COVID-19 viirusega võitlemine andmete abil

by Jan 17, 2022BI/Analytics0 kommentaarid

Kaebused

 

Ärge jätke seda lõiku vahele. Ma kõhklen nendesse vaidlusalustesse, sageli poliitilistesse vetesse sattumast, kuid koera Demicuga jalutades tuli mulle mõte. Ma teenisin doktorikraadi ja olen sellest ajast saadik olnud tervishoiu- või nõustamisvaldkonnas. Viimase 20+ aasta jooksul olen õppinud kriitilist mõtlemist. Artiklis käsitletava IBM-i meeskonna jaoks tegutsesin andmeteadlasena. Ma ütlen, et räägin meditsiini ja andmete keeli. Ma ei ole epidemioloog ega rahvatervise ekspert. See ei ole mõeldud ühegi konkreetse isiku või poliitika kaitseks ega kriitikaks. See, mida ma siin esitan, on vaid tähelepanekud. Loodan ka teie mõtteid ergutada.    

 

Zika vastu võitlemine andmetega

 

Esiteks minu kogemus. 2017. aastal valis IBM mind enam kui 2000 taotleja hulgast välja pro bono rahvatervise projektis osalema. Meist viieliikmeline meeskond saadeti kuuks ajaks Panama riiki sealse rahvatervise osakonnaga koostööd tegema. Meie missiooniks oli luua a digital vahend, mis hõlbustaks mitmete sääskede kaudu levivate nakkushaigustega seotud otsuste langetamist kiiremini ja tõhusamalt; peamine on Zika. 

Lahenduseks oli teabe jagamise torujuhe väliuurijate ja poliitikakujundajate vahel Zika ja teiste nakkushaiguste tõrjeks. Teisisõnu töötasime välja mobiilirakenduse, mis asendab nende igivana käsitsi vektori inspektorite põllule saatmise protsessi. Õigeaegsed ja täpsed andmed vähendasid haiguspuhangu suurust ja kestust, kuna suutsid paremini strateegiliselt sihtida piirkondi – mõelge linnaosale –, mis vajavad tervendamist.  

Sellest ajast peale on Zika pandeemia kulgenud.  

Inimtegevus ei lõpetanud Zika pandeemiat. Rahvatervise kogukond töötas diagnostika, hariduse ja reisinõuannete abil selle ohjeldamise nimel. Kuid lõpuks läks viirus oma rada, nakatas suure osa elanikkonnast ja karja immuunsus tekkis, peatades seega leviku.  Tänapäeval peetakse Zikat mõnes maailma osas endeemiliseks perioodiks.

Zika ülekande infograafikMõnes varem ja surmavamate pandeemiate korral surid peaaegu kõik haiged. Zika puhul: "Kui suur osa elanikkonnast on nakatunud, on nad immuunsed ja tegelikult kaitsevad nad teisi inimesi nakatumise eest [Zika vastu kaitsvat vaktsiini pole]."  Nii juhtus Zikaga. Puhang on Ameerikas möödas ja Zika esinemissagedus 2021. aastal on väga madal. See on suurepärane uudis! Zika saavutas haripunkti 2016. aastal just siis, kui Panama ametnikud palusid IBM-il saata abi sääskede vastu võitlemiseks. Zika ülekanne | Zika viirus | CDC

Korrelatsioon ei ole põhjuslik seos, kuid pärast meie külaskäiku Panamasse jätkas Zika pandeemia vähenemist. Aeg-ajalt esineb haiguspuhanguid, kuid sellest ajast alates pole see sama muretasemeni jõudnud. Mõned eeldavad, et pendel pöördub tagasi, kui loomulik immuunsus väheneb ja säritamata isikud rändavad Zika kõrge riskiga tsoonidesse.

 

Zika ja COVID-19 pandeemia paralleelid

 

Kuidas on see seotud COVID-19-ga? Nii COVID-19 kui ka Zika eest vastutav patogeen on viirused. Neil on erinevad esmased ülekandevormid. Zika kandub peamiselt sääskedelt inimestele. Inimeselt inimesele levimise võimalused on olemas, kuid peamine leviku vorm on otse sääselt.

Koroonaviiruse puhul on näidatud, et mõned loomad, nagu nahkhiired ja hirv, ei kanna viirust, kuid selle peamine vorm edastamine on inimeselt inimesele.

