Cīņa pret Covid-19 vīrusu, izmantojot datus

by Jan 17, 2022BI/Analytics0 komentāri

Atbildības noraidīšana

 

Neizlaidiet šo rindkopu. Es vilcinos brist šajos strīdīgajos, bieži vien politiskajos ūdeņos, taču man ienāca prātā doma, kad pastaigājos ar savu suni Demiku. Esmu ieguvis medicīnas doktora grādu un kopš tā laika esmu strādājis veselības aprūpes vai konsultāciju jomā. Pēdējo 20+ gadu laikā esmu apguvis kritisko domāšanu. IBM komandai, par kuru es runāju rakstā, es darbojos kā datu zinātnieks. Es saku, ka runāju medicīnas un datu valodās. Es neesmu epidemiologs vai sabiedrības veselības eksperts. Tas nav paredzēts kādas konkrētas personas vai politikas aizstāvībai vai kritikai. Tas, ko es šeit sniedzu, ir tikai novērojumi. Es ceru rosināt arī jūsu domas.    

 

Cīņa ar Ziku ar datiem

 

Pirmkārt, mana pieredze. 2017. gadā IBM mani izvēlējās no vairāk nekā 2000 pretendentu, lai piedalītos pro bono sabiedrības veselības projektā. Mūsu piecu cilvēku komanda uz mēnesi tika nosūtīta uz Panamas valsti, lai strādātu ar turienes sabiedrības veselības departamentu. Mūsu misija bija izveidot a digital instruments, kas veicinātu ātrāku un efektīvāku lēmumu pieņemšanu saistībā ar vairākām odu pārnēsātām infekcijas slimībām; galvenais ir Zika. 

Risinājums bija informācijas apmaiņas cauruļvads starp lauka izmeklētājiem un politikas veidotājiem, lai kontrolētu Zika un citas infekcijas slimības. Citiem vārdiem sakot, mēs izstrādājām mobilo lietojumprogrammu, lai aizstātu viņu veco manuālo procesu, kurā vektoru inspektori tiek nosūtīti uz lauka. Savlaicīgi, precīzi dati samazināja uzliesmojuma lielumu un ilgumu, jo spēja stratēģiski mērķtiecīgāk mērķēt uz apgabaliem – piemēram, pilsētas kvartālu –, kam nepieciešama sanācija.  

Kopš tā laika Zikas pandēmija ir izgājusi savu gaitu.  

Cilvēku darbība neizbeidza Zikas pandēmiju. Sabiedrības veselības kopiena strādāja, lai to ierobežotu, izmantojot diagnostiku, izglītību un ceļojumu ieteikumus. Bet galu galā vīruss izskrēja savu gaitu, inficēja lielu daļu iedzīvotāju, un izveidojās ganāmpulka imunitāte, tādējādi apturot izplatību.  Mūsdienās Zika dažās pasaules daļās tiek uzskatīta par endēmisku ar periodiskiem uzliesmojumiem.

Zika pārraides infografikaDažās no agrāk un nāvējošākās pandēmijas gandrīz visi, kas saslima, nomira. Ar Ziku: "Kad liela daļa iedzīvotāju ir inficēti, viņi ir imūni un faktiski aizsargā citus cilvēkus no inficēšanās [nav vakcīnas, kas aizsargātu pret Ziku]."  Tā notika ar Ziku. Uzliesmojums Amerikā ir beidzies, un Zikas izplatība šobrīd 2021. gadā ir ļoti zema. Tā ir lieliska ziņa! Zika maksimumu sasniedza 2016. gadā, kad Panamas amatpersonas lūdza IBM nosūtīt palīdzību cīņā pret odiem. Zika transmisija | Zikas vīruss | CDC

Korelācija nav cēloņsakarība, taču pēc mūsu vizītes Panamā Zikas pandēmija turpināja mazināties. Reizēm ir uzliesmojumi, taču kopš tā laika tas nav sasniedzis tādu pašu bažas. Daži sagaida, ka svārsts sāks pagriezties atpakaļ, kad dabiskā imunitāte mazinās un neeksponēti indivīdi migrē uz Zikas izraisītas augsta riska zonām.

