agora em 2021 é muito baixa. Essa é a grande notícia! O zika atingiu o pico em 2016, quando as autoridades do Panamá pediram à IBM que enviasse ajuda para combater os mosquitos. Transmissão de Zika | Vírus Zika | CDC

Correlação não é causa, mas após nossa visita ao Panamá, a pandemia de Zika continuou a diminuir. Existem surtos ocasionais, mas desde então não atingiu o mesmo nível de preocupação. Alguns esperam que o pêndulo volte à medida que a imunidade natural diminui e os indivíduos não expostos migram para zonas de alto risco de zika.

 

Paralelos à pandemia de zika e COVID-19

 

Como isso se relaciona com o COVID-19? Tanto o patógeno responsável pelo COVID-19 quanto pelo Zika são vírus. Eles têm diferentes formas primárias de transmissão. O Zika é transmitido principalmente de mosquitos para humanos. Existem oportunidades de transmissão de humano para humano, mas a principal forma de transmissão é diretamente do mosquito.

Para o coronavírus, foi demonstrado que alguns animais, como morcegos e veado, carregam o vírus, mas a principal forma de transmissão é de humano para humano.

Com as doenças transmitidas por mosquitos (Zika, Chikungunya, Dengue), um objetivo do Ministério da Saúde Pública do Panamá era minimizar a exposição ao vírus reduzindo a exposição ao vetor. Nos EUA, além da vacina desenvolvida rapidamente, o saúde pública primária As medidas para lidar com a COVID incluem reduzir a exposição e limitar a disseminação para outras pessoas. As medidas de mitigação para aqueles que estão em alto risco incluem mascaramento, distanciamento físico, isolamento e fechando os bares mais cedo.

A contenção de ambas as doenças depende de... ok, talvez seja aí que se torne controverso. Além da educação e compartilhamento de dados, as metas de saúde pública de prevenção dos resultados mais graves podem ser focadas em 1. erradicação do vírus, 2. erradicação do vetor, 3. vacinação/proteção dos mais vulneráveis ​​(indivíduos em maior risco para um resultado ruim), 4. imunidade de rebanho, ou 5. alguma combinação dos itens acima.  

Por causa de vetores em outros animais, é impossível erradicar esses vírus (a menos que você comece a vacinar mosquitos e morcegos, eu acho). Acho que também não faz sentido falar em erradicar os vetores. Os mosquitos são um incômodo, além de carregarem doenças nocivas, mas tenho certeza de que servem a algum tipo de propósito útil. Não consigo imaginar extinguir uma forma de vida porque eles são um incômodo para os humanos.  

Então, vamos falar sobre vacinação/proteção de grupos de alto risco e imunidade de rebanho. Obviamente, estamos tão longe dessa pandemia que as autoridades de saúde pública e os governos já tomaram essas decisões e decidiram um curso de ação. Eu não estou adivinhando a abordagem ou mesmo jogando pedras em retrospectiva perfeita.  

Indivíduos de maior risco incluem idosos com 65 anos ou mais e aqueles com condições médicas subjacentes graves; coisas como problemas cardíacos, diabetes, obesidade, imunocomprometidos, etc. mulheres grávidas para Zika porque pode ser transferido intrautero. 

Imunidade de rebanho é quando uma população específica atinge uma porcentagem de indivíduos que estão protegidos da doença por vacina ou por imunidade natural. Nesse ponto, para quem não está imune, o risco de doença é baixo, porque há tão poucos portadores. Assim, aqueles de alto risco são protegidos por aqueles que foram expostos anteriormente. Permanece o debate sobre qual porcentagem realista da população (vacinada + recuperada com anticorpos) seria necessária para constituir imunidade de rebanho ao coronavírus.