Sääskede kaudu levivate haiguste (Zika, Chikungunya, Dengue palavik) puhul oli Panama rahvatervise ministeeriumi üks eesmärke minimeerida kokkupuudet viirusega, vähendades kokkupuudet vektoriga. USA-s on lisaks kiiresti arendatud vaktsiinile esmane rahvatervis meetmed COVID-iga võitlemiseks hõlmavad kokkupuute vähendamist ja leviku piiramist teistele. Leevendusmeetmed kõrge riskiga inimestele on hõlmanud maskeerimist, füüsilist distantseerumist, isoleerimist ja baarid varakult sulgeda.

Mõlema haiguse ohjeldamine sõltub … ok, võib-olla siin muutub see vastuoluliseks. Lisaks haridusele ja andmete jagamisele saab kõige raskemate tagajärgede ennetamise rahvatervise eesmärgid keskenduda 1. viiruse likvideerimisele, 2. vektori likvideerimisele, 3. kõige haavatavamate (kõrgeima riskiga indiviidide) vaktsineerimisele/kaitsele. halva tulemuse korral), 4. karja immuunsus või 5. eelmainitute kombinatsioon.  

Teistel loomadel esinevate vektorite tõttu on neid viirusi võimatu välja juurida (kui just sääski ja nahkhiiri vaktsineerima ei hakka). Ma arvan, et ka vektorite väljajuurimisest pole mõtet rääkida. Sääsed on lisaks kahjulike haiguste kandmisele häirivad, kuid olen kindel, et neil on mingisugune kasulik otstarve. Ma ei suuda ette kujutada, et mingi eluvorm välja sureks, sest need on inimestele häirivad.  

Räägime siis kõrge riskiga rühmade vaktsineerimisest/kaitsest ja karja immuunsusest. Ilmselgelt oleme selles pandeemias piisavalt kaugel, et rahvatervise ametnikud ja valitsused on need otsused juba teinud ja otsustanud tegutsemisviisi. Ma ei aima lähenemist ega isegi täiusliku tagantjärele kive loopima.  

Kõrgema riskiga isikud hõlmavad vanemaid täiskasvanuid, kes on 65-aastased ja vanemad, ja neid, kellel on tõsine haigusseisund; Südamehaigused, diabeet, rasvumine, immuunpuudulikkus jne. Nendele lisame rasedad Zika puhul, sest seda saab emakasisene üle kanda. 

Karja immuunsus on see, kui teatud populatsioon jõuab teatud protsendini isikutest, kes on haiguse eest kaitstud kas vaktsiini või loomuliku immuunsuse kaudu. Sel hetkel on neil, kes pole immuunsed, risk haigestuda, sest kandjaid on nii vähe. Seega kaitsevad kõrge riskiga inimesi need, kes on varem kokku puutunud. Arutelu selle üle, kui suur on realistlik protsent elanikkonnast (vaktsineeritud + antikehadega taastunud) oleks vajalik, et luua karja immuunsus koroonaviiruse suhtes.

 

Sõda Panamas

 

IBM-idega Zika algatus Panamas suutsime välja töötada geograafilise asukoha märgistusega reaalajas telefonipõhise rakenduse, mis võib täielikult juurutades vähendada nii haiguspuhangute tõsidust kui ka kestust. Asendades töömahuka ja vearohke salvestuse ja aruandluse, jõudsid andmed otsustajateni nädalate asemel tundidega. Riikliku tasandi rahvatervise ametnikud said võrrelda haigusi kandvate sääskede asukohateateid reaalajas hospitaliseeritud kliiniliste juhtumite teatamisega. Zika viirusevastases sõjas suunasid need ametnikud ressursse nendesse konkreetsetesse kohtadesse, et hävitada sääski selles piirkonnas. 

Niisiis, ab asemelroad harja lähenemine haigusega võitlemisele, keskendusid nad probleemsetele ja võimalikele probleemsetele piirkondadele. Seda tehes suutsid nad paremini ressursse koondada ja kuumad kohad kiiremini kustutada.