 

Zika un COVID-19 pandēmijas paralēles

 

Kā tas ir saistīts ar COVID-19? Gan patogēns, kas ir atbildīgs gan par COVID-19, gan Zika, ir vīrusi. Viņiem ir dažādi primārie pārnešanas veidi. Zika galvenokārt tiek pārnesta no odiem uz cilvēkiem. Ir iespējas pārnēsāt no cilvēka uz cilvēku, bet galvenais pārnešanas veids ir tieši no odi.

Attiecībā uz koronavīrusu ir pierādīts, ka daži dzīvnieki, piemēram, sikspārņi un briedis, pārnēsāt vīrusu, bet galvenā forma transmisija ir cilvēks pret cilvēku.

Ar odu pārnēsātām slimībām (Zika, Chikungunya, Denges drudzis) viens no Panamas sabiedrības veselības ministrijas mērķiem bija samazināt vīrusa iedarbību, samazinot pārnēsātāja iedarbību. ASV papildus strauji izstrādātajai vakcīnai, primārā sabiedrības veselība pasākumi COVID apkarošanai ietver iedarbības samazināšanu un izplatības ierobežošanu uz citiem. Riska mazināšanas pasākumi ietvēra maskēšanu, fizisku distancēšanos, izolāciju un priekšlaicīgi aizverot bārus.

Abu slimību ierobežošana ir atkarīga no … labi, varbūt šeit tas kļūst strīdīgs. Papildus izglītošanai un datu apmaiņai sabiedrības veselības mērķi, lai novērstu vissmagākos rezultātus, var būt vērsti uz 1. vīrusa izskaušanu, 2. slimības pārnēsātāja izskaušanu, 3. visneaizsargātāko (personu ar visaugstāko risku) vakcināciju/aizsardzību. par sliktu iznākumu), 4. ganāmpulka imunitāte vai 5. kāda iepriekš minēto kombinācija.  

Citu dzīvnieku pārnēsātāju dēļ šos vīrusus nav iespējams izskaust (ja vien jūs nesākat vakcinēt odus un sikspārņus, es domāju). Es domāju, ka arī nav jēgas runāt par vektoru izskaušanu. Odi ir ne tikai kaitīgu slimību pārnēsātāji, bet arī apgrūtinājumi, taču esmu pārliecināts, ka tiem ir kāds noderīgs mērķis. Es nevaru iedomāties, ka varētu izzust dzīvības forma, jo tās rada neērtības cilvēkiem.  

Tātad, parunāsim par vakcināciju/augsta riska grupu aizsardzību un ganāmpulka imunitāti. Acīmredzot mēs esam pietiekami tālu šajā pandēmijā, ka sabiedrības veselības amatpersonas un valdības jau ir pieņēmušas šos lēmumus un ir izlēmušas par rīcību. Es nedomāju par pieeju vai pat mētājos ar akmeņiem ar perfektu atpalicību.  

Augstāka riska personas ietver gados vecākus pieaugušos, kas ir 65 gadus veci un vecāki, un tos, kuriem ir nopietnas veselības problēmas; tādas lietas kā sirds slimības, diabēts, aptaukošanās, imūnsistēmas traucējumi utt grūtnieces Zikai, jo to var pārnest intrauterīnā. 

Ganāmpulka imunitāte ir tad, kad konkrēta populācija sasniedz tādu indivīdu procentuālo daļu, kuri ir aizsargāti no slimības vai nu ar vakcīnu, vai ar dabisko imunitāti. Tajā brīdī tiem, kuri nav imūni, slimības risks ir zems, jo ir tik maz pārnēsātāju. Tādējādi tos, kuriem ir augsts risks, aizsargā tie, kas iepriekš bijuši pakļauti iedarbībai. Joprojām turpinās diskusijas par to, kāds reāls procents iedzīvotāju (vakcinēti + ar antivielām atgūti) būtu nepieciešami, lai izveidotu ganāmpulka imunitāti pret koronavīrusu.