 

A guerra no Panamá

 

Com o da IBM Iniciativa Zika no Panamá, conseguimos desenvolver um aplicativo baseado em telefone em tempo real com marcação de geolocalização, o que poderia reduzir a gravidade e a duração dos surtos quando totalmente implementado. Ao substituir os registros e relatórios trabalhosos e propensos a erros, os dados chegaram aos tomadores de decisão em horas, em vez de semanas. As autoridades de saúde pública em nível nacional puderam comparar os relatórios de localização em tempo real de mosquitos portadores de doenças com os relatórios em tempo real de casos clínicos hospitalizados. Na guerra contra o vírus Zika, esses funcionários direcionaram recursos para esses locais específicos para erradicar os mosquitos naquela área. 

Então, em vez de abroad abordagem pincel para combater uma doença, eles concentraram seus esforços em áreas problemáticas e áreas problemáticas potenciais. Ao fazer isso, eles foram mais capazes de concentrar recursos e foram capazes de apagar mais rapidamente os pontos quentes.

Com tudo isso como pano de fundo, tentarei traçar alguns paralelos entre a pandemia de Zika e nossa atual pandemia de COVID. Um estudo no Journal of Midwifery & Women's Health realizaram uma pesquisa da literatura clínica e determinaram: “Existem paralelos significativos entre a doença [do vírus Zika] e o COVID-19 em termos de técnicas de diagnóstico limitadas, terapêuticas e incertezas prognósticas”. Em ambas as pandemias, pacientes e médicos careciam de informações para tomar decisões informadas. As mensagens de saúde pública eram muitas vezes contraditórias dentro da mesma instituição. A desinformação foi disseminada nas plataformas de mídia social da época de cada pandemia. Um sério debate científico até levou a teorias da conspiração. Não é difícil imaginar que cada uma dessas respostas tenha impactado negativamente os vírus em indivíduos vulneráveis ​​ou de alto risco.

 

Uma comparação do vírus Zika e COVID-19: visão geral clínica e público Mensagens de saúde

 

Doença do vírus Zika COVID-19
vetor Flavivírus: mosquitos vetores Aedes aegypti e Aedes albopictus 3 Coronavírus: gotículas, fômites 74
Transmissão Os mosquitos são vetores primários

Transmissão sexual 10

Transmitido por transfusão de sangue, exposição laboratorial 9

Transmitido por gotículas respiratórias 74

Provável transmissão aérea 75

Transmissão vertical durante a gravidez A transmissão vertical da gestante para o feto ocorre e a infecção congênita é provável 9 A transmissão vertical/infecção congênita é improvável 76
Sintomas Frequentemente assintomático; sintomas leves de gripe, como febre, artralgia, erupção cutânea e conjuntivite 3 Assintomático; também imita a rinorréia normal e a dispnéia fisiológica da gravidez 65
Teste de diagnóstico Sorologias RT-PCR, NAAT, PRNT, IgM 32

Alta taxa de falsos negativos e positivos 26

Reação cruzada de sorologias de imunoglobulinas com outros flavivírus endêmicos, como o vírus da dengue 26

Diagnóstico perinatal limitado pela sensibilidade e especificidade do ultrassom para detecção de lesão viral 20

Sorologias RT-PCR, NAAT, IgM 42

A sensibilidade varia de acordo com o tempo de exposição, técnica de amostragem, origem da amostra 76

Testes rápidos de antígenos (COVID-19 Ag Respi-Strip) disponíveis, mas há preocupações sobre sua validade, precisão e desempenho 76

Falta contínua de capacidade de teste e reagentes de laboratório 42

Terapêutica Cuidados de suporte

A síndrome congênita do Zika requer cuidados especializados, fisioterapia, farmacoterapia para distúrbios convulsivos, correção/próteses para déficits auditivos e ópticos 23

Cuidados de suporte

Remdesivir parece seguro na gravidez

Outras terapias (ribavirina, baricitinibe) são teratogênicas, embriotóxicas 39

 

Abreviaturas: COVID-19, doença de coronavírus 2019; IgM, imunoglobulina classe M; NAAT, teste de amplificação de ácido nucleico; PRNT, teste de neutralização por redução de placa; RT-PCR, teste de reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa.