Kõige selle taustal proovin tõmmata paralleele Zika pandeemia ja meie praeguse COVID-pandeemia vahel. Üks õppima ajakirjas Journal of Midwifery & Women's Health viis läbi uuringu kliinilise kirjanduse kohta ja tegi kindlaks: "[Zika viiruse] haiguse ja COVID-19 vahel on olulisi paralleele piiratud diagnostiliste meetodite, ravimeetodite ja prognostilise ebakindluse osas." Mõlema pandeemia korral puudus patsientidel ja arstidel teave teadlike otsuste tegemiseks. Rahvatervise sõnumid olid sageli samas asutuses vastuolulised. Iga pandeemia ajal levitati desinformatsiooni sotsiaalmeedia platvormidel. Tõsine teaduslik arutelu viis isegi vandenõuteooriateni. Pole raske ette kujutada, et igaüks neist mõjutas haavatavate või kõrge riskiga inimeste vastust viirustele.

 

Zika viiruse ja COVID-19 võrdlus: kliiniline ülevaade ja avalikkus Tervisesõnumid

 

Zika viirushaigus COVID-19
vektor Flaviviirus: Aedes aegypti ja Aedes albopictus sääsed 3 Koroonaviirus: tilgad, fomiidid 74
Ülekandmine Sääsed on esmased vektorid

Seksuaalne levik 10

Edastatakse vereülekandega, laboratoorsel kokkupuutel 9

Edastatakse hingamisteede tilkade kaudu 74

Tõenäoline ülekanne õhus 75

Vertikaalne ülekanne raseduse ajal Vertikaalne ülekandumine rasedalt inimeselt lootele toimub ja kaasasündinud infektsioon on tõenäoline 9 Vertikaalne ülekanne/kaasasündinud infektsioon on ebatõenäoline 76
Sümptomid Sageli asümptomaatiline; kerged gripilaadsed sümptomid nagu palavik, artralgia, lööve ja konjunktiviit 3 asümptomaatiline; samuti jäljendab normaalset rinorröad ja raseduse füsioloogilist hingeldust 65
Diagnostiline testimine RT-PCR, NAAT, PRNT, IgM seroloogiad 32

Valenegatiivsete ja -positiivsete tulemuste kõrge määr 26

Immunoglobuliini seroloogiate ristreaktsioon teiste endeemiliste flaviviirustega, nagu dengue palaviku viirus 26

Perinataalne diagnoos on piiratud ultraheli tundlikkuse ja spetsiifilisusega viiruskahjustuse tuvastamiseks 20

RT-PCR, NAAT, IgM seroloogiad 42

Tundlikkus varieerub sõltuvalt kokkupuute ajast, proovivõtutehnikast ja proovi allikast 76

Antigeeni kiirtestid (COVID-19 Ag Respi-Strip) on saadaval, kuid nende kehtivuse, täpsuse ja toimivuse pärast on muret 76

Katsetamisvõime ja laboratoorsete reaktiivide jätkuv puudus 42

Ravi Toetav ravi

Kaasasündinud Zika sündroom nõuab erihooldust, füsioteraapiat, epilepsiahoogude farmakoteraapiat, kuulmis- ja nägemispuudulikkuse korrigeerimist/proteesimist 23

Toetav ravi

Remdesivir näib olevat raseduse ajal ohutu

Teised ravimeetodid (ribaviriin, baritsitiniib) on teratogeensed, embrüotoksilised 39

 

Lühendid: COVID‐19, koroonaviirushaigus 2019; IgM, immunoglobuliini klass M; NAAT, nukleiinhappe amplifikatsiooni test; PRNT, naastude vähendamise neutraliseerimise test; RT-PCR, pöördtranskriptsiooni polümeraasi ahelreaktsiooni test.

See artikkel tehakse PubMed Centrali kaudu tasuta kättesaadavaks osana COVID-19 rahvatervisega seotud hädaolukordadest. Seda saab rahvatervisega seotud hädaolukorra ajal kasutada mis tahes vormis või mis tahes vahenditega uuringute piiramatuks taaskasutamiseks ja analüüsimiseks, kinnitades algallikat. (autori toimetanud)

Meie Panamas Zika-kogemuse põhjal otsiti ukselt ukseni kontrollimisel sääski. Täna kasutame koroonaviiruse otsimiseks COVID-teste. Mõlemad otsivad viiruse tõendeid, mida nimetatakse vektori kontrolliks. Vektori kontroll otsib tõendeid võimalike viirusekandjate ja tingimuste kohta, mis võimaldavad sellel areneda.  

 

COVID-19 võrdlemine eelmiste pandeemiatega

 

Võrreldes teiste hiljutiste epideemiatega on COVID-19 mõjutatud riikide ja tuvastatud juhtumite arvu poolest üks levinumaid. Õnneks on surmajuhtumite määr (CFR) madalam kui teistel suurematel epideemiatel.  