 

Karš Panamā

 

Ar IBM Zikas iniciatīva Panamā mēs varējām izstrādāt reāllaika tālruņa lietojumprogrammu ar ģeogrāfiskās atrašanās vietas marķējumu, kas varētu samazināt gan uzliesmojumu nopietnību, gan ilgumu, kad tā tiks pilnībā ieviesta. Aizstājot darbietilpīgo un kļūdām pakļauto ierakstīšanu un ziņošanu, dati pie lēmumu pieņēmējiem nonāca stundās, nevis nedēļās. Sabiedrības veselības aizsardzības amatpersonas valsts līmenī varēja salīdzināt reāllaika ziņojumus par slimību pārnēsātājiem odiem ar reāllaika ziņojumiem par hospitalizētiem klīniskiem gadījumiem. Karā pret Zikas vīrusu šīs amatpersonas pēc tam novirzīja resursus uz šīm konkrētajām vietām, lai izskaustu odus šajā apgabalā. 

Tātad, nevis abroad otas pieeja cīņai pret slimību, viņi koncentrēja savus spēkus uz problemātiskajām un iespējamām problemātiskajām jomām. To darot, viņi varēja labāk koncentrēt resursus un spēja ātrāk novērst karstos punktus.

Ņemot vērā iepriekš minēto, es mēģināšu vilkt dažas paralēles starp Zikas pandēmiju un mūsu pašreizējo COVID pandēmiju. Viens studēt žurnālā Journal of Midwifery & Women's Health veica klīniskās literatūras aptauju un noteica: "Ir būtiskas paralēles starp [Zikas vīrusa] slimību un COVID-19 ierobežoto diagnostikas metožu, terapijas un prognostiskās neskaidrības ziņā." Abās pandēmijās pacientiem un ārstiem trūka informācijas, lai pieņemtu apzinātus lēmumus. Sabiedrības veselības ziņojumapmaiņa vienā iestādē bieži bija pretrunīga. Katra pandēmijas laika sociālo mediju platformās tika izplatīta dezinformācija. Nopietnas zinātniskas debates pat noveda pie sazvērestības teorijām. Nav grūti iedomāties, ka katra no šīm negatīvi ietekmēja neaizsargātu vai augsta riska personu reakciju uz vīrusiem.

 

Zikas vīrusa un COVID-19 salīdzinājums: klīniskais pārskats un publika Veselības ziņojumapmaiņa

 

Zikas vīrusa slimība COVID-19
vektors Flavivīruss: pārnēsātāji Aedes aegypti un Aedes albopictus odi 3 Koronavīruss: pilieni, fomīti 74
transmisija Odi ir primārais slimības pārnēsātājs

Dzimumakta 10

Pārnēsā ar asins pārliešanu, laboratorijas ekspozīciju 9

Pārnēsā ar elpceļu pilieniem 74

Iespējama pārnešana gaisā 75

Vertikālā transmisija grūtniecības laikā Notiek vertikāla transmisija no grūtnieces uz augli, un ir iespējama iedzimta infekcija 9 Vertikālā transmisija/iedzimta infekcija ir maz ticama 76
Simptomi Bieži asimptomātisks; viegli gripai līdzīgi simptomi, piemēram, drudzis, artralģija, izsitumi un konjunktivīts 3 Asimptomātisks; arī atdarina normālu rinoreju un fizioloģisko aizdusu grūtniecības laikā 65
Diagnostikas pārbaude RT-PCR, NAAT, PRNT, IgM seroloģijas 32

Augsts viltus negatīvu un pozitīvu rezultātu līmenis 26

Imūnglobulīna seroloģiju krusteniskā reakcija ar citiem endēmiskiem flavivīrusiem, piemēram, tropu drudža vīrusu 26

Perinatālā diagnoze, ko ierobežo ultraskaņas jutība un specifika vīrusu bojājumu noteikšanai 20

RT-PCR, NAAT, IgM seroloģijas 42

Jutība mainās atkarībā no ekspozīcijas laika, paraugu ņemšanas tehnikas un parauga avota 76

Ir pieejami ātrie antigēnu testi (COVID-19 Ag Respi-Strip), taču pastāv bažas par to derīgumu, precizitāti un veiktspēju. 76