Este artigo está sendo disponibilizado gratuitamente através do PubMed Central como parte da resposta à emergência de saúde pública COVID-19. Ele pode ser usado para reutilização e análise irrestrita de pesquisa de qualquer forma ou por qualquer meio com reconhecimento da fonte original, enquanto durar a emergência de saúde pública. (editado pelo autor)

Em nossa experiência com Zika no Panamá, as inspeções porta a porta procuraram mosquitos. Hoje, usamos testes COVID para procurar o coronavírus. Ambos procuram evidências do vírus, conhecido como inspeção vetorial. A inspeção vetorial procura evidências de possíveis portadores do vírus e condições que permitem que ele prospere.  

 

Comparando o COVID-19 com pandemias anteriores

 

Em comparação com outras epidemias recentes, a COVID-19 é uma das mais difundidas em termos de países afetados e número de casos identificados. Felizmente, a Taxa de Fatalidade de Casos (CFR) é menor do que outras grandes epidemias.  

 

 

 

 

Fonte:    Como o coronavírus se compara à SARS, gripe suína e outras epidemias

 

O coronavírus é mais mortal do que algumas outras doenças não incluídas neste gráfico. O surto de gripe suína de 2009 (H1N1) infectou entre 700 milhões e 1.4 bilhão de pessoas em todo o mundo, mas teve uma CFR de 0.02%. Também não constam neste gráfico os 500,000 casos suspeitos do vírus Zika em 2015 e 2016 e suas 18 mortes. Para atualizar o COVID-19, a partir de dezembro de 2021, o Worldomet é O site de rastreamento de coronavírus colocou o número de casos em 267,921,597, com 5,293,306 mortes para um CFR calculado de 1.98%. Como o COVID-19 pode ser assintomático, conforme descrito no estudo do Journal of Midwifery & Women's Health, eles podem nem saber que estão doentes. Não há razão para essas pessoas procurarem um teste para que não acabem fazendo parte do denominador. Em outras palavras, esse cenário pode levar a que as taxas de casos de COVID-19 sejam maiores do que as estatísticas mostram.

Nas fases iniciais de uma pandemia, os dados de modelagem epidemiológica, diagnóstico clínico e eficácia do tratamento são frequentemente escassos. As estratégias na fase inicial incluem intensificar os testes e relatórios, comunicação e tentar preparar a capacidade prevista para vacina, teste e tratamento. Todos então, conscientes ou não, fazem uma avaliação de risco individual com base em sua compreensão da gravidade do risco, sua capacidade percebida de lidar com a ameaça e as consequências da ameaça. Na sociedade atual, essas crenças são fortalecidas ou enfraquecidas pela dieta das mídias sociais e fontes de informação.

Cronograma de testes Covid-19

Testes COVID avaliar a presença do coronavírus. Dependendo do tipo de teste administrado, um resultado positivo indicará que o paciente tem uma infecção ativa (teste de PCR molecular rápido ou testes de antígeno de laboratório) ou teve uma infecção em algum momento (teste de anticorpos).  

Se uma pessoa tiver sintomas consistentes com COVID e um teste de antígeno viral positivo, a ação é garantida. Essa ação será para matar o vírus e impedir a propagação. Mas, como o coronavírus é tão contagioso, indivíduos com sintomas leves e sem outras condições subjacentes, especialistas recomendam a suposição de um teste positivo e ficam em quarentena por 10 dias a duas semanas. [ATUALIZAÇÃO: No final de dezembro de 2021, o CDC encurtou o período de isolamento recomendado para indivíduos com COVID para 5 dias, seguidos de 5 dias de mascaramento em torno de outras pessoas. Para aqueles que estão expostos a casos conhecidos do vírus, o CDC recomenda uma quarentena de 5 dias mais 5 dias de mascaramento para os não vacinados. Ou, 10 dias de mascaramento se vacinado e reforçado.] Ainda outros especialistas recomendar o tratamento de indivíduos assintomáticos se eles tiverem um teste positivo de antígeno COVID. (Estudos, no entanto, mostra que a infectividade de indivíduos assintomáticos é fraca. O desafio, no entanto, é distinguir assintomáticos de pré-sintomáticos, que são contagiosos.) O vírus é morto tratando o paciente, permitindo que o sistema de defesa do corpo monte uma resposta e isole o paciente enquanto ele é contagioso. Prevenção e intervenção precoce são as chaves para gerenciar a pandemia. Este é o agora familiar, “achatamento da curva. "