 

 

 

 

Allikas:    Kuidas koroonaviirust võrrelda SARSi, seagripi ja muude epideemiatega

 

Koroonaviirus on surmavam kui paar muud haigust, mida selles tabelis pole. 2009. aasta seagripi (H1N1) puhang nakatas kogu maailmas 700–1.4 miljardit inimest, kuid CFR oli 0.02%. Sellel graafikul pole ka 500,000 2015 kahtlustatavat Zika viiruse juhtumit aastatel 2016 ja 18 ning selle 19 surmajuhtumit. COVID-2021 ajakohastamiseks on alates XNUMX. aasta detsembrist Maailmomeeter Koroonaviiruse jälgimise veebisaidil oli juhtumite arv 267,921,597 5,293,306 1.98 ja 19 19 XNUMX surmajuhtumit, kui arvutatud CFR on XNUMX%. Kuna COVID-XNUMX võib olla asümptomaatiline, nagu on kirjeldatud ajakirjas Journal of Midwifery & Women's Health, ei pruugi nad isegi teada, et nad on haiged. Nendel inimestel pole põhjust testi otsida, et nad ei jääks nimetaja osaks. Teisisõnu võib see stsenaarium viia selleni, et COVID-XNUMX juhtumite määr on suurem, kui statistika näitab.

Pandeemia varases faasis on epidemioloogilise modelleerimise, kliinilise diagnoosi ja ravi efektiivsuse andmeid sageli vähe. Algfaasi strateegiad hõlmavad testimise ja aruandluse suurendamist, suhtlemist ning vaktsiini, testimise ja ravi eeldatava suutlikkuse ettevalmistamist. Seejärel teeb igaüks, olenemata sellest, kas ta on teadlik või mitte, individuaalse riskihinnangu, mis põhineb tema arusaamal riski tõsidusest, tajutavast võimest ohuga toime tulla ja ohu tagajärgedest. Tänapäeva ühiskonnas tugevdab või nõrgestab neid uskumusi sotsiaalmeedia ja teabeallikate toitumine.

Covid-19 testimise ajaskaala

COVID testid hinnata koroonaviiruse olemasolu. Sõltuvalt tüübist test Manustamisel näitab positiivne tulemus, et patsiendil on aktiivne infektsioon (kiire molekulaarne PCR-test või labori antigeenitestid) või on mingil hetkel olnud infektsioon (antikehade test).  

Kui inimesel on COVID-ile vastavad sümptomid ja viiruse antigeeni test on positiivne, on vaja tegutseda. See tegevus on viiruse tapmine ja leviku peatamine. Kuid kuna koroonaviirus on nii nakkav, võivad kergete sümptomitega isikud, kellel pole muid haigusseisundeid, ekspertide soovitada eeldada positiivset testi ja panna end 10 päevaks kuni kaheks nädalaks karantiini. [UPDATE: 2021. aasta detsembri lõpus lühendas CDC COVID-i põdevate inimeste soovitatavat isolatsiooniperioodi 5 päevani, millele järgnes 5 päeva kestev maskeerimine. Neile, kes puutuvad kokku teadaolevate viirusejuhtumitega, soovitab CDC vaktsineerimata isikutele 5-päevast karantiini ja 5-päevast maskeerimist. Või 10 päeva maskeerimist, kui vaktsineeritakse ja tugevdatakse.] Ja veel ekspertide soovitada ravida asümptomaatilised isikud, kui neil on positiivne COVID antigeeni test. (uurimistöönäitab aga, et asümptomaatiliste isikute nakkavus on nõrk. Väljakutseks on aga eristada asümptomaatiline ja presümptomaatiline, mis on nakkav.) Viirus tapetakse patsiendi ravimisel, mis võimaldab organismi kaitsesüsteemil reageerida ja patsient isoleerida, kui ta on nakkav. Ennetus ja varajane sekkumine on pandeemia ohjamise võtmed. See on nüüd tuttav, "kõvera lamendamine. "

Kõvera lamendamineZikaga tegelemisel rahvatervise soovitused sisaldama kodus ettevaatusabinõusid, mis hoiaksid ära sääskede haudumise ja kasvu – kõrvaldage hoovis seisev vesi, eemaldage võimalikud veehoidlad nagu vanad rehvid. Samamoodi soovitusi leviku vähendamiseks koroonaviiruse levikuks on füüsiline distantseerimine, maskid ja kõrgem hügieen, nagu kätepesu ja kasutatud salvrätikute ohutu kõrvaldamine.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ ("Välised tegurid, nagu sotsiaalvõrgustikud ja teabeallikad, võivad riskitaju võimendada või kahjustada.")