Pastāvīgs testēšanas jaudas un laboratorijas reaģentu trūkums 42

Terapija Atbalstoša aprūpe

Iedzimtajam Zikas sindromam nepieciešama specializēta aprūpe, fizikālā terapija, farmakoterapija krampju traucējumu gadījumā, korekcija/protezēšana dzirdes un redzes traucējumu gadījumā 23

Atbalstoša aprūpe

Remdesivir grūtniecības laikā šķiet drošs

Citas terapijas (ribavirīns, baricitinibs) ir teratogēnas, embriotoksiskas 39

 

Saīsinājumi: COVID‐19, koronavīrusa slimība 2019; IgM, imūnglobulīna klase M; NAAT, nukleīnskābju amplifikācijas tests; PRNT, aplikuma samazināšanas neitralizācijas tests; RT-PCR, reversās transkripcijas polimerāzes ķēdes reakcijas tests.

Šis raksts ir brīvi pieejams caur PubMed Central kā daļa no sabiedrības veselības ārkārtas reaģēšanas uz Covid-19. To var izmantot neierobežotai atkārtotai izpētei un analīzei jebkurā formā vai ar jebkādiem līdzekļiem, apstiprinot sākotnējo avotu, visu sabiedrības veselības ārkārtas situāciju. (rediģējis autors)

Mūsu Zika pieredzē Panamā pārbaudēs no durvīm līdz durvīm tika meklēti odi. Šodien mēs izmantojam COVID testus, lai meklētu koronavīrusu. Abi meklē pierādījumus par vīrusu, ko dēvē par vektora pārbaudi. Pārnēsātāju pārbaude meklē pierādījumus par iespējamiem vīrusa nesējiem un apstākļiem, kas ļauj tam attīstīties.  

 

Covid-19 salīdzinājums ar iepriekšējām pandēmijām

 

Salīdzinot ar citām nesenajām epidēmijām, Covid-19 ir viena no izplatītākajām skarto valstu un konstatēto gadījumu skaita ziņā. Par laimi gadījumu mirstības rādītājs (CFR) ir zemāks nekā citām lielākajām epidēmijām.  

 

 

 

 

Avots:    Kā koronavīruss tiek salīdzināts ar SARS, cūku gripu un citām epidēmijām

 

Koronavīruss ir nāvējošāks nekā dažas citas slimības, kas nav iekļautas šajā diagrammā. 2009. gada cūku gripas (H1N1) uzliesmojums visā pasaulē inficēja no 700 miljoniem līdz 1.4 miljardiem cilvēku, bet CFR bija 0.02%. Šajā diagrammā nav arī 500,000 2015 aizdomīgo Zikas vīrusa gadījumu 2016. un 18. gadā un 19 nāves gadījumu. Lai aktualizētu Covid-2021, no XNUMX. gada decembra Pasaules skaitītājs Koronavīrusa izsekošanas vietnē konstatēts 267,921,597 5,293,306 1.98 gadījumu skaits ar 19 19 XNUMX nāves gadījumiem ar aprēķināto CFR XNUMX%. Tā kā COVID-XNUMX var būt asimptomātisks, kā aprakstīts pētījumā Journal of Midwifery & Women's Health, viņi var pat nezināt, ka ir slimi. Šiem cilvēkiem nav iemesla meklēt testu, lai viņi netiktu iekļauti saucējā. Citiem vārdiem sakot, šī scenārija dēļ Covid-XNUMX gadījumu skaits var būt lielāks, nekā liecina statistika.

Pandēmijas sākuma fāzēs epidemioloģiskās modelēšanas, klīniskās diagnozes un ārstēšanas efektivitātes datu bieži vien ir maz. Sākotnējās fāzes stratēģijas ietver pārbaužu un ziņošanas, saziņas palielināšanu un mēģinājumus sagatavot paredzētās iespējas vakcīnai, testēšanai un ārstēšanai. Pēc tam ikviens neatkarīgi no tā, vai tas ir apzināts vai nē, veic individuālu riska novērtējumu, pamatojoties uz izpratni par riska nopietnību, uztverto spēju tikt galā ar draudiem un draudu sekām. Mūsdienu sabiedrībā šos uzskatus stiprina vai vājina sociālo mediju un informācijas avotu uzturs.