Achatando a curvaAo lidar com o Zika, recomendações de saúde pública inclua tomar precauções em casa que impeçam a incubação e o crescimento de mosquitos – elimine a água parada em seu quintal, remova possíveis reservatórios como pneus velhos. Similarmente, recomendações para reduzir a propagação do coronavírus incluem distanciamento físico, máscaras e maior higiene, como lavagem das mãos e descarte seguro de lenços de papel usados.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ (“Fatores externos, como redes sociais e fontes de informação, podem amplificar ou prejudicar a percepção de risco.”)

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

O que não vejo na atual pandemia de COVID é uma abordagem focada, orientada por dados e direcionada. Mesmo no Panamá, a abordagem de saúde pública para a pandemia de Zika não era de tamanho único. Era impraticável – porque os recursos são limitados – combater o mosquito em todas as frentes e era impossível eliminar todos os vetores possíveis. Assim, os recursos foram dedicados àqueles com maior risco com base na geografia e nas condições subjacentes.  

 

Saúde Pública e Medidas Sociais COVID-19

 

Com a pandemia do COVID-19, também é impraticável impedir que todos fiquem doentes. O que aprendemos é que faz mais sentido priorizar a intervenção de saúde pública para os mais vulneráveis ​​e para as populações em risco para os piores resultados médicos. Se seguirmos a economia, temos os dados para justificar a dedicação de mais recursos e medidas de controle para: Cartaz de Segurança das Diretrizes Covid do CDC

  • Áreas de alta densidade populacional – geográficas e situacionais – cidades, transporte público e viagens aéreas.
  • Instituições que têm pessoas com condições subjacentes que contribuiriam para resultados adversos se contraíssem coronavírus – hospitais, clínicas
  • Indivíduos com maior risco de mortalidade se contraírem COVID-19, nomeadamente o idoso em lares de idosos, comunidades de aposentados.
  • Estados com climas mais propícios à replicação do coronavírus. a Who adverte que o vírus se espalha em todos os climas, mas existem variações sazonais que mostram picos nos meses de inverno
  • Indivíduos com sintomas têm maior risco de transmitir a doença para outras pessoas. Os testes devem ser focados nesta população e ações tomadas rapidamente para isolar e tratar.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Parece que o Recomendações provisórias da OMS de junho de 2021 estão se inclinando nesta direção. As novas recomendações incluem medidas de saúde pública e sociais “adaptadas aos contextos locais”. A orientação da OMS determina que “medidas [de saúde pública e sociais] devem ser implementadas pelo nível administrativo mais baixo para o qual a avaliação da situação é possível e adaptadas às configurações e condições locais”. Em outras palavras, avaliar os dados no nível mais granular disponível e agir. Esta publicação também reduz ainda mais o foco em uma “nova seção sobre considerações para medidas de saúde pública individualizadas com base no status de imunidade SARS-CoV-2 de uma pessoa após a vacinação com COVID-19 ou infecção passada”.

O COVID poderia seguir a tendência do Zika?

 

Contagem de casos de zika nos EUA e territórios

 

Panamá e no mundo todo os dados mostram tendências semelhantes para casos de Zika. O progressão típica é que as pandemias diminuem para epidemias, depois endemias com surtos periódicos. Hoje, podemos olhar para trás na pandemia de Zika. Eu ofereço uma palavra de esperança. Com dados, experiência e tempo, o coronavírus, como o vírus Zika e todos os vírus anteriores, seguirá seu curso.

Leitura adicional: Interessante, mas simplesmente não se encaixou

 

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