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Mida ma praeguse COVID-pandeemia puhul ei näe, on keskendunud, andmepõhine ja sihipärane lähenemisviis. Isegi Panamas ei olnud rahvatervise lähenemisviis Zika pandeemiale kõigile üks. Sääskede vastu võitlemine igal rindel oli ebapraktiline – kuna ressursid on piiratud – ja kõiki võimalikke vektoreid oli võimatu kõrvaldada. Seega eraldati vahendid kõige suurema riskiga inimestele, lähtudes geograafiast ja alustingimustest.  

 

COVID-19 rahvatervise ja sotsiaalsed meetmed

 

COVID-19 pandeemiaga on samuti ebapraktiline hoida kõiki haigeks jäämast. Oleme õppinud, et rahvatervise sekkumine on mõttekam seada esikohale kõige haavatavamad ja kõige kehvemate meditsiiniliste tulemuste ohus olevad elanikkonnarühmad. Kui järgime majandust, on meil andmeid, mis õigustavad rohkemate ressursside ja kontrollimeetmete eraldamist: CDC Covidi juhiste ohutusplakat

  • Suure asustustihedusega piirkonnad – nii geograafilised kui ka situatsioonilised – linnad, ühistransport ja lennureisid.
  • Asutused, kus on inimesi, kelle haigusseisundid võivad koroonaviirusesse nakatumise korral kaasa tuua ebasoodsaid tagajärgi – haiglad, kliinikud
  • Isikud, kellel on suurem suremusrisk, kui nad nakatuvad COVID-19-sse, nimelt Eakatel hooldekodudes, pensionäride kogukondades.
  • Riigid, mille kliima soodustab koroonaviiruse paljunemist. WHO hoiatab et viirus levib igas kliimas, kuid on hooajalisi erinevusi, mis näitavad naelu talvekuudel
  • Sümptomitega inimestel on suurem risk haigust teistele edasi anda. Katsetamine peaks keskenduma sellele populatsioonile ning isoleerimiseks ja raviks tuleks võtta kiireid meetmeid.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Näib, et WHO juuni 2021 vahesoovitused kalduvad sellesse suunda. Uued soovitused hõlmavad rahvatervise ja sotsiaalseid meetmeid, mis on kohandatud kohalikule kontekstile. WHO juhised näevad ette, et „[rahvatervise ja sotsiaalvaldkonna] meetmed tuleks rakendada madalaimal haldustasandil, mille puhul on võimalik olukorra hindamine, ning kohandada vastavalt kohalikele oludele ja oludele.” Teisisõnu, andmete hindamine kõige üksikasjalikumal saadaoleval tasemel ja meetmete võtmine. See väljaanne kitsendab fookust veelgi "uues jaotises, mis käsitleb individuaalsete rahvatervise meetmete kaalutlusi, mis põhinevad isiku SARS-CoV-2 immuunsuse staatusel pärast COVID-19 vaktsineerimist või varasemat nakatumist".

Kas COVID võiks järgida Zika suundumusi?

 

Zika juhtumite arv USA-s ja territooriumidel

 

Panama ja ülemaailmne andmed näitavad Zika juhtumite puhul sarnaseid suundumusi. The tüüpiline progresseerumine on see, et pandeemiad vähenevad epideemiateks, seejärel endeemideks perioodiliste puhangutega. Täna saame vaadata tagasi Zika pandeemiale. Ma pakun lootussõna. Andmete, kogemuste ja ajaga saab koroonaviirus, nagu Zika viirus ja kõik viirused enne seda, oma rada.

Täiendav lugemine: huvitav, kuid lihtsalt ei sobinud

 

Kuidas lõppes viis maailma halvimat pandeemiat ajaloo kanalist

Pandeemiate lühiajalugu (pandeemiad läbi ajaloo)

Kuidas pandeemiad lõppevad? Ajalugu viitab sellele, et haigused kaovad, kuid pole peaaegu kunagi päriselt kadunud

Lõpuks veel üks relv Covidi vastu 

Kuidas Poop pakub vihjeid koroonaviiruse leviku kohta

Tõde koroonaviiruse kakapaanika taga