Covid-19 testēšanas laika skala

COVID testi novērtēt koronavīrusa klātbūtni. Atkarībā no veida pārbaude pozitīvs rezultāts vai nu norāda, ka pacientam ir aktīva infekcija (ātrā molekulārā PCR tests vai laboratorijas antigēnu testi), vai arī viņam kādā brīdī ir bijusi infekcija (antivielu tests).  

Ja personai ir simptomi, kas atbilst COVID, un pozitīvs vīrusa antigēna tests, rīcība ir pamatota. Šī darbība būs vīrusa iznīcināšana un izplatības apturēšana. Taču, tā kā koronavīruss ir tik lipīgs, personas ar viegliem simptomiem un bez citiem pamatslimībām, Eksperti ieteiktu pieņemt pozitīvu testu un sevi karantīnā uz 10 dienām līdz divām nedēļām. [UPDATE: 2021. gada decembra beigās CDC saīsināja ieteicamo izolācijas periodu personām, kurām ir Covid, līdz 5 dienām, kam sekoja 5 dienu maskēšana apkārtējiem. Tiem, kuri ir pakļauti zināmiem vīrusa gadījumiem, CDC iesaka 5 dienu karantīnu plus 5 dienu maskēšana nevakcinētajiem. Vai arī 10 dienas maskēšanas, ja tiek vakcinēta un pastiprināta.] Vēl kas cits Eksperti iesaka ārstēt asimptomātiskas personas, ja viņiem ir pozitīvs COVID antigēna tests. (Pētījumitomēr liecina, ka asimptomātisku indivīdu inficētspēja ir vāja. Tomēr izaicinājums ir atšķirt asimptomātisku no presimptomātiskā, kas ir lipīgs.) Vīruss tiek nogalināts, ārstējot pacientu, ļaujot organisma aizsardzības sistēmai reaģēt un izolēt pacientu, kamēr tas ir lipīgs. Profilakse un agrīna iejaukšanās ir pandēmijas pārvarēšanas atslēga. Šis ir tagad pazīstamais, "izliekuma saplacināšana. "

Līknes saplacināšanaCīņā ar Ziku, sabiedrības veselības ieteikumi ietver piesardzības pasākumu veikšanu mājās, kas novērstu odu inkubāciju un augšanu – likvidējiet stāvošu ūdeni savā pagalmā, noņemiet potenciālos rezervuārus, piemēram, vecās riepas. Līdzīgi, ieteikumi izplatības samazināšanai koronavīrusa apkarošana ietver fizisku distancēšanos, maskas un paaugstinātu higiēnu, piemēram, roku mazgāšanu un drošu izlietoto salvešu iznīcināšanu.  

https://www.news-medical.net/health/How-does-the-COVID-19-Pandemic-Compare-to-Other-Pandemics.aspx

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8242848/ ("Ārējie faktori, piemēram, sociālie tīkli un informācijas avoti, var vai nu pastiprināt, vai mazināt riska uztveri.")

https://www.city-journal.org/how-rapid-result-antigen-tests-can-help-beat-covid-19

Pašreizējā COVID pandēmijā es neredzu mērķtiecīgu, uz datiem balstītu un mērķtiecīgu pieeju. Pat Panamā sabiedrības veselības pieeja Zikas pandēmijai nebija viennozīmīga. Bija nepraktiski – jo resursi ir ierobežoti – cīnīties ar odiem visās frontēs, un nebija iespējams likvidēt visus iespējamos pārnēsātājus. Tādējādi resursi tika veltīti tiem, kuriem ir visaugstākais risks, pamatojoties uz ģeogrāfiju un pamata apstākļiem.  

 

Covid-19 sabiedrības veselības un sociālie pasākumi

 

Covid-19 pandēmijas dēļ ir arī nepraktiski neļaut ikvienam saslimt. Mēs esam iemācījušies, ka ir lietderīgāk par prioritāti piešķirt sabiedrības veselības iejaukšanos visneaizsargātākajiem un iedzīvotājiem, kuriem ir visnabadzīgāko medicīnisko iznākumu risks. Ja mēs sekojam ekonomikai, mums ir dati, kas attaisno vairāk resursu un kontroles pasākumu atvēlēšanu: CDC Covid vadlīniju drošības plakāts

  • Augsta apdzīvotības blīvuma apgabali – gan ģeogrāfiski, gan situācijas – pilsētas, sabiedriskais transports un gaisa satiksme.
  • Iestādes, kurās ir cilvēki ar pamatslimībām, kas veicinātu nelabvēlīgus rezultātus, ja viņi inficētos ar koronavīrusu – slimnīcas, klīnikas
  • Personas ar lielāku mirstības risku, ja tās saslimst ar Covid-19, proti veciem cilvēkiem pansionātos, pensionāru kopienās.
  • Valstis ar klimatu, kas ir labvēlīgāks koronavīrusa replikācijai. PVO brīdina ka vīruss izplatās visos klimatiskajos apstākļos, taču ir sezonālas atšķirības, kas uzrāda tapas ziemas mēnešos
  • Personām ar simptomiem ir lielāks risks pārnēsāt slimību citiem. Pārbaude būtu jākoncentrē uz šo populāciju, un ātri jāveic pasākumi, lai izolētu un ārstētu.

https://www.uab.edu/news/youcanuse/item/11268-what-exactly-does-it-mean-to-flatten-the-curve-uab-expert-defines-coronavirus-terminology-for-everyday-life

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/Young_Mitigation_recommendations_and_resources_toolkit_01.pdf

 

Šķiet, ka PVO 2021. gada jūnija pagaidu ieteikumi sliecas šajā virzienā. Jaunie ieteikumi ietver sabiedrības veselības un sociālos pasākumus, kas “pielāgoti vietējam kontekstam”. PVO vadlīnijas nosaka, ka "[Sabiedrības veselības un sociālie] pasākumi jāīsteno zemākajā administratīvajā līmenī, kurā ir iespējams situācijas novērtējums, un tie ir jāpielāgo vietējiem apstākļiem un apstākļiem." Citiem vārdiem sakot, datu izvērtēšana visprecīzākajā pieejamajā līmenī un rīcība. Šī publikācija arī vēl vairāk sašaurina uzmanību “jaunā sadaļā par apsvērumiem par individualizētiem sabiedrības veselības pasākumiem, pamatojoties uz personas SARS-CoV-2 imunitātes statusu pēc vakcinācijas pret Covid-19 vai pagātnes inficēšanās”.

Vai COVID varētu sekot Zikas tendencēm?

 

Zikas gadījumu skaits ASV un teritorijās

 

Panama un vispasaules dati liecina par līdzīgas tendences Zika gadījumiem. The tipiska progresēšana ir tas, ka pandēmijas kļūst par epidēmijām, tad endēmijām ar periodiskiem uzliesmojumiem. Šodien mēs varam atskatīties uz Zikas pandēmiju. Es piedāvāju cerības vārdu. Ņemot vērā datus, pieredzi un laiku, koronavīruss, tāpat kā Zikas vīruss un visi vīrusi pirms tam, risinās savu gaitu.

Papildu lasīšana: Interesanti, bet vienkārši nederēja

 

Kā beidzās 5 no pasaulē sliktākajām pandēmijām no kanāla Vēsture

Īsa pandēmiju vēsture (pandēmijas visā vēsturē)

Kā beidzas pandēmijas? Vēsture liecina, ka slimības izzūd, bet gandrīz nekad nav pazudušas

Visbeidzot, vēl viens ierocis pret Covid 

Kā Poop sniedz mājienus par koronavīrusa izplatību

Patiesība aiz koronavīrusa izkārnījumu panikas

 

BI/AnalyticsUncategorized
Atbrīvojieties no saviem ieskatiem: Analytics pavasara tīrīšanas ceļvedis

Atbrīvojieties no saviem ieskatiem: Analytics pavasara tīrīšanas ceļvedis

Atbrīvojieties no jūsu ieskatiem Analīzes ceļvedis Pavasara tīrīšana Jaunais gads sākas ar sprādzienu; tiek izveidoti un rūpīgi pārbaudīti gada beigu pārskati, un pēc tam visi pieņem konsekventu darba grafiku. Tā kā dienas kļūst garākas un koki un ziedi zied,...

Lasīt vairāk